PPD-D1

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β-strand 1

PPD-D1 PPD-D1_3 PPD-D1_2 PPD-D1_1 ABL09477.1 [T.a.] BAM93381.1 [T.m.] ACL78560.1 [H.v.] ADR51713.1 [S.c.] ALT32070.1 [L.p.] NP_568107.1 [A.t.] XP_010658157.1 [V.v.] XP_004237533.1 [S.l.] XP_013468266.1 [M.t.]

β-strand 3

α-helix 2

β-strand 4

α-helix 3

α-helix 4 β-strand 5

α-helix 5

Pseudo-Receiver domain

10 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1

β-strand 2

α-helix 1

20

30

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40

50

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6

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160

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170

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190

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200

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210

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220

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230 S S SG SG SG S S SG SG SG S S SG SG SG S S SG SG SG S S SG SG SG S S SG SG SG - - - - - - - - S NR E T NNNL S S SG SG S E SG S E S E S E S S SG SG S E S S SG SG S E -

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240

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260

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282 282 282 282 282 298 14 265 330 349 348 332



dN/dS

4

2

0 0

250

amino acid position 390 283 PPD-D1_3 283 PPD-D1_2 283 PPD-D1_1 283 ABL09477.1 [T.a.] 283 BAM93381.1 [T.m.] 299 ACL78560.1 [H.v.] 15 ADR51713.1 [S.c.] 266 ALT32070.1 [L.p.] 331 NP_568107.1 [A.t.] XP_010658157.1 [V.v.] 350 XP_004237533.1 [S.l.] 349 XP_013468266.1 [M.t.] 333

400

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6





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690

700

- - V S P I NG N T H T S A F H R V Q P WT P A T A A G K D K A D E T S K K N - - - - - - - - A A T A A A A A K DM S G E A Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V S P I NG N T H T S A F H R V Q P WT P A T A A G K D K A D E M S K K N - - - - - - - - A A - T A A A A K D NG G E A Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V S P I NG N T H T S A F H R V Q P WT P A T A A G K D K A D E M S K K N - - - - - - - - A A - T A A A A K D NG G E A Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V S P I NG N T H T S A F H R V Q P WT P A T A A G K D K A D E T S K K N - - - - - - - - A A T T A A A A K DMG G E A Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V S P I NG N T H T S A F H R V Q P WT P A T A A G K D K A D E V S K K N - - - - - - - - V A A A A A A A K E MG C E A Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V S P I NG N T H T S A F H R V Q P WA P A T A A G K D K A D E I S K K N A V A T A A A A A A A A A A A A K E NG G E A Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E C T Q I K VG A H S S I R I P P A S S G L L E R S VG L S P N L Q DS S - - - - - - - - - - I S QQ C A I P I DDR F S V N K L P L H I P F V DV S T T K L DA S F S AG S S S V - - - K HS S F Q P L P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - C DHHN N HA S Y N L V HV - - - P DS K S A V K HL Q HS A F Q P VQ N T I L A DF A - - - - - - - - N A N - - - - - - - - - T I L A HP S AMP P Q VQ I Q N HHY Y Y HHHV HN - - - - - - - P I N K P A V N A H S C S A F Q P V Q HG H T S S L Q A M V P G T Q D T A K - - - - - - - - - A A V G Q A R A M HQ K F Q V Q H H H H H Y H H H H H H V L S L - - - A E A S T T K F L Y Q T S A F Q P I K N S L MC T S QQ V V S H N N E DT T - - - - - - - - - T I L A P P K - I DKG S A T Q - - DF H H H Y E N H S N V A N - - - ●



710

720

730

740

750

760

- - - - - - - - - - - - - S K H P C A A A H D A NG G - - - - - S A G G T A Q S S L V N P S G P V E G - - H A A N Y - - - G S N S - - - - - - - - - - - - - S K R P C A A A H D T NG G - - - - S S A G G T A Q S N V V N P S G P V E G - - H A A N Y - - - G S N S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S K R P C A A A H D A NG G - - - - S S A G G T A Q S N V V N P S G P V E G - - H A A N Y - - - G S N S - - - - - - - - - - - - - S K H P C A A A H D A NG G - - - - S S A G G T A Q S N V I N P S G P V E G - - H A A N Y - - - G S N S - - - - - - - - - - - - - S K H P C A A A D D V NG G - - - - - S A G G T A Q S S V V N P S G P V E G - - H A A N Y - - - G S N S - - - - - - - - - - - - - S K HP C A A A HDA S GG - - - - - S AGG T AQ S S L V N P S G P V E G - - HA A N Y - - - G S N S V A P E Q DM DQ K G K F P E R V T V L P S E S L I A A D R S K C G T R S S G S T M L L - L S D T E - - - R H S K Y L K F G V A S - - - - - - - - - - - - - A E R K - - - - - - - - - - - - - - K L P P Q C G S S N V Y N - - E T I E G N N N T V N Y S V NG S V S - - - - - - - - - - - - - I S Q Q Q I R I H D D L A L T NM A K S A P Q C G S S N V L N - - A P V E G - - Y A C N H S L NG S A S - - - - - - - - - - - - - Q Q R Q Q L L N A D A S S L R N A V E T A P D C G T S DM V G - - T P V E G - - N A A N Y - - - G S A S - - - - - - - - - - - - - MQ HQ L P P E H D A E S S K E M T V V A P H C G S S NM V K - - G P V E G - - N T G N Y S I N R S A S ●

567 568 469 568 568 582 313 566 611 658 669 636 ●

dN/dS

4

2

0 500

750

amino acid position

CONSTANS motif

770

780

790

800

810

820

830

840

850

860

870

568 G S N N N T N - - - - - - - - NG S T A A T A A G A A A A V H A E T - - - - - - - - - - - - - - - G G I D K R S N - - MM HM K R E R R V A A V N K F R E K - - - R K E R N F G K K V R Y Q S R K R L A E Q R P R V R G Q F PPD-D1_3 569 G S N N N T N - - - - - - - - NG S T A A T - - - A A A A V H A E T - - - - - - - - - - - - - - - G G I D K R S N - - MM HM K R E R R V A A V N K F R E K - - - R K E R N F G K K V R Y Q S R K R L A E Q R P R V R G Q F PPD-D1_2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - PPD-D1_1 569 G S N N N T N - - - - - - - - NG S T A A T - - - A A A A V H A E T - - - - - - - - - - - - - - - G G I D K R S N - - MM HM K R E R R V A A V N K F R E K - - - R K E R N F G K K V R Y Q S R K R L A E Q R P R V R G Q F ABL09477.1 [T.a.] 569 G S N N N T N - - - - - - - - NG S T A A T A S G A A A A V H A E T - - - - - - - - - - - - - - - G G I D K R S N - - MM HM K R E R R V A A V N K F R E K - - - R K E R N F G K K V R Y Q S R K R L A E Q R P R V R G Q F BAM93381.1 [T.m.] 583 F S N N N T N - - - - - - - - NG S T A A T - T A A A A A V H A E T - - - - - - - - - - - - - - G G G V D K R S N - - MM NM K R E R R V A A V N K F R E K - - - R K E R N F G K K V R Y Q S R K R L A E Q R P R V R G Q F ACL78560.1 [H.v.] 314 G S N N N T N - - - - - - - - NG S T A A T A A G A A A A A H A E T - - - - - - - - - - - - - - - G G I D K R S N - - MM HM K R E R R V A A V N K F R E K - - - R K E R N F G K K V R Y Q S R K R L A E Q R P R V R G Q F ADR51713.1 [S.c.] 567 N S R HG I D E M V - - - - - NG S F N - - - Y NG G A S V P E Q N D V Y D F G N S K L HG G F N S S S C N F DG - - - - - - - - - - L L N S I I K V E N D - - - - - - - - - - - D V P F A D N D L G C E L F P - - - - - ALT32070.1 [L.p.] 612 G S G HG S N - - - - - - G P Y G S S NG M - N A G G M NMG S D NG A - - G K NG N - G DG S G S G S G S G S G N L A D E N K I S Q R E A A L T K F R Q K - - - R K E R C F R K K V R Y Q S R K K L A E Q R P R V R G Q F NP_568107.1 [A.t.] XP_010658157.1 [V.v.] 659 G S N HG S N - - - - - - G Q NG S T T A V - N A Q G T NM E S D DG I - - A G K G G A G G G S G S G S G S R S G - - V DQ NQ Y A Q R E A A L N K F R Q K - - - R K E R C F E K K V R Y Q S R K R L A E Q R P R I R G Q F XP_004237533.1 [S.l.] 670 G S N NG S NG Q NG S S G Q NG S S T A V - V A E G T N L V A E N E T - - G E K C E I - - G S G S G S A T R S G - - - - - D H S A Q R E A A L I K F R Q K - - - R K E R C F E K K V R Y Q S R K R L A E Q R P R M R G Q F XP_013468266.1 [M.t.] 637 G S N HG S N - - - - - - G Q NG S S T A I - N A G G T N I D N N NG L - - A G N S - - - - G S G D A S G NG S G N R V DQ S K N F Q R E A A L I K F R Q K R K E R K E R C F H K Q V R Y Q S R Q K L A E Q R P R Y R G Q F

6













dN/dS

4

2

0 750

amino acid position

●●







880 V R L P L R DNL V R L P L R DNL - - - - - - - - V R L P L R DNL V RQ P - - - - V RQ P - - - - V RQ A - - - - - - - - LG - - VRKT - - - - VRRV - - - - V RQ D - - - - V RQ S - - - - -

890 P P HT - - - P P HT - - - - - - - - - - P P HT - - - P P P AA - - P AP AA - - AP P AA - - - - - - - - - A A A T DDND F HD I NS E D A DK S K S NN S NG N A S E A

I -

- - - - - - - - KN - - - -

I -

- - - - - - - - VER VER VER AC I E DS A DS T NS T DS

662 660 660 662 676 407 646 727 769 781 748