Extensive Determination of Glycan ... - cchem.berkeley.edu

2 downloads 13 Views 1MB Size Report
Dec 6, 2011 - Enriched Plasma Membranes of Human Embryonic Stem Cells ...... D. (1983) Stage-Specific Embryonic Antigens (Ssea-3 and Ssea-4) AreĀ ...
MCP Papers in Press. Published on December 6, 2011 as Manuscript M111.010660

                 !     # "                   ! "# $ &#! %%  (!') **%   ) '!+ ! 





                   ! " #  $ ! %  '   &   & (  -+,*)

 ! %  .  ! " #   ! %      ! -01/1  ! %    2  3  4         & (  -+,*)

 ! %    35 3 '        '    !    ' . 65  & (  6$ & (  -+,*)  ! %  &   ' '      ! -01/1

       & ) ), ) )-.  - /%-) ) -!   ) +   ') ** $ & %% & ) ), !  

 .  - -  --0   ) '!+ 1   --0  2  &-! 3 04/765/978/575>7   

               

 



Copyright 2011 by The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc.

   1 / -1;) )  ? ) )     -  )*   "+$@" );/---)+ -$- ) A@ * )  "" --) )  B: %: ) ;; - ;??/ ) ; -  ?    : :  - " "  -   

8 

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

6 

  -   -  -)    -   &    )  )  ;    - %    - ) !

5N- .  ) - 5!7 " 1$ )%   . - .) '  )  % *    !":5     -) )    - D(+/569E .  .  $"1" .)    - D   6576E -  ).)5G:'D+   ) -E A-))  D5CA  5OA 3

 E 8!7 OA  % *  D  E 85 A  1 : D   .) % ) 3 ' &- E 5!7 OA     )-  D#(E 55 A     ) ; D#(E  5 OA    )   - D E!":5N-. -- .  ) -* ) !:     --  - . )  -    -  . - .) '  )  % *    !  ; )  75     - .  )   ) %   )   - ) %%)  -- -)  )   )  )-!        # &"  ;) )  . - %  - ) )%  ) !  )-.) . .)) )  %   * )  %%D'E --) %5!87 = 

"-  -85"-/B9!57!K D" >E - )  -    

9 

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

?/  -!   ) .) )- ) - %   - -&  )      % ) - -% %  1- % -1-.  .) )-//  )



 

 )-

.)

 )  

    )



% )  ) !

   D  E . - - %  )%  ?/  -     D ?E )) /  - ?/  - -% .  %  DE . - - %  )%  :/  -!     *-   I/  - -) ) -/  -      )     ; )  ?/  -! ? -    -%   - )

-) ))) I/6 /  --) ) -!- -%% I/$/ ) -   -  - ) ) .) I/$/ ) - D!!  ) Z/6 ?E . - )   -) )  %  ! - )- . ) *   ) %;  & 1-   *&  -   % . ) ) ! 

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

 89



"35674  5,#   )% % % - & )? )  @-)) ) % )D(B "5599% !'!+  "KK5E  -  - -  -!:% & : -)"!"! 1- !$!D8557E-.) -  % 0  - - & )  ) ) )-!   5 778K/7  =  6K88/898  .  ! !    ! 1! D855E  - %   -     ) -! =  5K/K89 + & /' (!D855E% ) % -) - ! 
8K!

89!

8=! 8>! 65! 6!

68!

66!

6
69!

 ) $!   . - '! '! D>9=E "     )   $%  ) /% " - 1  ) D- /E! =                          9777K7/77K>

!!:*!   ! . -'!'! )$! 1& -"!!D>=E) /% 1  ) @& &-   //Y6 :  - )  /8 ' /    -!   8>8 7K/7=   (!  ?!!@- :!   !.-!! . -'!'!  ) $! D>=6E ) /% 1  )- D- /6  - /E -) ) ) )&  -- %  -)- -$#@$ %  )-- -!= KK5/K6  !$!"  !"!  !(!)- !$!!'*(!"  )!"!( --  !    (! !  - (! :!  ' - ! ! D>>5E @- )     )* )  %  - )  -   ) *     -) )      ":/5!     75 K597/ K5=K  &  $! ! D>>6E U )) )& -)- % ) " );/---) + -/$- )  " --/ ) )  %   ; B  -  -! %     ' %   9 K 65



6=!

6>!

>5%  -)     -)    ": 5! D'E       %  %    -    ;A  )    -1 :/K1 --)& !" = " > ) -)   )   - )1!  ;A )   -.% )- )) %  - -       -)   )   % %  - D]/6E!    -)- - ) D )  / %  - )E   -  ;0;? -)-  /- )   /%  - )   -!    ;A )   -  %  - ) )1 -! 

68 

'-!#  )  %  ;--  - )-!DE/D'E %;1 -) ).-)  .)  -)   D    -) E )    -) 1/
  -  -

 " 

? ; ;? ?  : 

   ;A   -

  -  -

/

 64; 9G " 7  65G

" K 8G

#'.#" " K 6G

" 7 G

" 9 KG

" 9 8G " = 68G

;0;? 7G

" = 6