Package 'oce'

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Jul 5, 2013 - calculating seawater properties such as potential temperature ...... particular instrument types, and prudent researchers will take a moment to .... Assigning values: This follows the standard form, e.g. to increase all velocity data by 1 cm/s, ...... starts at scan number 5 and continues to the end, while ctdTrim(ctd ...
Package ‘oce’ July 5, 2013 Version 0.9-12 Date 2013-07-04 Title Analysis of Oceanographic data Author Dan Kelley Maintainer Dan Kelley Depends R (>= 2.15), utils, methods, mapproj Suggests ncdf, foreign BugReports https://github.com/dankelley/oce/issues?sort=created&direction=desc&state=open Description Supports the analysis of Oceanographic data, including ADP measurements, CTD measurements, sectional data, sea-level time series, coastline files, etc. Provides functions for calculating seawater properties such as potential temperature and density, as well as derived properties such as buoyancy frequency and dynamic height. License GPL (>= 2) URL http://dankelley.github.com/oce/ LazyLoad yes LazyData yes NeedsCompilation yes Repository CRAN Date/Publication 2013-07-05 07:27:42 1

R topics documented:

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R topics documented: a03 . . . . . . . . . . . . . abbreviateTimeLabels . . . accessors . . . . . . . . . addColumn . . . . . . . . adp . . . . . . . . . . . . . adp-class . . . . . . . . . adv . . . . . . . . . . . . . adv-class . . . . . . . . . airHalifax . . . . . . . . . airRho . . . . . . . . . . . angleRemap . . . . . . . . applyMagneticDeclination approx3d . . . . . . . . . as.coastline . . . . . . . . as.ctd . . . . . . . . . . . as.drifter . . . . . . . . . . as.echosounder . . . . . . as.lisst . . . . . . . . . . . as.lobo . . . . . . . . . . . as.met . . . . . . . . . . . as.sealevel . . . . . . . . . as.section . . . . . . . . . as.tdr . . . . . . . . . . . . as.topo . . . . . . . . . . . as.windrose . . . . . . . . bcdToInteger . . . . . . . beamName . . . . . . . . beamToXyz . . . . . . . . beamToXyzAdp . . . . . . beamToXyzAdv . . . . . . beamUnspreadAdp . . . . binAverage . . . . . . . . binmapAdp . . . . . . . . byteToBinary . . . . . . . cm . . . . . . . . . . . . . cm-class . . . . . . . . . . coastline-class . . . . . . . coastlineHalifax . . . . . . coastlineMaritimes . . . . coastlineSLE . . . . . . . coastlineWorld . . . . . . coriolis . . . . . . . . . . ctd . . . . . . . . . . . . . ctd-class . . . . . . . . . . ctdAddColumn . . . . . . ctdDecimate . . . . . . . .

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R topics documented: ctdRaw . . . . . . . . . . . ctdTrim . . . . . . . . . . . ctdUpdateHeader . . . . . . ctimeToSeconds . . . . . . . decimate . . . . . . . . . . . despike . . . . . . . . . . . detrend . . . . . . . . . . . drag . . . . . . . . . . . . . drawDirectionField . . . . . drawIsopycnals . . . . . . . drawPalette . . . . . . . . . drifter . . . . . . . . . . . . drifter-class . . . . . . . . . echosounder . . . . . . . . . echosounder-class . . . . . . eclipticalToEquatorial . . . . endeavour . . . . . . . . . . enuToOtherAdp . . . . . . . enuToOtherAdv . . . . . . . equatorialToLocalHorizontal errorbars . . . . . . . . . . . extract . . . . . . . . . . . . fillGap . . . . . . . . . . . . findBottom . . . . . . . . . findInOrdered . . . . . . . . formatCI . . . . . . . . . . . formatPosition . . . . . . . . fullFilename . . . . . . . . . geodDist . . . . . . . . . . . geodGc . . . . . . . . . . . geodXy . . . . . . . . . . . geosecs235 . . . . . . . . . giss . . . . . . . . . . . . . GMTOffsetFromTz . . . . . grad . . . . . . . . . . . . . gravity . . . . . . . . . . . . head . . . . . . . . . . . . . header . . . . . . . . . . . . imagep . . . . . . . . . . . . integerToAscii . . . . . . . . integrateTrapezoid . . . . . interpBarnes . . . . . . . . . is.beam . . . . . . . . . . . julianCenturyAnomaly . . . julianDay . . . . . . . . . . latFormat . . . . . . . . . . latlonFormat . . . . . . . . . levitus . . . . . . . . . . . .

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R topics documented:

4 lisst . . . . . . . . . lisst-class . . . . . . lobo . . . . . . . . . lobo-class . . . . . . loggerToc . . . . . . lonFormat . . . . . . magneticDeclination makeFilter . . . . . . makeSection . . . . . map2lonlat . . . . . mapContour . . . . . mapImage . . . . . . mapLines . . . . . . mapLocator . . . . . mapMeridians . . . . mapPlot . . . . . . . mapPoints . . . . . . mapPolygon . . . . . mapText . . . . . . . mapZones . . . . . . matchBytes . . . . . matrixSmooth . . . . met . . . . . . . . . met-class . . . . . . moonAngle . . . . . munk . . . . . . . . numberAsPOSIXct . oce-class . . . . . . . oce.as.POSIXlt . . . oce.as.raw . . . . . . oce.axis.POSIXct . . oce.plot.ts . . . . . . oce.write.table . . . . oceans . . . . . . . . oceApprox . . . . . . oceBisect . . . . . . oceColors . . . . . . oceContour . . . . . oceConvolve . . . . oceDebug . . . . . . oceEdit . . . . . . . oceFilter . . . . . . . oceMagic . . . . . . ocePmatch . . . . . . oceSmooth . . . . . oceSpectrum . . . . papa . . . . . . . . . parseLatLon . . . . .

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R topics documented: plot.adp . . . . . plot.adv . . . . . plot.cm . . . . . plot.coastline . . plot.ctd . . . . . plot.drifter . . . . plot.echosounder plot.lisst . . . . . plot.lobo . . . . . plot.met . . . . . plot.sealevel . . . plot.section . . . plot.tdr . . . . . . plot.tidem . . . . plot.topo . . . . . plot.windrose . . plotInset . . . . . plotPolar . . . . . plotProfile . . . . plotScan . . . . . plotSticks . . . . plotTaylor . . . . plotTS . . . . . . predict.tidem . . prettyPosition . . processingLog . . pwelch . . . . . . rangeLimit . . . . read.adp . . . . . read.adv . . . . . read.cm . . . . . read.coastline . . read.ctd . . . . . read.drifter . . . read.echosounder read.lisst . . . . . read.lobo . . . . read.met . . . . . read.oce . . . . . read.sealevel . . . read.section . . . read.tdr . . . . . read.topo . . . . redfieldNC . . . . redfieldNP . . . . redfieldPlankton . rescale . . . . . . resizableLabel . .

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R topics documented:

6 retime . . . . . . . . . . . . riley . . . . . . . . . . . . . RRprofile . . . . . . . . . . schmitt . . . . . . . . . . . . sealevel-class . . . . . . . . sealevelHalifax . . . . . . . sealevelTuktoyaktuk . . . . secondsToCtime . . . . . . . section . . . . . . . . . . . . section-class . . . . . . . . . sectionGrid . . . . . . . . . sectionSmooth . . . . . . . . sectionSort . . . . . . . . . showMetadataItem . . . . . siderealTime . . . . . . . . . soi . . . . . . . . . . . . . . subset.oce . . . . . . . . . . subtractBottomVelocity . . . summary.adp . . . . . . . . summary.adv . . . . . . . . summary.cm . . . . . . . . . summary.coastline . . . . . summary.ctd . . . . . . . . . summary.drifter . . . . . . . summary.echosounder . . . summary.lisst . . . . . . . . summary.lobo . . . . . . . . summary.met . . . . . . . . summary.sealevel . . . . . . summary.section . . . . . . summary.tdr . . . . . . . . . summary.tidem . . . . . . . summary.topo . . . . . . . . summary.windrose . . . . . sunAngle . . . . . . . . . . swAbsoluteSalinity . . . . . swAlpha . . . . . . . . . . . swAlphaOverBeta . . . . . . swBeta . . . . . . . . . . . . swConductivity . . . . . . . swConservativeTemperature swDepth . . . . . . . . . . . swDynamicHeight . . . . . swLapseRate . . . . . . . . swN2 . . . . . . . . . . . . swRho . . . . . . . . . . . . swSCTp . . . . . . . . . . . swSigma . . . . . . . . . . .

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R topics documented: swSigmaT . . . . . . swSigmaTheta . . . . swSoundAbsorption . swSoundSpeed . . . swSpecificHeat . . . swSpice . . . . . . . swSTrho . . . . . . . swTFreeze . . . . . . swTheta . . . . . . . swTSrho . . . . . . . swViscosity . . . . . tdr . . . . . . . . . . tdr-class . . . . . . . tdrPatm . . . . . . . tdrTrim . . . . . . . teos . . . . . . . . . teosSetLibrary . . . . threenum . . . . . . tidedata . . . . . . . tidem . . . . . . . . tidem-class . . . . . tidemAstron . . . . . tidemVuf . . . . . . time.oce . . . . . . . toEnuAdp . . . . . . toEnuAdv . . . . . . topo-class . . . . . . topo2 . . . . . . . . topoInterpolate . . . topoMaritimes . . . . topoWorld . . . . . . turbulence . . . . . . unabbreviateYear . . undriftTime . . . . . unwrapAngle . . . . useHeading . . . . . vectorShow . . . . . velocityStatistics . . webtide . . . . . . . wilson . . . . . . . . wind . . . . . . . . . window.oce . . . . . windrose-class . . . . write.ctd . . . . . . . xyzToEnuAdp . . . . xyzToEnuAdv . . . . Index

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a03

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WOCE section a03

Description This is line A03 (ExpoCode 90CT40_1, with nominal sampling date 1993-09-11). The chief scientist was Tereschenkov of SOI, working aboard the Russian ship Multanovsky, undertaking a westward transect from the Mediterranean outflow region across to North America, with a change of heading in the last few dozen stations to run across the nominal Gulf Stream axis. Usage data(a03) Author(s) Dan Kelley Source This is based on a WOCE file downloaded from a server, as below: a03