position reference Cemani genotype Silkie genotype L2 ... - PLOS

5 downloads 0 Views 28KB Size Report
position reference. Cemani genotype. Silkie genotype. L2 Taiwanese genotype. 11184107. T. T/C het. T/C het. T hom. # of het_Cemani = 50. 11184380. C. C/T.
position 11184107 11184380 11184505 11184591 11184672 11184694 11184727 11184734 11185151 11185935 11186109 11186125 11186218 11186220 11186266 11186267 11186672 11186808 11187282 11187334 11187494 11187816 11187964 11187996 11188298 11188585 11188777 11188845 11189939 11190074 11190475 11190652 11190958 11190958 11191533 11191638 11191752 11192379 11192412 11192860 11193080 11193105 11193454 11193610 11193636 11193723 11193749 11194503 11194937 11196053 11196105 11197355 11197426 11201894 11202063

reference T C C C A G T A C C C T G G T G C G T C G G T T C A G T A A T T T T A A C T C G G A G T C G T T A T A A T C G

Cemani T/C C/T C/G C/A A G/A T/G A/T C/A C/T C/T T/C G/A G/A T/G G/T C/T G/A T/C C/T A G/A T/C T/C C/T A/G G/T C A/G A/G T/C T/C T/A T/G A/G A/G C/T T/C C/T G/A G/C A/G G/A C A G/A T/G T/A A/G T/A A/G A/C T/C A A

genotype het het het het hom het het het het het het het het het het het het het het het hom het het het het het het hom het het het het het het het het het het het het het het het hom hom het het het het het het het het hom hom

Silkie T/C C/T C/G C/A A/G G/A T/G A/T C/A C/T C/T T/C G/A G/A T/G G/T C/T G/A T/C C/T A G/A T/C T/C C/T A/G G/T C A/G A/G T/C T/C T/A T/G A/G A/G C/T T/C C/T G/A G/C A/G G/A C A G/A T/G T/A A/G T A/G A/C T/C A A

genotype het het het het het het het het het het het het het het het het het het het het hom het het het het het het hom het het het het het het het het het het het het het het het hom hom het het het het hom het het het hom hom

L2 Taiwanese T C C C A G T A C C C T G G T G C G T C G G T T C A G T A A T T G T A A C T C G G A G T C G T T A T A A T C G

genotype hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom

# of het_Cemani = 50 # of het_Silkie = 51 # of hom_Cemani = 106 # of hom_Silkie = 105

11202703 11203349 11203758 11204021 11204052 11204053 11204131 11204145 11204268 11204289 11204553 11205462 11205485 11205829 11205845 11205892 11206338 11206824 11206998 11207428 11207467 11207724 11207940 11208255 11208366 11209096 11209342 11209633 11209692 11210453 11213748 11213786 11214040 11214913 11214923 11215207 11215871 11217777 11217989 11218209 11218613 11219048 11219232 11219370 11220573 11220623 11221946 11222140 11222666 11222766 11223603 11224007 11224077 11224374 11224518 11224519

T C C C C A C T C G A G C C T T A A G G C T G G G C G G G C C C T C A C G C C G T G G T G C G G C C A G A C C T

G T T A T G A C T A G A T A C G C G T T T C C C C G A A G/A A T T A A G G A T T A A A T C C T A A A G G T G A A C

hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom het hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom

T T T A T G A C T A G A T A C G C G T T T C C C C G A A G/A A T T A A G G A T T A A A T C C T A A A G G T G A A C

hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom het hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom

T C/G C C C A C T C G A G C C T T A A G G C T G G G C G G G C C C T C A C G C C G T G G T G C G G C C A G A C C T

hom het hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom

11224682 11224974 11225127 11225316 11226108 11230298 11231669 11232740 11232802 11233294 11233373 11233533 11233849 11234218 11234374 11234810 11234814 11234820 11235522 11235847 11235959 11236606 11237812 11237813 11238450 11238851 11239021 11239313 11239899 11240721 11241229 11241403 11241417 11244911 11244955 11245067 11245293 11247151 11248936 11249067 11249122 11250412 11251087 11251132 11251383 11254430 11254491

A C C A T T A A A A G C G C G T G A C T T C T T G C C T C G G A C A C T T C G C T G A G C C G

G G T G C C C G C G T G C T A T/G T T T G C C C G A T T G G A C G T C T C C T A T C A G C A T A

hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom het hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom

G G T G C C C G C G T G C T A T/G T T T G C C/T C G A T T G G A C G T C T C C T A T C A G C A T A

hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom het hom hom hom hom hom het hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom

A C C A T T A A A A G C G C G T G A C T T C T T G C C T C G G A C A C T T C G C T G A G C C G

hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom hom