5 0 5 10 Chr 1

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0612)

speA(slr1312)

sds(slr0611)

fecE(slr1318)

psbA2(slr1311)

(slr1315)

(slr0613)

fecD(slr1317)

fecB(slr1319)

fecC(slr1316)

0

5000

10000

15000

20000

(sll1214) (sll0558)

(sll1213)

lig(sll1209) rfbD(sll1212)

10

5

0

−5

iutA(sll1206)

Chr 1

10

5

0

−5 pchR(slr1489) (slr1484)

20000

25000

30000

(sll1204) pchR(sll1205)

pcrR(sll1408) (sll1203)

fhuA(sll1409) (sll1202)

10

5

0

−5

35000

(sll1405) (sll1407)

fhuA(sll1406)

exbB(sll1404)

(slr1485)

(slr1488)

40000

Chr 1

10

5

0

−5 fecB(slr1491) fhuA(slr1490)

fecB(slr1492)

(slr1494)

(slr1495)

hypD(slr1498)

(slr1501)

(slr1493)

40000

45000

50000

(sll1400)

(ssl2733)

10

5

0

−5

psb13(sll1398) (sll1399)

(sll1401)

55000

60000

msrA(sll1394) (sll1397)

rfbD(sll1395) (sll1396)

glgA(sll1393) (sll1392)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1113) (slr1501)

(slr1117) (slr1114)

hofD(slr1120)

(slr1116)

rffM(slr1118)

(slr1119)

(ssr1853)

(slr1115)

60000

65000

70000

75000

(sll1061) (sll1064)

(sll1063)

(sll1062)

80000

dapB(sll1058) (sll1060)

(ssl2069)

purL(sll1056)

adk(sll1059) trx(sll1057)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 gpmB(slr1124) (slr1122)

gmk(slr1123)

(slr1128) crtX(slr1125)

(slr1127)

rne(slr1129)

me(slr0721) rhnB(slr1130)

80000

85000

90000

95000

100000

(sll1053) purL(sll1056)

(sll1054)

pnp(sll1043) (sll1052) cpcF(sll1051)

10

5

0

−5

(sll1049)

mutT(sll1045)

lepB(sll0716)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0723) me(slr0721)

(slr0722)

(slr0727)

sohA(slr0724) (slr0725)

100000

105000

110000

(slr0731) (slr0728)

(slr0730)

(slr0732)

(slr0729)

115000

120000

(sll0711) cysM(sll0712)

10

5

0

−5

(sll0702) (sll0710)

llaI.2(sll0709)

ksgA(sll0708)

nifS(sll0704)

(sll0703)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0734)

(slr0740)

xerC(slr0733)

psaD(slr0737)

crtE(slr0739)

nusA(slr0743)

trpE(slr0738)

120000

125000

10

5

0

−5

(sll0700)

dfr(sll0698)

infB(slr0744)

(slr0236)

(slr0742)

130000

(sll0699) (ssl1326)

glgX(slr0237)

phoU(slr0741)

(sll0696)

135000

140000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0238) glgX(slr0237)

(slr0241) cbiF(slr0239) (slr0240)

140000

(slr0245) bcp(slr0242)

(slr0251)

(slr0244)

(slr0249)

(slr0243)

145000

150000

psbM(sml0003) (ssl0426)

(sll0230)

ycf4(sll0226)

5

0

−5

psaK(ssr0390)

155000

(sll0225) (sll0228)

ppiB(sll0227)

10

(slr0252)

(slr0250)

160000

ndhB(sll0223) (sll0224)

(ssl0410)

phoA(sll0222) sgl0002(sgl0002)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0254)

ctpB(slr0257)

160000

165000

bcp(sll0221) ycf6(sml0004)

(slr1411)

(slr1413)

170000

175000

(sll0218) glmS(sll0220)

(sll0219)

atpA(sll1326) (sll0217)

(sll0216)

atpC(sll1327)

180000

atpG(sll1323)

atpD(sll1325) atpF(sll1324)

10

5

0

−5

(slr1414)

atp1(sll1321) atpI(sll1322)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1415) (slr1414)

(slr1094) morR(slr1416)

(slr1098)

folK(slr1093)

(slr1095)

(slr1417)

180000

phdD(slr1096)

185000

190000

5

0

−5

(sll1041)

(sll1040)

(sll1039)

(slr1101) (slr1100)

(slr1102)

ubiX(slr1099)

195000

(sll1318) (sll1319)

10

(slr1097)

200000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1107) (slr1103)

200000

(slr1104)

fus(slr1105)

phb(slr1106)

205000

210000

215000

ccmM(sll1031)

(ssl2009) (sll1037)

(sll1033)

(sll1036) upp(sll1035)

10

5

0

−5

220000

ccmN(sll1032)

ccmK(sll1028) ccmL(sll1030) ccmK(sll1029)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1110) ank(slr1109)

(slr1773) (slr1772)

(slr1778)

(ssr2972)

(slr1776)

chlD(slr1777)

pdxJ(slr1779)

(slr1774)

220000

225000

(slr1780)

230000

235000

240000

(sll1682) gltD(sll1027)

10

5

0

−5

(sll1686)

ycf10(sll1685)

cad(sll1683)

(sll1681)

Chr 1

10

5

0

−5 bvdR(slr1784)

(slr1789)

(slr1783)

(slr1787)

(slr1788)

(slr1790) cysH(slr1791)

240000

245000

(sll1680) (sll1681)

hhoA(sll1679)

250000

5

0

−5

260000

(sll1677) (sll1678)

aroK(sll1669) malQ(sll1676)

(sll1673) (sll1675)

10

255000

(sll1672)

(sll1671)

hrcA(sll1670)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr2998) talB(slr1793)

(slr1794)

(ssr3000)

(slr1796)

pleD(slr1798)

(slr1799)

(slr1800)

msrA(slr1795)

260000

265000

270000

dnaJ(sll1666) aroK(sll1669)

mom72(sll1667)

275000

(sll1660)

(sll1664) pheA(sll1662)

10

5

0

−5

(sll1659)

(sll1663) (sll1665)

280000

(sll1658)

(sll1656)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1290)

ycf19(ssr2142)

icd(slr1289)

280000

5

0

−5

sufA(slr1295)

(slr1298)

290000

(sll1652)

(sll1654) gerCb(sll1653)

10

(slr1293)

285000

birA(sll1655) (sll1656)

ndhD2(slr1291)

295000

(ssl2384) (sll1201)

(sll1200)

(slr1299)

300000

(sll1193) psbU(sll1194)

trmD(sll1198) pfkA(sll1196)

Chr 1

10

5

0

−5 ubiH(slr1300)

(slr1303)

(slr1299)

(ssr2153)

rpl28(ssr1604)

(slr1302)

(slr1305)

(slr1306)

(slr1307)

(slr0962)

(slr1301)

300000

305000

310000

(sll1191) (sll1192)

315000

320000

lgt(sll1187) glcE(sll1189)

(sll1188)

(sll1186)

ho1(sll1184)

hemF(sll1185)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 dnaN(slr0965) (slr0962)

sir(slr0963)

(slr0964)

trpA(slr0966)

cbiH(slr0969)

(slr0971)

(slr0967)

320000

325000

330000

335000

(sll0938) (sll0943)

(sll0939)

5

0

−5

(sll0931)

(sll0933) (ssl1792)

ccmA(sll0934) (sll0936)

10

340000

(sll0932) rps15(ssl1784)

metX(sll0927)

(sll0930) apcD(sll0928)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0975)

(slr0980)

infC(slr0974)

(slr0976)

(slr0978) (slr0977)

340000

345000

(sll0926) metX(sll0927)

10

5

0

−5

350000

epsB(sll0923) (sll0925)

(sll0924)

(sll0922)

rfbF(slr0983) rfbB(slr0982)

(slr0981)

(slr1610) rfbC(slr0985)

rfbG(slr0984)

355000

(slr1614) (slr1611)

(slr1613)

(slr1612)

360000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1616) rfbE(slr1615)

(slr1062) (slr1617)

(slr1619) (slr1618)

360000

10

5

0

−5

(slr1066) (slr1063)

(slr1065) rfbU(slr1064)

365000

(slr1069) galE(slr1067) (slr1068)

370000

(slr1073)

(slr1070)

yefA(slr1072) (slr1071)

375000

(slr1074) (slr1075)

380000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1077) (slr1076)

galE(slr1078)

(ssr1765) (ssr1766)

380000

(slr1081) (ssr1768)

(slr1084) (slr1083)

(slr1082)

385000

hliA(ssr1789) (slr1085)

(slr1090) (slr1087)

390000

395000

400000

(ssl1972) (sll1025)

pyrC(sll1018) (sll1024)

(sll1022) sucC(sll1023)

10

5

0

−5

(sll1021)

(sll1020)

HAGH1(sll1019)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0670)

(slr0678)

(slr1400)

cysC(slr0676) exbB(slr0677)

400000

405000

410000

415000

amt2(sll1017) pyrC(sll1018)

10

5

0

−5

nucH(sll0656)

(sll0654)

(slr0681)

fmu_Ffmv(slr0679) (slr0680)

420000

Chr 1

10

5

0

−5 hisD(slr0682)

(ssr1155)

(slr0681)

(slr0686)

420000

425000

lim(sll0648) (sll0649)

10

5

0

−5

(slr0688)

430000

(sll0647)

(sll0650) (sll0651)

pleD(slr0687)

435000

(slr0689)

440000

ureG(sll0643) cyaA(sll0646)

(sll0644) (sll0645)

(sll0641)

Sac1(sll0640)

(sll0639)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1590) ycf45(slr0692)

(slr0695)

(slr1594) (slr1591)

(slr1593)

(slr1595)

pxcA(slr1596)

(slr1597)

(slr1592)

440000

445000

450000

455000

460000

btpA(sll0634) (sll0639)

10

5

0

−5

(sll0638)

thiE(sll0635)

(sll1516)

(sll1515)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1600) (slr1597)

lipA(slr1598)

(slr1599)

(ssr2699) (slr1601)

(slr1603)

ftsH(slr1604)

psaM(smr0005)

460000

465000

ccsA(sll1513) hsp17(sll1514)

(sll1512)

5

0

−5

(sll1507)

(sll1510) lpxC(sll1508)

(sll1511) ycf20(sll1509)

10

470000

475000

480000

(ssl2920) vapC(ssl2923) vapB(ssl2922)

(sll1503) (sll1504)

gltB(sll1502)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr2711)

(slr1042)

(ssr2708)

(slr1609)

(slr1041)

gdhB(slr1608)

480000

10

5

0

−5

(slr1045)

pleD(slr1047)

(slr1048)

mcpA(slr1044)

485000

490000

(sll1500) gltB(sll1502)

(slr1046)

(slr1043)

cbiA(sll1501)

495000

500000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1050) (slr1048)

rps32(ssr1736)

(slr1053) (slr1052)

chlH(slr1055)

(slr1056)

envM(slr1051)

500000

505000

510000

515000

520000

(sll1005) (sll1011)

10

5

0

−5

frpC(sll1009)

(sll1006)

(sll1004)

(sll1003)

Chr 1

10

5

0

−5 glnA(slr1756) (slr1753)

520000

525000

(ssl1922) (ssl1923) (ssl1920)

10

5

0

−5

gpsA(slr1755)

530000

ytfC(slr1761) (slr1759)

535000

(slr1760)

540000

(ssl1918) (sll1001)

(sll1647)

(sll1643)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1763) (slr1762)

(slr1767) capA(slr1764)

(slr1771)

(ssr2962)

(slr1768)

(slr1847)

(slr1770)

(ssr3122) (slr1846)

540000

545000

550000

ureD(sll1639) (sll1642)

gad(sll1641)

(sll1640)

(sll1638)

5

0

−5

merA(slr1849)

555000

560000

ureC(sll1750)

psbK(sml0005) fbp(sll1636)

(sll1751)

(sll1635) (sll1752)

10

hisD(slr1848)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr3129)

(slr2034) psbL(smr0007)

(slr1851)

ycf23(slr2032)

rub(slr2033)

psbE(ssr3451) psbJ(smr0008)

560000

565000

(ssr3452)

proB(slr2035)

570000

(slr2036)

(slr2038)

divK(slr2041)

(slr2037)

575000

580000

(sll1749) ureC(sll1750)

10

5

0

−5

(sll1946)

(sll1945)

(sll1942)

gyrA(sll1941)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr2042)

(slr2044)

divK(slr2041)

(ssr3465)

zntC(slr2043)

(slr2048) (slr2045)

(slr2046)

phoH(slr2047)

(slr2049)

(ssr3467)

580000

585000

(slr2052)

590000

595000

600000

(sll1939) (sll1940)

dnaJ(sll1933) (sll1938) fur(sll1937)

10

5

0

−5

(slr2053)

cpcG(slr2051)

(sll1934)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1907) (slr1906)

amiA(slr1910) (slr1908)

(slr1909)

(slr1914)

(slr1911)

(slr1913)

(slr1915)

(slr1912)

600000

605000

610000

dnaK(sll1932) dnaJ(sll1933)

10

5

0

−5

(slr1916)

615000

620000

comEc(sll1929) gylA(sll1931)

(sll1930)

(sll1834) (sll1837)

(sll1835)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1917) (slr1916)

(ssr1698) (slr1918)

(slr1919)

620000

625000

(slr1920)

(slr1019)

630000

635000

(sll1832) ftsI(sll1833)

5

0

−5

640000

(ssl1911) glcF(sll1831)

(sll0998) (sll1830)

10

sqdB(slr1020)

(sll0994) (sll0997)

(sll0995) (sll0996)

(sll0993)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1023) argD(slr1022)

tyrS(slr1031) (slr1025)

(slr1028)

chlI(slr1030)

(slr1024)

640000

645000

(sll0990) (sll0993)

10

5

0

−5

(sll0992)

650000

655000

660000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1032) tyrS(slr1031)

(slr1035) (slr1033)

(slr1376)

(slr1034)

(slr1037)

(slr1039)

tyrS(ssr1720)

660000

665000

670000

(sll0984) (sll0985)

0

−5

(ssr2315)

675000

680000

(sll0980) (sll0983)

(sll0981) (sll0982)

5

(slr1383) cydB(slr1380)

lepB(slr1377)

(sll0986)

10

cydA(slr1379) (slr1378)

(sll1300)

clcD(sll1298) ackA(sll1299)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr2317) (slr1383)

(ssr2318)

feoB(slr1392)

(slr1385)

ftsH(slr1390)

(slr1384)

(slr1391)

680000

685000

690000

(ssl2559) pobA(sll1297)

10

5

0

−5

(ssr2333)

695000

(sll1292) (sll1296)

pilJ(sll1294)

(sll1293)

(sll1289) (sll1291)

rnb(sll1290)

700000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1396) feoB(slr1392)

(slr1393)

(slr1394)

(slr1395)

(slr1397)

(slr1699) (slr1398)

700000

705000

710000

715000

lig(sll1583)

(sll1284) hliA(ssl2542)

(sll1286)

(sll1584)

(sll1285) spoIID(sll1283)

10

5

0

−5

720000

(sll1582)

gumB(sll1581)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1702)

(slr1704)

(ssr2843)

(slr1708)

(ssr2848)

aspA(slr1705)

serS(slr1703)

720000

dfrA(slr1706)

725000

730000

cpcD(ssl3093)

cpcA(sll1578) cpcC(sll1579)

10

5

0

−5

735000

cpcB(sll1577)

cpcC(sll1580) gumB(sll1581)

(ssr2857)

740000

(sll1573) (sll1575)

dnaE(sll1572) (sll1574)

(sll1570) (sll1571)

Chr 1

10

5

0

−5 ndhD(slr2007) mrcB(slr1710)

(slr2005)

(slr2006)

(ssr3409) (slr2008)

(slr2010) ndhF(slr2009)

740000

745000

750000

(slr2013) (slr2012)

(slr2015)

(ssr3410)

755000

(sll1926) (sll1568)

10

5

0

−5

(sll1927)

(sll1925)

(slr2017)

(slr2018)

(slr2016)

(sll1924)

760000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr2024) (slr2018)

(slr2019)

(slr2027)

fabD(slr2023)

folP(slr2026) (slr2025)

760000

765000

770000

775000

(sll1912)

(sll1916) (sll1921)

(sll1920)

(sll1913)

hemN(sll1917) (sll1915)

10

5

0

−5

780000

(ssl3615) (sll1911)

zam(sll1910)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1134) (slr2030)

(slr2031)

argH(slr1133)

ctaD(slr1137) (slr1135)

ctaC(slr1136)

(slr1140) ctaE(slr1138) trxA(slr1139)

780000

785000

790000

795000

800000

(sll1081) (sll1084)

nrtD(sll1082)

(sll1080)

(sll1078)

hypB(sll1079)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1143)

(slr1148)

(slr1142)

gltS(slr1145)

(slr1147)

(slr1149) (slr1150)

800000

805000

810000

815000

820000

(sll1071) speB(sll1077)

10

5

0

−5

ziaA(sll1076)

leuS(sll1074)

(sll1072)

tktA(sll1070)

Chr 1

10

5

0

−5 bfr(slr1890)

820000

825000

acp(ssl2084) fabF(sll1069)

(ssl3451) (sll1068)

10

5

0

−5

(sll1825)

830000

rpl31(ssl3445) (sll1824) purA(sll1823)

rps9(sll1822)

rps13(sll1816) adk(sll1815)

rpl17(sll1819) truA(sll1820)

(ssl3446)

835000

rps11(sll1817) rpoA(sll1818)

rpl36(sml0006)

rps5(sll1812)

secY(sll1814) rpl15(sll1813)

840000

rps17(ssl3437) rps3(sll1804)

rps8(sll1809)

rpl6(sll1810)

rpl14(sll1806) rpl5(sll1808)

rpl29(ssl3436)

rpl22(sll1803) rps19(ssl3432)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1896) (slr1894)

(slr1895)

(slr1900) srrA(slr1897)

argB(slr1898)

840000

845000

rpl3(sll1799) rpl23(sll1801)

10

5

0

−5

(slr1902) (slr1901)

850000

ycf21(sll1797)

rpl2(sll1802) rps19(ssl3432)

(slr1903)

ureF(slr1899)

855000

860000

(sll1791) petJ(sll1796)

(sll1792)

rpoC2(sll1789)

rpoB(sll1787)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1195) (slr1194)

(slr1198) (slr1196)

(ssr2009) (slr1197)

860000

865000

870000

875000

880000

rps20(ssl2233) (sll1786)

10

5

0

−5

(sll1124)

(sll1123)

(sll1121)

(sll1120)

(sll1119)

(sll1118)

Chr 1

10

5

0

−5 mutL(slr1199) (slr1198)

(slr1203) livH(slr1200) (slr1201)

880000

10

5

0

−5

(slr1206)

lacF(slr1202)

(slr1205)

(slr1209) (slr1207)

htrA(slr1204)

885000

(slr1208)

(slr1210)

(slr1213) cobN(slr1211)

ETR1(slr1212)

(ssr2016)

890000

895000

900000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1215) (slr1213)

(slr1214)

(slr2071) mgtE(slr1216)

groES(slr2075)

(slr2070)

ilvA(slr2072)

manA(slr2074)

groEL(slr2076)

(slr2077)

(slr2073)

900000

905000

910000

915000

pmgA(sll1968) aroQ(sll1112)

10

5

0

−5

(sll1971)

(sll1969)

(sll1967)

(sll1965)

920000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1827) (slr2078)

phbC(slr1830)

(slr1826)

petF(slr1828) (slr1829)

920000

925000

aroC(sll1747) (ssl3712)

rpl1(sll1744)

rpl12(sll1746) rpl10(sll1745)

10

5

0

−5

930000

secE(ssl3335)

rpl11(sll1743) nusG(sll1742)

935000

(sll1738) (sll1739)

(sll1737)

940000

(sll1735) (sll1736)

(sll1734)

ndhF(sll1732) ndhD3(sll1733)

Chr 1

10

5

0

−5 ccmK(slr1839) psaA(slr1834)

psaB(slr1835)

(slr1837)

ccmK(slr1838)

(slr1841) (slr1840)

940000

945000

950000

(sll1730) ndhF(sll1732)

955000

icsA(sll1724) (sll1726)

(sll1725)

(sll1723)

pdhB(sll1721) (sll1722)

10

5

0

−5

960000

Chr 1

10

5

0

−5 cysK(slr1842)

recQ(slr1536) zwf(slr1843)

uvrA(slr1844)

(slr1535)

(slr1541) (slr1537)

(slr1540)

(slr1542)

cbiD(slr1538)

960000

965000

970000

(sll1716) (sll1717)

hisC(sll1713) (sll1715) (sll1714)

10

5

0

−5

975000

(sll1712) (sll1469)

980000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1543)

rpoE(slr1545)

(slr1542)

(ssr2595) (slr1544)

980000

(ssr2611)

(slr1546)

def(slr1549) (slr1547)

985000

990000

(ssl2823) bhy(sll1468)

(sll1466)

995000

5

0

−5

1000000

hypE(sll1462) (sll1464)

ftsH(sll1463)

(sll1456)

(sll1461)

rfbJ(sll1457) (sll1459)

10

(slr1552) lysS(slr1550)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1752) (slr1552)

(slr1748)

prc(slr1751)

(slr1218)

(slr1220)

ureE(slr1219)

1000000

1005000

1010000

nrtD(sll1453) (sll1455)

narB(sll1454)

5

0

−5

1020000

(sll1634) nrtC(sll1452)

nrtA(sll1450) nrtB(sll1451)

10

1015000

repA(ssl3177) ftsZ(sll1633)

(sll1632)

(sll1144)

Chr 1

10

5

0

−5 malK(slr1224) (slr1220)

(slr1222)

sulA(slr1223)

(slr1229) pknA(slr1225)

IAP75(slr1227)

prfC(slr1228)

(slr1230)

(slr1232)

purC(slr1226)

1020000

1025000

1030000

1035000

1040000

(sll1142) uvrD(sll1143)

10

5

0

−5

(sll1138)

(sll1135)

Chr 1

10

5

0

−5 frdA(slr1233) (ssr2047)

(slr1235)

grxC(ssr2061)

bchB(ssr2049)

codA(slr1237)

(ssr2060)

(slr1234)

1040000

1045000

menB(sll1127)

(sll1130) todF(sll1129)

0

−5

1055000

(ssl2245) (sll1131)

pntB(slr1434) (ssr2067)

(slr1241)

1050000

(sll1132)

5

pntA(slr1239)

gshB(slr1238)

(ssl2250)

10

(slr1240) (ssr2062)

pmbA(slr1435) (slr1436)

1060000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1437)

pknA(slr1443)

(slr1436)

(ssr2406)

(slr1440)

(slr1441)

(slr1442)

(slr1438)

1060000

1065000

ileS(sll1362)

10

5

0

−5

1070000

dnaX(sll1360)

(sll1359)

1075000

(sll1358)

glgP(sll1356)

1080000

(sll1355)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1444) pknA(slr1443)

(slr1449) (ssr2422)

(slr1357)

cscK(slr1448)

rps1(slr1356) (slr1450)

1080000

1085000

1090000

1095000

cbbZp(sll1349) recJ(sll1354)

(sll1353)

(sll1352)

(sll1350)

ycf9(sll1281)

(sll1348) ribH(sll1282)

10

5

0

−5

1100000

(sll1280)

recF(sll1277)

Chr 1

10

5

0

−5 bioB(slr1364) (slr1362)

(slr1363)

cbiT(slr1368)

bioY(slr1365)

glgP(slr1367)

lspA(slr1366)

1100000

1105000

1110000

(sll1276) recF(sll1277)

1115000

(sll1272) pykF(sll1275)

(sll1274)

(sll1273)

(sll1271)

(ssl2501) glnH_FglnP(sll1270)

10

5

0

−5

1120000

Chr 1

10

5

0

−5 cdsA(slr1369)

(ssr1480)

cbiT(slr1368)

mscL(slr0875)

(slr0876)

(slr0880) (slr0877)

gcvH(slr0879) (slr0878)

1120000

1125000

1130000

1135000

ruvA(sll0876) (sll1268)

10

5

0

−5

(sll1267)

(sll1265)

(sll0877)

(sll0875)

1140000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0885) (slr0880)

(slr0881)

(slr0882)

psr(slr0883)

(slr0888)

gap1(slr0884)

fabG(slr0886)

(slr0890) (slr0889)

(slr0887)

1140000

1145000

1150000

(sll0871) (sll0872)

5

0

−5

1155000

1160000

lipA(sll0868)

(ssl1633) napC(sll0873)

10

amiA(slr0891) (ssr1499)

aat(sll0869)

(sll0867)

uvrC(sll0865)

Chr 1

10

5

0

−5 amiA(slr0891)

psbN(smr0009)

1160000

1165000

(sll0863) (sll0864)

5

0

−5

1170000

petA(sll1317) (sll0862)

(sll0860) (sll0861)

10

(slr1403)

1175000

1180000

(ssl2595)

petC(sll1316) psbH(ssl2598)

(sll1315)

(sll1308) dctP(sll1314)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1407) (slr1406)

(slr1853) (slr1409)

(slr1852) (slr1410)

1180000

1185000

1190000

(sll1307)

(sll1784) (sll1305)

(sll1785) (sll1304)

10

5

0

−5

(slr1861) glgX(slr1857)

(slr1854)

(sll1306) (sll1308)

(slr1856) (slr1855)

(sll1783)

ICFG(slr1860)

(slr1862)

(slr1859)

1195000

1200000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1864) (slr1862)

(slr1863)

(slr1865)

trpD(slr1867)

(slr1869)

(slr1870)

(slr1871)

(slr1866)

1200000

1205000

1210000

1215000

1220000

(sll1775) (sll1780)

10

5

0

−5

deoC(sll1776)

(sll1771) (sll1774)

(sll1773)

mutS(sll1772)

Chr 1

10

5

0

−5 exoD(slr1875) ddlA(slr1874)

livF(slr1881) (slr1876)

cpcE(slr1878)

cbiL(slr1879)

(slr1880)

(ssr3184)

hpcE(slr1877)

1220000

1225000

1230000

rps6(sll1767)

(ssl3383) (sll1771)

(sll1770)

(sll1769) (ssl3382)

10

5

0

−5

1235000

(sll1768)

(ssl3379)

(sll1764) aslB(sll1766) (sll1765)

1240000

thrB(sll1760)

(sll1763)

(sll1761) (sll1762)

(sll1758)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1882) livF(slr1881)

(slr1885) (ssr3188)

(slr1888)

(ssr3189) trpS(slr1884)

1240000

hemC(slr1887)

1245000

1250000

(ssl3364) (sll1757)

pta(slr2132)

(slr1886)

1255000

sfsA(sll2014) (sll1755)

(sll2015)

murD(sll2010)

(sll2013)

(sll2011) rpoD(sll2012)

10

5

0

−5

1260000

(sll2009)

Chr 1

10

5

0

−5 gcpE(slr2136)

mbpA(slr1803)

hupE(slr2135)

(slr2141)

1260000

1265000

(sll2007)

(slr2144)

1270000

(sll2006) (sll2008)

cefD(slr2143)

1275000

ycf32(sml0007) gyrB(sll2005)

(ssl3829)

(slr1805)

1280000

gdh(sll1709) (sll2003)

(sll2002)

(sll1710)

(ssl3291) (sll1708)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 hemA(slr1808) (slr1807)

(slr1812) (slr1809)

(slr1811)

(slr1815) (slr1814)

(slr1816)

(slr1818)

(slr1813)

1280000

1285000

1290000

sppA(sll1703) csgA(sll1704)

(sll1698) (sll1702)

(sll1699)

1295000

1300000

hofG(sll1695) (sll1697)

(sll1693)

(sll1696) hofG(sll1694)

10

5

0

−5

(sll1692)

Chr 1

10

5

0

−5 nth(slr1822) (slr1819)

(slr1820)

1300000

(slr1821)

1305000

5

0

−5

1315000

(sll1687)

1320000

sdhB(sll1625)

(sll1630) rpoD(sll1689) thrC(sll1688)

10

opcA(slr1734)

1310000

(sll1691) (sll1692)

(slr1735) (slr1732)

(sll1628)

(sll1631) phr(sll1629)

lexA(sll1626)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1737)

ndh(slr1743)

(slr1736)

(slr1738)

(slr1740)

(slr1742)

(slr1739)

1320000

1325000

(sll1624) sdhB(sll1625)

10

5

0

−5

(sll1621)

(slr1747) murI(slr1746)

1330000

(sll1620) (sll1623)

(slr0852) amiA(slr1744)

(sll1618)

1335000

ndh(slr0851)

phr(slr0854) rimI(slr0853)

1340000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0857) phr(slr0854)

(slr0856)

purT(slr0861)

(slr0863) lmbP(slr0862)

1340000

1345000

(sll0854)

(sll0857) (sll0858) rpoE(sll0856)

10

5

0

−5

1350000

(sll0855)

1355000

1360000

psbD(sll0849) (sll0853)

psbC(sll0851)

(sll0843) dnaA(sll0848)

(sll0846) (sll0847)

(sll0844)

nplT(sll0842)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0868) (slr0864)

(slr0865)

(slr0867)

1360000

1365000

(slr0871) (slr0869)

(slr0870)

(slr0872)

(slr1243)

1370000

1375000

1380000

pyrF(sll0838) nplT(sll0842)

10

5

0

−5

(sll0839)

(sll0837)

(sll1163) mutS(sll1165)

(sll1164)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr2078)

pstC(slr1248)

(slr1245)

pstS(slr1247) (slr1246)

1380000

(sll1159) (sll1160)

10

5

0

−5

1395000

(sll1155) (sll1157) (sll1156)

pds(slr1254) (slr1253)

1390000

(sll1158) (sll1161)

pys(slr1255) (ssr2087)

pstB(slr1250)

1385000

(sll1162) (sll1163)

cyp(slr1251)

pstA(slr1249)

1400000

(sll1151) norA(sll1154)

dcoH(ssl2296)

(sll1150)

Chr 1

10

5

0

−5 ureA(slr1256) pys(slr1255)

(slr1260) (slr1257)

(slr1259) (slr1258)

1400000

(slr1263)

(slr2059)

(slr1262)

apqZ(slr2057)

1405000

1410000

1415000

(sll1961)

5

0

−5

1420000

arsA(sll1957) hisC(sll1958)

suhB(sll1959)

10

(slr2060)

(slr1261)

(sll1960) (sll1147)

topA(slr2058)

(sll1956) (sll1954)

Chr 1

10

5

0

−5 apcB(slr1986) (slr2062)

cyaA(slr1991)

apcA(slr2067)

(slr1990)

apcC(ssr3383)

1420000

1425000

1435000

5

0

−5

1440000

(sll1949) (sll1951)

(sll1950)

prmA(sll1909)

(sll1906) serA(sll1908)

10

fabG(slr1994) thl(slr1993)

1430000

(ssl3692) (sll1954)

(slr1992)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1999) (slr1998)

(slr2004)

(slr2000)

(slr2002)

(slr2003)

(ssr3402)

(slr1712)

(slr2001)

1440000

(sll1906)

10

5

0

−5

1445000

(sll1905)

1450000

1455000

(sll1902)

1460000

thdF(sll1615)

pma1(sll1614)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1716)

drgA(slr1719)

(slr1715)

(slr1717)

(slr1718)

lacG(slr1723) aspS(slr1720)

guaB(slr1722)

(slr1724)

(slr1721)

1460000

1465000

1470000

folC(sll1612) (sll1613)

10

5

0

−5

1475000

1480000

fabZ(sll1605) (sll1611)

(sll1609)

(sll1608)

(sll1606)

(sll1601)

(ssl3127)

Chr 1

10

5

0

−5 kdpB(slr1729) (ssr2898)

(slr1726)

(slr1727)

kdpA(slr1728)

kdpD(slr1731) (ssr2912) kdpC(slr1730)

1480000

1485000

mntC(sll1598) mntA(sll1599)

10

5

0

−5

1495000

(sll1596)

mntB(sll1600) (ssl3127)

1490000

(sll1590) (sll1595)

rbcR(sll1594)

(sll1592)

1500000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0262) cobA(slr0260)

ndhH(slr0261)

(slr0265) (slr0264)

(slr0267)

(slr0263)

1500000

1505000

1510000

(ssl0467) (sll1586)

(sll0254)

(sll0253)

1515000

1520000

isiB(sll0248)

dfp(sll0250) (sll0249)

10

5

0

−5

isiA(sll0247)

(ssl0461) (sll0252)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0270) (slr0269)

(ssr3532) (slr0271)

(slr0273)

(slr2079)

(slr0272)

1520000

1525000

1530000

1535000

galE(sll0244) (sll0245)

(sll0240) nblA(ssl0453) nblA(ssl0452)

10

5

0

−5

tyrA(slr2081) (slr2080)

(sll0243)

(sll0242)

(sll0241)

1540000

(ssl0438) (sll0238)

(sll0237)

(sll0236)

Chr 1

10

5

0

−5 ctaD(slr2082) tyrA(slr2081)

ilvG(slr2088) ctaE(slr2083)

ycf44(slr2087)

shc(slr2089)

(slr2092)

(slr2084)

1540000

1545000

1550000

1555000

katG(sll1987) (sll1988)

(sll1983) (sll1985) (sll1984)

10

5

0

−5

1560000

(ssl3769) (sll1982)

ilvB(sll1981)

trxA(sll1980) (sll1979)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr2095) glpX(slr2094)

(slr2100) (slr2098)

(slr2099)

(slr2101)

(slr2096)

1560000

(slr2103)

(slr2104)

(slr2105)

ftsY(slr2102)

1565000

1570000

1575000

1580000

(sll1429) (sll1979)

10

5

0

−5

(sll1973)

apt(sll1430)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1508) (slr1503)

(slr1505)

(slr1506)

(slr1507)

ntpJ(slr1509)

fabH(slr1511) plsX(slr1510)

1580000

1585000

(sll1426)

(ssl2789) hhoB(sll1427)

(sll1429) (sll1428)

10

5

0

−5

1590000

1595000

1600000

ntcA(sll1423) proS(sll1425)

(sll1424)

(ssl2781)

(sll1418)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1513)

sodB(slr1516)

(slr1512)

(ssr2549)

(ssr2551) (slr1515)

1600000

1605000

menA(slr1518)

leuB(slr1517)

(slr1522)

hglK(slr1519)

(ssr2554)

1610000

hflX(slr1521)

(slr1523)

(slr1520)

(slr1524)

1615000

1620000

(sll1414) (sll1415)

lap(sll2001) (sll1411) (ssl2749)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr3571) (ssr3570)

(slr2111) kpsT(slr2108)

(slr2110)

kpsM(slr2107)

(slr2112)

1620000

1625000

(sll1998) (sll1999)

10

5

0

−5

(sll1997)

(slr2115) spsC(slr2114)

(slr2119) spsA(slr2116) (slr2117)

1630000

(slr2118)

(slr2123) (slr2120)

(slr2122) (slr2121)

1635000

(slr2124)

(slr2126)

(slr2127)

(slr2125)

1640000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr2128)

(ssr2194)

(slr2127)

aroB(slr2130)

1640000

(slr2131)

(slr1322)

1645000

1650000

hemB(sll1994) (sll1995)

5

0

−5

spoT(slr1325)

1655000

1660000

(sll1239) (sll1241) (sll1240)

10

(slr1324)

hemK(sll1237)

(sll1236)

ahcY(sll1234)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1327)

fabF(slr1332)

(ssr2201)

atpB(slr1329)

ymxG(slr1331)

(ssr2227)

atpE(slr1330)

1660000

1665000

1670000

1675000

(sll1232) (sll1233)

(sll1225)

mtfB(sll1231)

(sll1228) (sll1229)

10

5

0

−5

1680000

(sll1222) (sll1220)

hoxU(sll1223)

hoxH(sll1226) (ssl2420)

hoxF(sll1221)

Chr 1

10

5

0

−5 dacB(slr0804) (slr1334)

(ssr1375)

(slr0808) (slr0806)

gcp(slr0807)

(slr0813) (slr0810)

(slr0812)

rfbB(slr0809)

1680000

1685000

ycf39(sll1218) (sll1219)

(sll1217)

1690000

1695000

psaF(sll0819) psaJ(sml0008)

miaA(sll0817) (sll0818) (ssl1520)

10

5

0

−5

1700000

ctaC(sll0813) (sll0816)

(sll0814) (sll0815)

(sll0812)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0815)

(slr0818)

ndhL(ssr1386)

entC(slr0817)

(slr0816)

1705000

0

−5

1710000

(slr0822)

ycf3(slr0823)

1715000

(ssl1507)

(sll0811) (sll0809)

5

(slr0821)

1720000

(sll0808)

(sll0810)

10

(slr0820) (ssr1391)

1700000

(sll0812)

int(slr0819)

(sll0803) cfxE(sll0807)

(sll0804)

(sll1263)

(sll0802) (ssl1498)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1339) (slr1336)

(slr1338)

(slr1342)

(slr1343)

(slr1344)

(slr1340)

1720000

1725000

(sll1262) (sll1263)

5

0

−5

(sll1255)

(sll1258) (sll1256)

1735000

1740000

(sll1254)

(sll1257)

tsf(sll1261) rps2(sll1260)

10

1730000

pcnB(sll1253)

(sll1252)

(sll1251)

Chr 1

10

5

0

−5 cysE(slr1348) icfA(slr1347)

(slr1957) pgi(slr1349)

murF(slr1351)

(slr1353)

(slr1956)

(slr1958)

desA(slr1350)

1740000

1745000

1750000

rpl9(sll1244)

(ssl2471) (sll1247)

(sll1251) (sll1250)

10

5

0

−5

1755000

cytM(sll1245)

1760000

hypC(ssl3580) (sll1242)

(sll1898)

act(sll1900) ctaB(sll1899)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1964) (slr1959)

(slr1962)

1760000

(slr1963)

1765000

(slr1966)

1770000

(slr1969)

1775000

(ssl3573) (sll1897)

(slr1968)

1780000

(sll1892) (sll1895)

ribA(sll1894)

hisF(sll1893)

(sll1891) cobN(sll1890)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1970) (ssr3341)

(slr1978) (slr1971)

(slr1972)

1780000

(slr1974)

1785000

(slr1975)

1790000

1795000

(ssl3549) (sll1888)

10

5

0

−5

(slr1977)

argJ(sll1883) (sll1886)

(sll1885)

(sll1884)

1800000

(sll1879) (sll1882)

(sll1880)

(sll1878)

Chr 1

10

5

0

−5 trpE(slr1979) (slr1978)

(slr1983) (slr1980)

(slr1982)

1800000

1805000

1810000

ho2(sll1875) hemN(sll1876)

5

0

−5

1815000

1820000

cbaB(sll1869)

AT103(sll1874)

lytR(sll1872) (sll1873)

10

rps1(slr1984)

(sll1871)

(sll1870)

dnaG(sll1868) psbA3(sll1867)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1468) petG(smr0010)

(slr1467)

(slr1471) (slr1470)

(slr1472)

(slr1474)

pyrB(slr1476)

(slr1478)

rpl34(smr0011)

1820000

1825000

(sll1390) (sll1866)

(sll1388)

(ssl2717) (sll1389)

10

5

0

−5

1830000

1835000

suhB(sll1383) (sll1387)

(sll1384) (sll1386)

petF(sll1382)

1840000

(sll1380) (sll1381)

(sll1378)

(sll1376) (sll1377)

Chr 1

10

5

0

−5 mrdB(slr1267) rpoC1(slr1265)

1840000

1845000

1850000

(sll1373) (sll1376)

melB(sll1374)

5

0

−5

1855000

1860000

(sll1369) (sll1372)

rfbM(sll1370) (sll1371)

10

(slr1266)

petC(sll1182)

hlyB(sll1180) hlyD(sll1181)

(sll1178)

Chr 1

10

5

0

−5 rffM(slr1271) ggt(slr1269)

(slr1270)

pilM(slr1274) (slr1272) (slr1273)

1860000

1865000

ndhK(slr1280) (slr1275)

gspD(slr1277)

(slr1278)

ndhC(slr1279)

(slr1276)

(slr1283) (slr1282)

ndhJ(slr1281)

1870000

1875000

1880000

(sll1173) (sll1174)

10

5

0

−5

thrC(sll1172)

(sll1170)

(sll1169)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1287) (slr1285)

(ssr2130)

1880000

(slr1288)

(slr1529)

1885000

1890000

pbp(sll1167)

(sll1166)

5

0

−5

1900000

(sll1442)

(sll1446)

pyrG(sll1443) leuD(sll1444)

10

ffh(slr1531)

1895000

(sll1447) (sll1169)

(slr1530)

desB(sll1441)

(sll1439) pdxH(sll1440)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1534) ffh(slr1531)

(slr1533)

1900000

1905000

1910000

mrcA(sll1434) pet112(sll1435)

5

0

−5

1915000

hypB(sll1432)

(sll1436) (sll1437)

10

(slr1152)

(sll1433)

fus(sll1098)

(sll1102) (ssl2162) glnH(sll1104)

(sll1103)

1920000

tufA(sll1099) rps10(sll1101)

(sll1095) rps7(sll1097) rps12(sll1096)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1160)

(slr1166)

purD(slr1159)

(slr1161)

(slr1163)

nrdA(slr1164)

(slr1169)

met3(slr1165)

gldA(slr1167)

(slr1162)

1920000

(slr1168)

1925000

1930000

(sll1094) (sll1095)

rpiB(ssl2153)

1935000

5

0

−5

(slr1171)

1940000

(ssl2138) (ssl2148)

(sll1089)

(sll1092) (sll1091)

10

(slr1170)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr1951) (slr1173)

spoU(slr1673)

(slr1174)

(slr1670)

glpK(slr1672)

(slr1676)

(slr1674) hypA(slr1675)

1940000

1945000

1950000

(sll1087) (sll1089)

10

5

0

−5

1955000

rpl27(ssr2799) (slr1677)

(slr1679) rpl21(slr1678)

1960000

otsA(sll1566) (sll1086)

glpD(sll1085)

leuA(sll1564)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr2803)

(slr1682)

(ssr2802)

(slr1681)

(slr1687) (slr1683)

(ssr2806)

(slr1686)

(slr1684)

1960000

1965000

1970000

1975000

1980000

sucD(sll1557) leuA(sll1564)

10

5

0

−5

(sll1563)

(sll1562)

putA(sll1561)

(sll1560)

(sll1559)

(ssl3044)

(sll1558)

(sll1556)

Chr 1

10

5

0

−5 mutM(slr1689) psaE(ssr2831)

(slr1692) nadE(slr1691)

(slr1690)

1980000

nadC(slr0936) (slr1693)

pknA(slr1697)

(slr0935)

1985000

1990000

1995000

(sll1555) (sll1556)

10

5

0

−5

(slr0937)

(slr1694)

pheT(sll1553)

(sll0921)

ppc(sll0920)

2000000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0941) (slr0937)

(slr0938)

crtQ(slr0940)

(slr0945) (slr0942)

(slr0944) fda(slr0943)

2000000

2005000

(slr0948) (slr0947)

livH(slr0949)

arsC(slr0946)

2010000

(slr0950)

2015000

2020000

pqqE(sll0915) cbiC(sll0916)

10

5

0

−5

(sll0910) (sll0914)

(sll0913)

(sll0912)

(sll0911)

Chr 1

10

5

0

−5 fbp(slr0952) (slr0951)

(slr0954) (slr0953)

(slr0960) (slr0955)

(ssr1600)

2020000

cysS(slr0958)

(slr1623)

(slr0959)

(ssr2723)

ppa(slr1622)

(slr1627) (slr1624)

(slr1626)

(slr0957)

2025000

2030000

2035000

2040000

(sll0909) (sll0910)

10

5

0

−5

(sll1537) maf(sll0905)

(sll1541)

dpm1(sll1540)

bgl(sll1538)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1629) (slr1627)

(slr1636)

(slr1628)

(slr1634)

(slr1635)

(slr1638) smpB(slr1639)

2040000

2045000

(sll1534) moeB(sll1536)

10

5

0

−5

rfbP(sll1535)

2050000

2055000

2060000

(ssl2982) pilT(sll1533)

(sll1532)

(sll1531)

(sll1530)

(sll1528)

(sll1527)

Chr 1

10

5

0

−5 psbZ(slr1645) clpB(slr1641)

petH(slr1643)

(slr1644)

(ssr2754) (slr1647)

(slr1648)

(slr1649)

rnc(slr1646)

2060000

2065000

2070000

2075000

2080000

prk(sll1525) (sll1526)

10

5

0

−5

(ssl2971)

(sll1521) (sll1524)

pgsA(sll1522)

recN(sll1520)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr0759) (slr0442)

amiC(slr0447)

(ssr0756)

(slr0443)

aroA(slr0444)

(slr0445)

dnaX_and_dnaZ(slr0446)

(ssr0761)

2080000

2085000

2090000

2095000

(sll0426) (sll0428)

psbO(sll0427)

purB(sll0421) (sll0424)

(sll0422) (sll0423)

10

5

0

−5

2100000

(sll0418) ureB(sll0420) (sll0419)

Chr 1

10

5

0

−5 sms(slr0448) amiC(slr0447)

(slr0280)

2100000

2105000

2110000

(sll0272) (sll0274)

(sll0273)

nusB(sll0271)

2115000

2120000

(sll0269) priA(sll0270)

(sll0268)

(sll0265) (sll0267)

(sll0266)

(sll0264) (sll0263)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0285) (slr0284)

(slr0287) (slr0286)

(slr0392)

rps16(ssr0482)

(slr0291)

(slr0292)

gcvP(slr0293)

glnN(slr0288)

2120000

2125000

10

5

0

−5

pgk(slr0394) (slr0393)

2130000

desD_des6_(sll0262) (sll0263)

(slr0294)

2135000

2140000

(ssl0483) (sll0261)

(sll0260)

psbV(sll0258)

(sll0257)

(sll0364)

Chr 1

10

5

0

−5 ntcB(slr0395)

ycf39(slr0399)

pgk(slr0394)

(slr0397)

(ssr0657) (slr0400)

(slr0398)

2140000

2145000

(slr0402)

(slr0404)

pyrC(slr0406)

(slr0401)

(slr0407)

2150000

2155000

(sll0360) alaS(sll0362)

10

5

0

−5

(sll0361)

2160000

(sll0355) (sll0359)

glnB(ssl0707)

trpF(sll0356)

(sll0354)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0145) (slr0408)

(slr0142)

(slr0143)

(slr0144)

(slr0148) (slr0147)

(slr0146)

2160000

10

5

0

−5

2165000

2170000

2175000

2180000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0149) (slr0148)

(slr0157) (slr0151)

(slr0152)

clpB(slr0156)

petF(slr0150)

2180000

2185000

2190000

2195000

2200000

frr(sll0145) (sll0149)

(sll0148)

(sll0147)

(sll0146)

(ssl0259) pyrH(sll0144)

10

5

0

−5

(sll0142)

Chr 1

10

5

0

−5 gspF(slr0162) pilT(slr0161)

clpP(slr0165)

(slr1923)

clpP(slr0164)

(ssr0256)

pilC(slr0163)

2200000

(slr0166)

2205000

2210000

(slr1927) (slr1924)

(slr1926) cbiB(slr1925)

2215000

2220000

(sll0135) (sll0141)

10

5

0

−5

pepP(sll0136)

(ssl0242)

prfB(sll1865)

(sll1864)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1928) (slr1927)

(slr1932)

(slr1929)

(slr1935)

(slr1931)

rfbC(slr1933)

(slr1934)

(slr1936)

(slr1930)

2220000

2225000

2230000

(sll1860) (sll1861)

5

0

−5

(slr1939)

2235000

2240000

(sll1853)

(sll1862) (sll1863)

10

(slr1938)

(slr1937)

(sll1858)

xthA(sll1854)

(sll1851)

ndkR(sll1852)

(sll1849)

(sll1848)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr3300) (slr1939)

(slr1940)

dpm1(slr1943) (slr1942)

ycf47(ssr3307) (slr1944)

yibO(slr1945)

(slr0989)

(slr1946)

(slr1949)

(slr1950)

(ssr3304)

2240000

2245000

(sll1845)

10

5

0

−5

(slr1951)

(slr0990) (slr0992)

2250000

2255000

odhB(sll1841)

2260000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0325) nlpD(slr0993)

lipB(slr0994)

2260000

(slr0320)

2265000

Era(slr0321)

2270000

(slr0322)

ams1(slr0323)

2275000

(slr0324)

2280000

(ssl1807) lrtA(sll0947)

glgA(sll0945)

rpoD(sll0306) (sll0944)

10

5

0

−5

(sll0301)

Chr 1

10

5

0

−5 hitB(slr0327) (slr0326)

(slr0333) (slr0328)

ndhD(slr0331)

xylR(slr0329)

2280000

2285000

ribC(sll0300) (sll0301)

5

0

−5

apcE(slr0335)

(slr0337)

(slr0338)

2290000

2295000

2300000

(sll0293)

(ssl0564) (sll0298) (sll0297)

10

(ssr0536) (slr0334)

(sll0295)

(sll0296) psaC(ssl0563)

(sll0294)

Chr 1

10

5

0

−5 ycf37(slr0171) (slr0338)

(slr0168)

(slr0169) guaB(slr0172)

2300000

2305000

2310000

(sll0176) (sll0177)

5

0

−5

2320000

(sll0173)

(ssl0312)

(sll0174) (sll0175)

10

2315000

(sll0167) (sll0172)

dnaK(sll0170) gcvT(sll0171)

(sll0169)

(sll0168) hemD(sll0166)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0180)

umpS(slr0185)

(slr0179)

2320000

(slr0181)

2325000

(slr0184)

2330000

2335000

(ssl0296) (sll0163)

(sll0162)

(sll0161)

5

0

−5

2340000

(sll0156) (ssl0294)

glgB(sll0158) (sll0160)

10

leuA(slr0186)

(sll0157)

(sll0154)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0361) leuA(slr0186)

2340000

(slr0359)

(slr0360)

(slr0362)

(slr0363)

2345000

2350000

psbI(sml0001) (sll0350)

10

5

0

−5

(slr0364)

2355000

2360000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0374) (slr0366)

(slr0369)

gabD(slr0370)

(slr0373)

(slr0376)

(slr0378) (slr0377)

2360000

2365000

2370000

2375000

accD(sll0336) sphS(sll0337)

10

5

0

−5

(sll0335)

2380000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0380) (slr0378)

(slr0379)

(slr0384) (slr0381)

(slr0769)

(slr0383)

(slr0386)

(slr0388) nifS(slr0387)

2380000

2385000

2390000

chlB(slr0772) (slr0771)

(slr0773)

(slr0770)

2395000

2400000

glcP(sll0771)

(sll0328) fabG(sll0330)

(sll0772)

gnd(sll0329) (sll0327)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 secF(slr0775) secD(slr0774)

2400000

(slr0780)

lpxD(slr0776)

(slr0779)

2405000

2410000

livG(sll0764)

rpl35(ssl1426) glcP(sll0771)

rpl20(sll0767)

(sll0765)

radC(sll0766)

10

5

0

−5

psbT(smr0001)

2415000

(sll0761) (sll0763) (sll0762)

2420000

(sll0752)

(sll0755) (sll0759)

purF(sll0757)

folD(sll0753)

(sll0756) (sll0754)

ycf22(sll0751)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0784) (slr0782)

tpi(slr0783)

petD(slr0343) (slr0341)

rnc(slr0346)

petB(slr0342)

(slr0345)

(slr0347)

(slr0348)

rfbW(slr0344)

2420000

2425000

2430000

2435000

(sll0749) sarA(sll0750)

10

5

0

−5

2440000

(sll0319) (sll0325)

hypF(sll0322)

(sll0321)

rnd(sll0320)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0351) (slr0348)

(slr0356)

(slr0350)

(slr0352)

(slr0354)

(slr0355)

hisS(slr0357)

(slr0353)

2440000

(slr0358)

2445000

2450000

2455000

2460000

rps21(ssl0601) (sll0318)

10

5

0

−5

(sll0317)

(sll0315)

(sll0314)

(sll0312)

(sll0310)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0007) (slr0001)

(slr0006)

ctpA(slr0008) rbcL(slr0009)

2460000

2465000

2470000

(sll0309) (sll0310)

cbbA(sll0018) (sll0024)

(sll0022) (sll0023)

10

5

0

−5

2475000

(sll0021)

clpC(sll0020)

(sll0019)

hemL(sll0017) mltA(sll0016)

2480000

Chr 1

10

5

0

−5 rbcS(slr0012) rbcX(slr0011)

lpxB(slr0015) mgtC(slr0014)

(slr0016)

(slr0013)

fumC(slr0018)

(slr0019)

recG(slr0020)

murZ(slr0017)

2480000

2485000

2490000

2495000

2500000

(sll0007) (sll0012)

petF(ssl0020)

(sll0010)

(sll0005)

(sll0008) aspC(sll0006)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 sppA(slr0021)

(slr0217) guaA(slr0213)

cobU(slr0216) (slr0214)

2500000

glyS(slr0220)

(slr0222)

(ssr0349)

2505000

2510000

2515000

2520000

(sll0208) ponA(sll0002)

10

5

0

−5

(sll0210)

(sll0209)

gidA(sll0204) rfbA(sll0207)

(sll0205)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0230) (slr0222)

(slr0224)

2520000

(slr0226)

ftsH(slr0228)

2525000

2530000

(sll0198)

(sll0201) petE(sll0199)

10

5

0

−5

trxM(slr0233)

(slr0231)

(slr0232)

2535000

2540000

ycf43(sll0194)

(sll0200) gidA(sll0202)

mmsB(slr0229)

(sll0195)

BA000022.2:groEL−2:unknown_transcript_1(sll0416) (sll0192)

(sll0191)

Chr 1

10

5

0

−5 accB(slr0435) (slr0431)

efp(slr0434)

(slr0438)

(slr0439)

ccmK(slr0436)

2540000

2545000

(sll0415)

(ssl0787)

BA000022.2:groEL−2:unknown_transcript_1(sll0416) (sll0414)

10

5

0

−5

2550000

(sll0409)

(sll0413)

(sll0410) (sll0412)

2555000

2560000

(sll0405) (sll0408)

(sll0406)

aspC(sll0402) glcD(sll0404)

(ssl0769) (sll0403)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0049) (slr0440)

(slr0053)

ycf40(ssr0102)

icfA(slr0051)

(ssr0109)

(slr0050)

2560000

2565000

2570000

2575000

(sll0400) gltA(sll0401)

5

0

−5

2580000

(sll0066) (sll0072)

purU(sll0070) (sll0071)

10

chlG(slr0056)

dgkA(slr0054)

(sll0069)

(sll0068)

(sll0064)

gst(sll0067) ilvN(sll0065)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0059)

(slr0064)

(slr0058)

(slr0061)

gspE(slr0063)

(slr0060)

2580000

(slr0065)

(slr0067)

(slr0069)

ribG(slr0066)

2585000

2590000

2595000

2600000

(sll0062) (sll0064)

(sll0063)

(sll0060)

grpE(sll0057) dnaK(sll0058)

10

5

0

−5

(sll0055)

accC(sll0053)

Chr 1

10

5

0

−5 natA(slr0467) fmt(slr0070)

(slr0474) (slr0468)

ycf46(slr0480)

phy(slr0473)

(slr0476)

rps4(slr0469)

2600000

purN(slr0477)

2605000

2610000

(sll0462)

uvrB(sll0459) psbX(sml0002)

10

5

0

−5

(slr0482)

(slr0484)

(slr0483)

2615000

proA(sll0461) (sll0051)

(slr0479)

2620000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0487)

menE(slr0492) (slr0488)

(slr0491)

(slr0496)

rfbM(slr0493)

(slr0495)

(slr0489)

2620000

2625000

2630000

thrA(sll0455) (sll0456)

2635000

vapC(sll0690) pheS(sll0454) (sll0691)

10

5

0

−5

(sll0687)

(ssl1300)

(sll0688) (sll0689)

2640000

pstB(sll0684)

(sll0686)

pstC(sll0681)

pstB(sll0683) (sll0685)

pstA(sll0682)

Chr 1

10

5

0

−5 rps14(slr0628) (slr0719)

2640000

(slr0634) (slr0630)

thiG(slr0633)

2645000

2650000

pstS(sll0680) pstC(sll0681)

10

5

0

−5

(slr0637) (slr0635)

(slr0636)

2655000

2660000

(sll0614) sphX(sll0679)

im30(sll0617)

secA(sll0616)

(sll0615)

ruvB(sll0613)

glyQ(slr0638)

(sll0611)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0639) glyQ(slr0638)

dacB(slr0646) (slr0640)

(slr0642)

(slr0643)

(slr0644)

(slr0645)

metS(slr0649) (slr0650)

2660000

2665000

2670000

2675000

2680000

(sll0608) (sll0609)

10

5

0

−5

(sll0606)

menD(sll0603)

(sll0602)

(sll0601)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0416) (slr0650)

napA(slr0415)

2680000

2685000

(ssr0693) gyrA(slr0417)

(slr0418)

(ssr0692)

2690000

2695000

(sll0397) dgt(sll0398)

(sll0394) (sll0395)

10

5

0

−5

(sll0385)

2700000

(sll0381)

(sll0384)

(sll0396)

(slr0420)

(sll0382) cbiM(sll0383)

(ssl0750)

lpxA(sll0379) rfbW(sll0380)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0427) (slr0421)

rlpA(slr0423)

2700000

folE(slr0426)

2705000

2710000

2715000

(sll0371)

proA(sll0373) cysG(sll0378)

mfd(sll0377)

(sll0376)

braG_or_livF(sll0374)

(ssl0738) (sll0372)

10

5

0

−5

2720000

pyrR(sll0368) carB(sll0370)

(sll0369)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0192) (slr0427)

lytB(slr0191)

(slr0196)

(slr0193)

(slr0195)

(slr0197)

(slr0199)

hdrB(slr0201)

rpiA(slr0194)

2720000

2725000

2730000

2735000

(sll0188) (sll0189)

5

0

−5

(ssl0350)

(sll0183) (sll0185)

rpoD(sll0184)

(sll0182)

(ssl0353) (ssl0352)

10

2740000

(sll0181)

(sll0180)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0208) (slr0204)

(slr0207)

(ssr0332)

ftrV(ssr0330)

(slr0210)

(slr0211)

metH(slr0212)

(ssr0336)

(slr0209)

2740000

(sll0180)

10

5

0

−5

2745000

gltX(sll0179)

2750000

(ssl0331)

2755000

2760000

(sll0178)

(sll0888)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0896) (ssr1513)

(slr0895)

cynS(slr0899) (slr0897)

nirA(slr0898)

moaC(slr0902)

moeA(slr0900)

2760000

2765000

(sll0887) (sll0888)

10

5

0

−5

(sll0886)

2770000

(slr0904)

moaA(slr0901)

(ssr1528) (ssr1527)

2775000

bchE(slr0905) psbB(slr0906)

2780000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0912) psbB(slr0906)

(slr0907)

(slr0909)

bioF(slr0917) (slr0913)

(slr0914)

(slr0915)

(slr0920)

(slr0923)

(slr0919)

(slr0921)

map_C_pepM(slr0918)

2780000

2785000

2790000

pth(slr0922)

2795000

citH(sll0891)

(ssl1690)

5

0

−5

natB(slr0559)

2800000

panD(sll0892)

10

(slr0924)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0575) natB(slr0559)

(slr0565)

2800000

(slr0569)

2805000

2810000

map(sll0555)

(sll0552) (sll0553)

10

5

0

−5

(sll0550)

(sll0549)

(slr0573)

2815000

(sll0546)

ftrC(sll0554) (sll0556)

(slr0572)

(sll0547)

2820000

(ssl1046) (sll0545)

(sll0543) (sll0544)

cyp(slr0574)

(ssl1045) sgl0001(sgl0001)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0581) (slr0579)

rpl33(ssr1398)

(slr0580)

(slr0583)

(slr0825)

(slr0582)

2820000

alr(slr0827)

(slr0829)

(ssr1407)

rps18(ssr1399)

2825000

2830000

2835000

2840000

desC_des9_(sll0541) acs(sll0542)

(sll0832) (sll0540)

(sll0834) (sll0539)

10

5

0

−5

(sll0833)

Chr 1

10

5

0

−5 moxR(slr0835) dnaB(slr0833)

2840000

hemH(slr0839)

rfbB(slr0836)

ndhF(slr0844)

purM(slr0838)

2845000

(slr0841)

2850000

10

5

0

−5

ycf34(ssr1425)

2855000

fus(sll0830) (ssl1552)

(slr0842)

2860000

(sll0827) rapQ(sll0829)

nylA(sll0828)

pcnB(sll0825)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0848) (slr0845)

(slr0846)

ycf16(slr0075)

kdtB(slr0847)

(slr0073)

ycf24(slr0074)

(slr0076)

gidB(slr0072)

2860000

2865000

nifS(slr0077)

2870000

2875000

2880000

sdhB(sll0823) (ssl1533)

(sll0822)

(sll0085) (sll0821)

(sll0088)

(sll0086)

hisB(sll0084) gmhA(sll0083)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 gspE(slr0079) (slr0078)

deaD(slr0083) rnhA(slr0080)

(slr0082)

erg6(slr0089) hisH(slr0084)

(slr0086)

crtO(slr0088)

(slr0081)

2880000

gmhA(sll0083)

10

5

0

−5

2885000

(sll0082)

ppd(slr0090) (slr0091)

2890000

argC(sll0080)

2895000

thrS(sll0078)

2900000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0092)

(slr0498) dnaJ(slr0093)

(slr0503)

(slr0096)

hisB(slr0500)

cobW(slr0502)

(slr0095)

2900000

(slr0505)

(slr0509) pcr(slr0506)

2905000

2910000

2915000

2920000

(sll0487) (sll0489)

(sll0488)

(sll0481) (sll0486)

(sll0484) (sll0485)

10

5

0

−5

(sll0482)

(sll0480)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr0871) (slr0510)

(slr0514)

(slr0511)

(slr0513)

abfB(slr0518)

(slr0516)

(slr0517)

(slr0521)

purL(slr0520)

(slr0522)

(slr0523)

(slr0519)

2920000

2925000

2930000

2935000

2940000

prsA(sll0469)

(sll0478) (sll0474)

(sll0479) (sll0477)

10

5

0

−5

(sll0473)

(sll0471)

(sll0470)

Chr 1

10

5

0

−5 (ssr1038) (slr0523)

(slr0615)

2940000

2945000

(sll0597) queA(sll0467)

5

0

−5

(slr0619) (slr0617)

cbiP(slr0618)

2950000

(ssr1041)

2955000

2960000

(sll0594) (sll0596) (sll0595)

10

(slr0616)

pykF(sll0587) glk(sll0593)

(sll0590)

(sll0588)

(sll0586)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0625) trxA(slr0623)

(slr0106)

(slr0624)

(slr0626)

(slr0103)

(slr0104)

(slr0105)

(slr0099)

2960000

2965000

2970000

ycf36(sll0584) (sll0586)

(sll0585)

2975000

2980000

eda(sll0107) aroH(sll0109)

amt1(sll0108)

(sll0103) (sll0102)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0109) (slr0106)

(slr0114)

(slr0108)

(slr0110)

(slr0112)

(slr0115)

(slr0111)

2980000

2985000

2990000

2995000

ama(sll0100) (sll0101)

5

0

−5

3000000

(sll0092) cbiE(sll0099)

(sll0096) (sll0098)

10

thiC(slr0118) (slr0116)

(sll0095)

(sll0094)

(ssl0172)

Chr 1

10

5

0

−5 brkB(slr0119) thiC(slr0118)

(slr0299) (slr0120)

fraH(slr0298) (slr0121)

3000000

3005000

3010000

minE(ssl0546) minD(sll0289) minC(sll0288)

5

0

−5

(slr0302)

(slr0303)

(slr0305)

(slr0300)

ppk(sll0290)

10

(slr0304) ppsA(slr0301)

3015000

3020000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0313) (slr0306)

(slr0309)

(slr0311)

(slr0312)

(slr0314)

(slr0316)

(slr0317)

(slr0315)

3020000

3025000

3030000

(sll0284) (sll0286)

10

5

0

−5

3035000

(sll0281) (sll0283)

(sll0282)

(sll0280)

3040000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0318) (slr0317)

(slr0788) map(slr0786)

(slr0787)

BA000022.2:blaOXA−3:unknown_transcript_1(slr0319)

3040000

nreB(slr0796) (slr0789)

(slr0793)

(slr0794)

(slr0795)

(slr0797)

umuC(slr0790)

3045000

3050000

3055000

3060000

(sll0800) (ssl0511)

(sll0798)

merR(sll0794) (sll0797)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0800) (slr0798)

(slr0799)

3060000

3065000

3070000

smtB(sll0792) (sll0793)

(sll0787) (sll0790)

(sll0788) (sll0789)

10

5

0

−5

(slr0801)

(ssl1464)

3075000

3080000

(sll0783) (sll0786)

merR(sll0784) (sll0785)

(sll0782)

(sll0780) (sll0781)

(sll0779)

(sll0778)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0699) ESI3(ssr1169)

(slr0697)

(slr0698)

(slr0703) (slr0700)

(slr0702)

(ssr1175)

merR(slr0701)

3080000

3085000

pknA(sll0776) (sll0778)

(sll0777)

(smr0002)

3090000

3095000

5

0

−5

3100000

(sll0677) (sll0775)

(sll0678)

(sll0676) (ssl1277)

10

(ssr1176) (slr0704)

(sll0672)

Chr 1

10

5

0

−5 gdhA(slr0710) polA(slr0707)

(slr0708)

(slr0709)

tgt(slr0713)

(slr0711)

petM(smr0003) (slr0712)

3100000

3105000

(sll0670) (sll0672)

(sll0671)

(sll0669)

3110000

(sll0665) (sll0666)

10

5

0

−5

3120000

(sll0664)

(sll0667) (sll0668)

3115000

(ssl1263) (sll0662) ycf35(sll0661)

pdxA(sll0660)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0765)

3120000

3125000

(sll0658) (sll0659)

5

0

−5

3135000

(sll0744)

(ssl1255) mraY(sll0657)

10

3130000

pfkA(sll0745)

3140000

(sll0739) (sll0743) (sll0742)

nifJ(sll0741)

(sll0740)

modA(sll0738)

(sll0048) (sll0737)

Chr 1

10

5

0

−5 ilvE(slr0032) (slr0022)

(slr0023)

3140000

(slr0031)

3145000

3150000

(slr0033)

3155000

3160000

(sll0039) (sll0047)

10

5

0

−5

sps(sll0045)

(sll0044)

(sll0043)

tar(sll0042)

(sll0041)

(sll0040)

(sll0038)

(sll0037)

(sll0036)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0039) aspC(slr0036)

nrtD(slr0044)

(slr0038)

cmpA(slr0040)

(slr0042)

nrtC(slr0043)

cmpB(slr0041)

3160000

3165000

3170000

3175000

3180000

(sll0033) (sll0036)

10

5

0

−5

(sll0034)

ndhF(sll0026) (sll0031)

cmpR(sll0030)

ndhD(sll0027)

Chr 1

10

5

0

−5 panB(slr0526)

(slr0530)

chlM(slr0525)

murE(slr0528)

(slr0529)

hemE(slr0536) (slr0531)

(slr0533)

slt(slr0534)

(slr0535)

exsB(slr0527)

3180000

3185000

3190000

3195000

3200000

rbpA(sll0517) (sll0518)

10

5

0

−5

(sll0514)

(sll0513)

(sll0509)

Chr 1

10

5

0

−5 clpP(slr0542) (slr0537)

(slr0541)

3200000

3205000

(sll0508) (sll0509)

5

0

−5

(slr0544)

3215000

3220000

lysA(sll0504) (sll0507)

(sll0505) (sll0506)

10

3210000

trpB(slr0543)

(sll0497) (sll0503)

(sll0501) argS(sll0502)

(sll0499)

(sll0498)

Chr 1

10

5

0

−5 ubiA(slr0926) (slr0545)

ssb(slr0925)

(ssr1558)

psbD2(slr0927)

(slr0930)

(ssr1562)

(slr0929)

3220000

3225000

3230000

asnS(sll0495) (sll0496)

purE(sll0901) (sll0494)

argF(sll0902) (sll0493)

10

5

0

−5

3235000

3240000

(ssl1707) hisG(sll0900) glmU(sll0899)

cysQ(sll0895) (sll0896)

(sll0898) dnaJ(sll0897)

Chr 1

10

5

0

−5 dapA(slr0550) trpC(slr0546)

asd(slr0549)

3240000

3245000

(slr0553) (slr0551)

3250000

(slr0552)

(slr0554)

3255000

3260000

(sll0536) amt3(sll0537)

clpX(sll0535) clpP(sll0534)

10

5

0

−5

tig(sll0533)

(sll0529)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1419) (slr0556)

valS(slr0557)

pyrD(slr1418)

(slr1420)

murC(slr1423) (slr1421)

3260000

3265000

ndhE(sll0522)

(sll0525) (sll0524)

10

5

0

−5

3275000

3280000

gap2(sll1342)

ndhG(sll0521)

(ssl1004) (sll0528)

3270000

ndhA(sll0519) ndhI(sll0520)

(sll1344)

ape2(sll1343)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1424) murC(slr1423)

(ssr2439)

(slr1425)

(slr1428)

(slr1429)

(slr1431)

(slr1451)

sbpA(slr1452)

recR(slr1426)

3280000

cysT(slr1453)

3285000

3290000

3295000

(sll1340) bfr(sll1341)

10

5

0

−5

3300000

(sll1329) (sll1338)

(sll1336)

(sll1334)

(sll1333)

(sll1330)

(sll1367)

Chr 1

10

5

0

−5 cysW(slr1454) cysT(slr1453)

chrA(slr1457) (slr1456)

hisA(slr0652)

apcF(slr1459)

(slr1461)

(slr1462)

fus(slr1463)

(slr1464)

(slr0651)

cysA(slr1455)

3300000

3305000

3310000

3315000

3320000

ilvC(sll1363) (sll1366)

10

5

0

−5

(sll1365)

(ssl2667)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0655) hisA(slr0652)

rpoDI(slr0653)

(slr0654)

(slr0658) (slr0656)

lysC(slr0657)

prlC(slr0659) proC(slr0661)

3320000

3325000

3330000

3335000

3340000

(sll0630) lim17(sll0626)

nadB(sll0631) psaK(sll0629)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0664) speA(slr0662)

3340000

3345000

(sll0625) lim17(sll0626)

10

5

0

−5

(ssr1114)

(slr0667) (slr0665)

3350000

(slr0666)

(slr0668)

ddh(slr1556)

3355000

3360000

nadA(sll0622) (sll0624)

(sll0623)

dsbD(sll0621)

gltB(sll1499)

Chr 1

10

5

0

−5 hisS(slr1560) ddh(slr1556)

(slr1557)

aroE(slr1559)

rpoF(slr1564) (slr1563)

grxC(slr1562)

3360000

3365000

(slr1565)

(slr1567)

(slr1568)

(slr1566)

3370000

3375000

3380000

(sll1488) carA(sll1498)

10

5

0

−5

(sll1496)

(sll1495)

(sll1491)

(sll1489)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1571) (slr1570)

(slr1576) (slr1572)

(slr1575)

(slr1577)

(slr1579)

(slr1583)

(slr1573)

3380000

3385000

3390000

3395000

(sll1485) (ssl2874)

(sll1486)

(sll1481) ndh(sll1484)

(sll1482) (sll1483)

10

5

0

−5

3400000

devB(sll1479)

(sll1476) (sll1477)

(sll1475)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1585)

stpA(slr0746)

(slr1584)

(slr1588)

chlL(slr0749) ggtA(slr0747)

(slr0748)

chlN(slr0750)

(slr0751)

(slr1586)

3400000

3405000

3410000

3415000

3420000

(sll1474) (sll1475)

(sll1473)

cpcG(sll1471) (sll1472)

10

5

0

−5

leuC(sll1470)

(sll0736)

(sll0735)

(sll0733)

Chr 1

10

5

0

−5 eno(slr0752)

(slr0755)

(slr0751)

p(slr0753)

(slr0757)

(ssr1256)

(slr0756)

(slr0758)

(ssr1258)

3420000

3425000

3430000

3435000

3440000

(sll0729) (sll0732)

(sll0727)

(ssl1378) accA(sll0728)

10

5

0

−5

pgm(sll0726)

(sll0723)

Chr 1

10

5

0

−5 ama(slr1653) hlyB(slr1651)

murG(slr1656)

(slr1652)

psaL(slr1655)

(slr1657)

psaI(smr0004)

3440000

3445000

3450000

3455000

3460000

(sll1552) (sll0722)

10

5

0

−5

(sll0721)

(sll0720)

(sll1550)

(sll1549)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1658) (slr1657)

dapF(slr1665) (slr1660)

(slr1661)

(slr1664)

(slr1659)

(slr1668) degT(slr1666)

(slr1667)

(ssr2781)

3460000

3465000

3470000

(ssr2786)

3475000

3480000

ppx(sll1546) (sll1547)

10

5

0

−5

(sll0451) gst1(sll1545)

(sll1544)

(sll1543)

(sll1542)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0449)

ski2(slr0451)

3480000

3485000

3490000

3495000

(sll0448) norB(sll0450)

10

5

0

−5

(sll0449)

ilvD(slr0452)

3500000

(sll0444) (sll0447)

(sll0446)

(sll0445)

(sll0441) (sll0443)

(sll0442)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0456) ilvD(slr0452)

(slr0453)

(slr0454)

(slr0455)

(slr0460) (slr0458)

(slr0459)

(slr1177) (ssr0817)

truB(slr0457)

3500000

3505000

agp(slr1176)

(slr0462)

3510000

(slr1179)

3515000

(sll0436) (ssl0832)

10

5

0

−5

(sll0431)

(slr1178)

htpG(sll0430)

3520000

Chr 1

10

5

0

−5 (slr1182) (slr1179)

psbA1(slr1181)

petC(slr1185) (slr1184)

(slr1183)

3520000

3525000

(slr1186)

(slr1189)

(slr0587)

im30(slr1188)

(slr1192)

(slr1187)

(slr0590) (slr0588)

argG(slr0585)

3530000

(slr0589)

3535000

(sll1109) prfA(sll1110)

(slr0586)

3540000

(sll1106) (sll1108)

(sll1107)

purK(sll0578) (sll0577)

10

5

0

−5

Chr 1

10

5

0

−5 purH(slr0597) (slr0590)

(slr0591)

(slr0592)

(slr0593)

(slr0594)

(slr0596)

(slr0598)

(slr0600) (slr0599)

3540000

3545000

rfbB(sll0575) (sll0576)

10

5

0

−5

rfbA(sll0574)

3550000

3555000

3560000

(sll0572) arcC(sll0573)

(sll0564) recA(sll0569)

fur(sll0567)

(sll0565)

Chr 1

10

5

0

−5 (slr0602) (slr0601)

3560000

dnaE(slr0603)

3561000

3562000

(sll0563)

10

5

0

−5

3563000

lepA(slr0604)

3564000

3565000

3566000

3567000