projet pedagogique.pdf

Magist`ere de Biotechnologies – Sciences et Technologies du Vivant Universit´e ParisXI / ENS de Cachan

Cr´ eation d’un projet d’enseignement universitaire

Les Interactions Plantes / Pathog` enes

Caroline Roullier et Pierre Abadie Ann´ee 2006–2007

Table des mati` eres 1 Introduction g´ en´ erale

2

2 Pr´ esentation des objectifs p´ edagogiques et du contenu du module 2.1 Une approche plurisdisciplinaire de la phytopathologie . . . . . . . . 2.2 Un module de formation `a la recherche . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.3 Un module d’ouverture et de comparaison avec le mod`ele animal . . . 2.4 M´ethodes d’´evaluation des ´etudiants . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.4.1 L’´epreuve orale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.4.2 L’´epreuve ´ecrite . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ´ 2.5 Evaluation du module par les ´etudiants . . . . . . . . . . . . . . . . .

. . . . . . .

2 2 4 5 6 6 6 8

. . . . .

9 9 10 11 11 11

3 Organisation pratique du module 3.1 Emploi du temps . . . . . . . . . . . . . 3.2 Cr´edits ECTS associ´es . . . . . . . . . . 3.3 Moyens humains et mat´eriels . . . . . . . 3.3.1 Ressources humaines n´ecessaires . 3.3.2 Ressources mat´erielles n´ecessaires 4 Conclusion

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . .

. . . . . . .

. . . . .

. . . . . . .

. . . . .

. . . . . . .

. . . . .

. . . . . . .

. . . . .

. . . . . . .

. . . . .

11

1. Introduction g´en´erale

1

Introduction g´ en´ erale

Ce module, intitul´e  Les Interactions Plantes / Pathog`enes , constitue une initiation `a la phytopathologie Il s’agit d’un module court de 2 semaines de cours et travaux dirig´es se situant `a un niveau de Master 1 2`eme semestre de l’Universit´e d’Orsay. Destin´e `a accueillir au maximum 20 ´etudiants, il s’adresse principalement `a des ´etudiants de Master ayant suivis des modules de biologie v´eg´etale, mais est aussi destin´e aux ´etudiants d´esirant pr´eparer les concours de l’enseignement (CAPES et agr´egation) soucieux d’acqu´erir des connaissances sur un sujet g´en´eralement peu trait´e dans leur fili`ere mais appartenant au programme de ces concours. En effet, les objectifs p´edagogiques de ce module sont l’acquisition d’une vue d’ensemble de la phytopathologie, `a travers des enseignements int´egrant diverses disciplines de la biologie, telles que la biologie cellulaire et mol´eculaire, la physiologie v´eg´etale, la microbiologie, la g´en´etique ´evolutive et l’agronomie. Les ´etudiants suivront tout d’abord des cours leur pr´esentant les diff´erentes interactions entre les plantes et les pathog`enes, ce qui devrait leur permettre d’acqu´erir les connaissances de base sur les diff´erents microorganismes pathog`enes et les possibilit´es de d´efense des plantes. Par la suite des cours plus diversifi´es auront pour objectif de montrer les diff´erentes approches pouvant ˆetre mises en place pour ´etudier la phytopathologie. Ce module a aussi pour objectif d’apprendre aux ´etudiants `a analyser des articles scientifiques en anglais, pr´e-requis majeur pour la suite de leur scolarit´e. Par ailleurs, les ´el`eves auront l’occasion d’exercer leur expression orale au cours d’un expos´e `a r´ealiser, ainsi que de parfaire leurs capacit´es de synth`ese et d’analyse lors de l’examen ´ecrit, en vue de la pr´eparation aux concours pour certains.

2

Pr´ esentation des objectifs p´ edagogiques et du contenu du module

2.1

Une approche plurisdisciplinaire de la phytopathologie

Le premier objectif de ce module est de pr´esenter la phytopathologie comme un champ dynamique de la biologie, `a l’interface de disciplines vari´ees. Suite `a l’obtention de leur licence, les ´etudiants ont des connaissances g´en´erales dans des disciplines comme l’´ecologie, la biologie ´evolutive, la biologie cellulaire et mol´eculaire. Ce module est donc l’occasion de voir comment ces diff´erentes approches permettent de r´epondre `a un probl`eme donn´e, celui des interactions plantes pathog`enes. Trop souvent la sp´ecialisation excessive qu’on observe chez les chercheurs les conduit `a occulter l’existence d’autres cadres th´eoriques et exp´erimentaux, pour appr´ehender un mˆeme probl`eme scientifique. Ceci peut conduire `a des distancions entre chercheurs travaillant pourtant sur des probl´ematiques communes, au cloisonnement de leurs activit´es, et donc des connaissances. La dynamique de la recherche en est alors affect´ee.

Projet p´edagogique

2

2006-2007

2.1 Une approche plurisdisciplinaire de la phytopathologie Ce module propose donc aux ´etudiants de continuer `a pratiquer les diff´erentes disciplines dont ils ont d´ej`a les notions de base, dans le cadre d’un probl`eme concret. Suite `a une journ´ee introductive, qui permettra de mettre en place certaines donn´ees centrales de phytopathologie, ainsi que le vocabulaire sp´ecifique, trois approches compl´ementaires seront d´eclin´ees dans le cadre de cours magistraux d’une dur´ee de deux heures : – Une approche m´ecanistique des interactions plantes-pathog`enes : elle donnera sa place `a des disciplines comme la biologie cellulaire et mol´eculaire, la physiologie int´egrative, la biochimie. L’objectif de cette partie sera d’expliquer aux ´etudiants les strat´egies et les m´ecanismes qui permettent aux principaux pathog`enes tels que les bact´eries, les virus, les champignons d’attaquer les plantes, et quels sont en retour les m´ecanismes de d´efense dont dispose la plante pour parer ces attaques. – Une approche ´evolutive et ´epid´emiologique des interactions plantes-pathog`enes : Le couple plante-pathog`ene est un tr`es bon mod`ele pour appr´ehender les ph´enom`enes de co-´evolution et l’´etude de ces interactions `a l’´echelle non plus des m´ecanismes et des individus mais des populations permet d’´eclairer des questions fondamentales de biologie ´evolutive. Dans ce module, l’apport de la mod´elisation math´ematique de l’´evolution de la virulence des pathog`enes sera abord´e. De plus, la compr´ehension de la r´eponse des populations hˆotes et pathog`enes en terme de diversit´e et de structuration est tout `a fait fondamentale dans la lutte contre les maladies des plantes. La g´en´etique des populations ainsi que l’´epid´emiologie seront donc pr´esent´ees au cours de ce module. – Enfin une approche agronomique : ce module ne s’adresse pas uniquement aux ´etudiants voulant continuer dans la recherche, mais aussi `a ceux qui voudraient poursuivre leurs ´etudes dans des voies plus professionnelles et appliqu´ees, dans le domaine de la protection des cultures par exemple (3`eme ann´ee de sp´ecialisation des ´ecoles d’Agronomie). En effet, la question des interactions plantes-pathog`enes pose des probl`emes agronomiques concrets en terme de s´ecurit´e alimentaire, en terme d’environnement dont il nous semble essentiel que ce module de phytopathologie rende compte. Pour ce faire, les ´etudiants devront r´ealiser un travail de recherche bibliographique, restitu´e sous forme d’un oral de 20 minutes, autour des strat´egies de lutte contre les maladies des plantes. Chaque groupe (cinq au total) se verra attribuer un r´ef´erant, chercheur sp´ecialiste de la m´ethode de lutte en question. La restitution des expos´es se fera sous forme d’une table ronde, avec si possible la pr´esence des tuteurs. Il sera demand´e aux ´etudiants de r´efl´echir aux avantages, inconv´enients et limites des techniques de lutte choisies, et surtout d’illustrer leur r´eflexion par des exemples concrets. De plus, un cours magistral sera consacr´e au probl`eme de la gestion des ressources phytog´en´etiques et de la conservation de la biodiversit´e, en tant que source in´epuisable de r´esistance face aux agressions pathog`enes. Les cons´equences de l’agriculture moderne et de la s´election vari´etale sur le d´eveloppement et l’expansion des maladies de plantes seront abord´ees. L’importance des ancˆetres sauvages des plantes cultiv´ees en terme de source de r´esistance sera aussi d´emontr´ee. Nous esp´erons ainsi que les ´etudiants puissent alors d´evelopper un esprit critique et une position argument´ee sur des d´ebats soci´etaux Projet p´edagogique

3

2006-2007

2.2 Un module de formation `a la recherche autour de la gestion durable des agro-syst`emes (exemple : d´ebats autour des OGMs et de l’utilisation de produits phytosanitaires)

2.2

Un module de formation ` a la recherche

La license 3 donne aux ´etudiants les connaissances de bases et les outils intellectuels pour comprendre et r´efl´echir sur un probl`eme scientifique donn´e. Par contre, la confrontation avec la recherche et donc la production de connaissance est encore faible `a ce niveau universitaire. Le Master 1 doit donc ˆetre une ann´ee de familiarisation et d’initiation au monde et `a l’esprit de la recherche. La premi`ere chose `a maˆıtriser pour p´en´etrer le monde des chercheurs, c’est leur langage et c’est donc d’ˆetre capable de comprendre et analyser des articles scientifiques. Nous avons donc d´ecid´e que les cours magistraux (2h) seraient le plus souvent accompagn´es d’une lecture/analyse d’article (1h) anim´ee par le chercheur intervenant (s’il est d’accord) ainsi que les organisateurs du module. Les ´etudiants devront pr´eparer en groupe un article en particulier mais lire l’ensemble des articles propos´es. Une journ´ee en d´ebut de module sera de toute fa¸con destin´ee `a la lecture guid´ee de ces articles, en compagnie des organisateurs du module. Une fiche de lecture sera distribu´ee aux ´etudiants (une par article) pour les aider `a organiser leur analyse, et pour guider la discussion subs´equente. Les objectifs de ces lectures sont alors que les ´etudiants : 1. se familiarisent avec l’anglais scientifique. 2. soient capables de mettre en perspective une probl´ematique scientifique. 3. d´ecouvrent un certain nombre de m´ethodes et techniques de recherche couramment utilis´ees en laboratoire. 4. testent leur capacit´e d’analyse des r´esultats. 5. r´efl´echissent sur l’interpr´etation et les questions soulev´ees par les r´esultats, et prennent conscience que la recherche ne se construit que dans le questionnement, et que tout r´esultat doit amener `a de nouvelles questions. Les articles choisis sont les suivants : – Pour le cours sur les bact´eries : Feng Shao, Peter M. Merritt, Zhaoqin Bao, Roger W. Innes, and Jack E. Dixon. 2002, in Cell. A Yersinia Effector and a Pseudomonas Avirulence Protein Define a Family of Cysteine Proteases Functioning in Bacterial Pathogenesis. Vol. 109, 575-588. – Pour le cours sur les virus : Hongwei Li, Wan Xiang Li, Shou Wei Ding. 2002, in Science. Induction and Suppression of RNA Silencing by an Animal Virus. Vol. 296, 1319-1321. – Pour le cours sur les champignons : Rejane L. Guimaraes, Roger T. Chetelat and Henrik U. Stotz. 2004, in European Journal of Plant Pathology. Resistance to Botrytis cinerea in Solanum lycopersicoides is dominant in hybrids with tomato, and involves induced hyphal death. Vol. 110, 13-23.

Projet p´edagogique

4

2006-2007

2.3 Un module d’ouverture et de comparaison avec le mod`ele animal – Pour le cours d’´epid´emiologie : David M. Gadoury, Robert C. Seem, Andrea Ficke, and Wayne F. Wilcox. 2001, in The American Phytopathological Society. The Epidemiology of Powdery Mildew on Concord Grapes. Vol. 91, 948-955. – Pour le cours sur la co´evolution hˆote-pathog`ene : Fran¸cois Delmotte, Erika Bucheli and Jacqui A. Shykoff. 1999, in Heredity. Host and Parasite Population Structure in a Natural Plant-Pathogen System. Vol. 82, 300-308.

2.3

Un module d’ouverture et de comparaison avec le mod` ele animal

Enfin, un objectif p´edagogique central de ce module est de faire un pont entre les recherches sur les interactions plantes-pathog`enes et celles sur les interactions animaux-pathog`enes. La recherche avance vite dans la compr´ehension des interactions pathog`enes-cellules animales dans la mesure o` u les r´esultats de ces travaux ont des applications concr`etes en sant´e publique, sant´e humaine, et donc beaucoup de laboratoires travaillent sur ces th´ematiques, et ce avec des moyens importants. La biologie v´eg´etale marche trop souvent derri`ere. Ce module d´esire donc r´ehabiliter la phytopathologie aupr`es de ceux qui pourraient avoir oubli´e que les plantes aussi se font attaquer et se d´efendent, et que ces modes d’interactions plantes-pathog`enes ont bien des points communs avec le mod`ele animal. Il ne s’agira pas dans ce module de faire un cours d’immunologie animale, mais d’essayer le plus souvent possible de comparer les deux mod`eles et ceci pour donner une perspective ´evolutive `a cette probl´ematique des m´ecanismes d’interactions entre les cellules eucaryotes et leurs pathog`enes. Ainsi, ce module n’est pas uniquement destin´e aux ´etudiants qui voudraient poursuivre en M2 de phytopathologie. Il pourrait aussi int´eresser d’autres profils d’´etudiants. Tout d’abord, ce module peut toucher les ´etudiants pr´eparant les concours de l’enseignement (CAPES-agr´egation). Les sujets de synth`ese de l’agr´egation (´ecrits, oraux), comme les sujets sur documents du CAPES font souvent appel `a des connaissances transversales et comparatives entre le monde animal et v´eg´etal. De plus, comme le montre le programme de sp´ecialit´e de l’agr´egation secteur A de l’ann´ee 2005/2006, la biologie v´eg´etale et notamment la physiologie mol´eculaire des plantes, prend une importance consid´erable. Enfin, ce module aimerait aussi attirer des ´etudiants voulant se sp´ecialiser en recherche en immunologie, puisque cette vision globale de l’immunit´e et notamment sa dimension ´evolutive est essentielle `a tous futurs chercheurs dans ce domaine. Pour ce faire, les articles discut´es `a la suite des cours seront le plus possible transversaux, et il sera demand´e aux intervenants d’int´egrer au mieux des donn´ees comparatives avec le mod`ele animal. Une apr`es-midi de discussion autour d’un article intitul´e  Innate immunity in plants and animals : striking similarities, and obvious differences  (N¨ urnberg et al. ; 2004), sera l’occasion de faire un bilan comparatif pr´ecis des m´ecanismes d’interactions plantes/animauxpathog`enes dans l’immunit´e inn´ee. La discussion sera ´etendue `a l’immunit´e adaptative par les enseignants. L’emploi du temps m´enage une demi-journ´ee pour lire en profondeur cet article. Si cette orientation du module plaˆıt aux ´etudiants, il sera envisag´e les ann´ees suivantes de donner Projet p´edagogique

5

2006-2007

2.4 M´ethodes d’´evaluation des ´etudiants plus de place `a cette dimension comparative et ´evolutive, voir mˆeme d’´elaborer un module complet sur ce th`eme.

2.4

M´ ethodes d’´ evaluation des ´ etudiants

L’´evaluation des ´etudiants passe par une ´epreuve orale et une ´epreuve ´ecrite. 2.4.1

L’´ epreuve orale

L’´epreuve orale consistera en un expos´e sur diaporama de 20 minutes sur un sujet choisi parmi une liste que nous leur fourniront en d´ebut de module. Nous avons d´ecid´e d’axer ces expos´es sur les diff´erentes m´ethodes de lutte contre les pathog`enes des plantes. Les th`emes `a d´evelopper sont les suivants : 1. Les m´ethodes de lutte chimique contre les pathog`enes des plantes. 2. Les m´ethodes de lutte biologique contre les pathog`enes des plantes. 3. L’am´elioration vari´etale et la lutte contre les pathog`enes des plantes. 4. Les organismes g´en´etiquement modifi´es et la lutte contre les pathog`enes des plantes. 5. Les m´ethodes de lutte prophylactique contre les pathog`enes des plantes. Le module pouvant accueillir 20 ´etudiants, il y aura donc 5 groupes de 4 ´el`eves pour r´ealiser ces expos´es. Cette ´epreuve orale sera not´ee coefficient 1. Ces oraux permettront d’avoir un aper¸cu des possibilit´es de lutte, avec des th`emes multidisplinaires (biologie cellulaire et mol´eculaire, agronomie, . . .) 2.4.2

L’´ epreuve ´ ecrite

D’une dur´ee de 2 heures, l’´epreuve ´ecrite sera s´epar´ee en deux parties, chacune comptant coefficient 1 : – Une premi`ere partie d’une heure consistera en une question de synth`ese simple visant `a ´evaluer les capacit´es d’organisation et de retransmissions des connaissances. Le sujet `a traiter sera : ” Les m´ecanismes de d´efense des plantes. En deux pages maximum, vous pr´esenterez les modalit´es de r´esistances passives ou actives des plantes face aux pressions pathog`enes.” Cette partie sera not´ee sur 10 points. 2 points seront attribu´es `a la pr´esentation et aux illustrations, 3 points au plan et 5 points au contenu. – La deuxi`eme partie de l’´epreuve visera `a ´evaluer les capacit´es d’analyse scientifiques de l’´etudiant, via des questions br`eves sur des figures extraites d’articles. Le sujet est d´etaill´e par la suite.

Projet p´edagogique

6

2006-2007

2.4 M´ethodes d’´evaluation des ´etudiants ´ Le th`eme du sujet sur document est : ”Etude de l’origine g´en´etique de la r´esistance aux fongicides chez le champignon Blumeria graminis responsable de l’o¨ıdium des c´er´eales”. Il se base sur l’article intitul´e ”Sequence variation in the CYP51 gene of Blumeria graminis associated with resistance to sterol demethylase inhibiting fungicides” (R. A. Wyand and J.K.M Brown, in Fungal Genetics and Biology). Le r´esum´e de l’article est fourni aux ´el`eves :

Par la suite, des questions simples sont pos´ees sur des figures extraites de l’article :

` partir de vos observations des – D´ecrivez bri`evement les diff´erentes colonnes du tableau. A colonnes 3 et 4, Que pouvez-vous d´eduire de la relation entre le g`ene consid´er´e et la r´esistance au fongicide triadim´enol ? (10 lignes maximum) [4pts]

Projet p´edagogique

7

2006-2007

´ 2.5 Evaluation du module par les ´etudiants

– Cette figure repr´esente le nombre de descendants (axe des ordonn´ees) issus d’un croisement entre un parent, moyennement r´esistant au triadim´enol, et un parent B, fortement r´esistant. Ces descendants sont class´es en fonction de leur intensit´e de r´esistance (axe des abscisses). D´ecrivez bri`evement les r´esultats obtenus. Que pouvez-vous en d´eduire sur le caract`ere monog´enique ou polyg´enique de la r´esistance au triamid´enol chez ce champignon (justifier) ? (15 lignes maximum) [6pts] – [Question g´en´erale] Sachant que le triamid´enol est un inhibiteur de d´em´ethylase, et que le g`ene CYP51 code pour une enzyme impliqu´ee dans la d´em´ethylation pour la synth`ese de st´erols du champignon, formulez une hypoth`ese sur le mode d’action du triam´edinol, et sur le m´ecanisme de r´esistance du champignon (5 lignes maximum). [5pts] – [Question g´en´erale] Citer 2 autres cibles cellulaires potentielles des fongicides (5 lignes maximum). [5pts] Il s’agit d’un sujet assez simple et r´ealisable en 1 heure. Le point de d´epart des r´eponses aux questions des figures ´etant fourni dans le r´esum´e de l’article, l’accent sera mis sur la justification des r´eponses. Les questions 3 et 4 visent `a ´elargir le cadre de l’article et font appel `a une r´eflexion plus personnelle sur le sujet.

2.5

´ Evaluation du module par les ´ etudiants

Afin de permettre aux ´etudiants de nous donner un retour de leurs impressions `a propos de ce module, une petite r´eunion apr`es les ´epreuves ´ecrites sera consacr´ee `a une discussion. Un questionnaire leur sera fourni avec les questions suivantes : – Qu’avez-vous pens´e de la clart´e des cours magistraux dispens´es ? – Le niveau et le contenu du module ´etait-il bien adapt´e `a votre cursus ? – Y a-t-il eu d’apr`es vous une surcharge de travail en dehors des heures de pr´esence ? – Ce module vous a-t-il permis d’avoir une vision globale de la phytopathologie, en pr´evision de vos ´etudes futures ?

Projet p´edagogique

8

2006-2007

3. Organisation pratique du module

3 3.1

Organisation pratique du module Emploi du temps

Le module est s´epar´e en deux semaines cons´ecutives, chacune correspondant `a des objectifs p´edagogiques diff´erents. La premi`ere semaine (figure 1) vise `a pr´esenter les diff´erentes interactions qui existent entre les plantes et les pathog`enes, alors que la deuxi`eme semaine (figure 2) a pour objectif de donner un aper¸cu des diff´erentes approches possibles en phytopathologie. C’est aussi la semaine des examens (oraux et ´ecrits).

Fig. 1 – Emploi du temps de la premi`ere semaine La premi`ere journ´ee est une journ´ee de pr´esentation et d’introduction `a la phytopathologie, avec le cours sur la pr´esentation g´en´erale des interactions plantes/pathog`enes, suivi l’apr`esmidi des travaux dirig´es d’´etiologie sur la reconnaissance et l’interpr´etation des symptˆomes. La journ´ee suivante du mardi est enti`erement consacr´ee `a la lecture des articles, qui s’effectuera en notre pr´esence afin que nous puissons aider et guider les groupes d’´etudiants dans cet exercice ` l’issue de cette journ´ee, les ´etudiants auront une bonne base auquel ils ne sont pas habitu´es. A pour r´ealiser leur pr´esentation, et le finalisation de leur expos´e ne leur demandera pas beaucoup de travail suppl´ementaire. Les deux journ´ees suivantes (mercredi et jeudi) sont consacr´ees `a des cours magistraux pr´esentant les principaux pathog`enes des plantes (champignons - bact´eries - virus) et les m´ecanismes d’interaction avec leur hˆote. L’apr`es-midi du jeudi est laiss´ee libre aux ´etudiants pour leur permettre de r´eviser les cours pr´ec´edents. ` La journ´ee du vendredi d´ebute par un cours sur les m´ecanismes de r´esistance des plantes. A l’issue du vendredi midi, les ´etudiants auront donc suivi les cours classiques en phytopathologie, `a la fois ”cˆot´e parasite” et ”cˆot´e plante”. Il s’ensuit une apr`es-midi d’ouverture vers le monde animal, grˆace `a une discussion que nous animerons autour de l’article sur la comparaison des m´ecanismes de l’immunit´e entre le monde animal et v´eg´etal. Cette discussion sera profitable aux ´etudiants d´esirant pr´eparer l’ann´ee suivante les concours du CAPES ou de l’agr´egation.

Projet p´edagogique

9

2006-2007

3.2 Cr´edits ECTS associ´es

Fig. 2 – Emploi du temps de la deuxi`eme semaine La deuxi`eme semaine s’attache `a montrer la diversit´e des m´ethodes pouvant ˆetre utilis´ees en phytopahologie. La journ´ee du lundi est consacr´ee `a l’approche ´evolutive des relations plantes/pathog`enes : le cours sur la co´evolution aura lieu le matin, et le cours sur l’´evolution des r´esistance l’apr`es-midi. Le cours d’´epid´emiologie de terrain est pr´evu le lendemain. Le mardi apr`es-midi et le mercredi matin sont lib´er´es afin que les ´etudiant puissent terminer de pr´eparer leur examen oral consacr´e aux diff´erentes m´ethodes de lutte contre les pathog`enes des plantes qui a lieu le mercredi apr`es-midi. Le jeudi est une journ´ee d’ouverture vers l’agronomie, avec le matin le cours sur l’am´elioration vari´etale, et vers des questions d’´ecologie et d’environnement avec les cours sur la gestion de la biodiversit´e pr´evu l’apr`es-midi. L’examen ´ecrit de deux heures est pr´evu au matin de la derni`ere journ´ee du module, et est suivi d’une petite r´eunion de discussion afin que nous puissons avoir un retour sur les impressions des ´el`eves au cours de ces deux semaines. Notons que les ´el`eves auront ´et´e pr´evenus que le sujet de la dissertation porterait sur les cours de la premi`ere semaine, ce qui leur laissera assez de temps pour r´eviser. Au niveau des horaires, ce module doit comporter 50 heures de cours/TDs. En r´ealisant des cours magistraux de 3 heures 30 chacuns, cela correspond `a 11 (2 le lundi, 2 le mercredi, 1 le jeudi et 1 le vendredi pour la premi`ere semaine, 2 le lundi, 1 le mardi et 2 le jeudi pour la deuxi`eme semaine) ×3 = 38, 5 heures de cours. Pour les travaux dirig´es, en comptant 5 heures 30 le mardi, 3 heures le vendredi apr`es-midi pour la premi`ere semaine, et 3 heures le mercredi pour la deuxi`eme semaine, on aboutit `a 11h30 de travaux dirig´es. L’ensemble cours/TDs fait un total de 50h. Les horaires des journ´ees seront donc g´en´eralement 9h–12h le matin et 13h30–17h l’apr`es-midi, ce qui laisse un peu de temps aux ´etudiants pour travailler le soir.

3.2

Cr´ edits ECTS associ´ es

Ce module rentre dans la cat´egorie ”module court” de Master de l’Universit´e d’Orsay : la validation du module au cours des examens permettra donc au ´etudiants de valider 5 ECTS sur les 60 ECTS n´ecessaires `a l’obtention de leur master. Projet p´edagogique

10

2006-2007

3.3 Moyens humains et mat´eriels

3.3

Moyens humains et mat´ eriels

3.3.1

Ressources humaines n´ ecessaires

Les intervenants que nous aimerions solliciter pour les cours magistraux sont les suivants : – Les interactions plantes-bact´eries : Dominique Expert (DR CNRS, INA-PG) – Les interactions plantes-champignons : Richard Laug´e (CR INRA, IBP) – Les interactions plantes-virus : Isabelle Jupin (DR CNRS, Institut Jacques Monod) – Les m´ecanismes de r´esistance des plantes : Patrick Saindrenan (DR CNRS, IBP) – Etude th´eorique de la co´evolution hˆote-pathog`ene : Minus Van Ballen (CR CNRS, ENS Paris) ´ – Evolution de la r´esistance et de la virulence : Marie-France Corio-Costet (DR INRA, INRA Bordeaux) – Epid´emiologie de terrain : Claude Pope de Vallavieille (DR INRA, INA-PG) La disponibilit´e des intervenants est une condition n´ecessaire au bon d´eroulement du module, c’est pourquoi le contact sera pris au moins trois mois auparavant. Toutefois, nous serons en mesure d’assurer un cours en cas de d´esistement impromtu. Un relai est pr´evu entre nous afin que nous puissions assister `a tous les cours dispens´es par les intervenants. 3.3.2

Ressources mat´ erielles n´ ecessaires

Ce module accueillant au maximum 20 ´etudiants, une petite salle de classe devra ˆetre r´eserv´ee pour 2 semaines. Un r´etroprojecteur devra ˆetre emprunt´e pour ce module afin de permettre la pr´esentation des diaporamas des enseignants et des ´el`eves. Un espace web personnel sera mobilis´e pour mettre en ligne les diaporamas des cours dispens´es, ainsi que les articles ´etudi´es.

4

Conclusion

Nous proposons donc un module de Master 1, d’une dur´ee de deux semaines au cours du second semestre, sur le th`eme des interactions plantes-pathog`enes. Ce module pourra accueillir une vingtaine d’´etudiants au total, et s’adresse `a des ´etudiants aux profils divers, des ´etudiants en biologie v´eg´etale et agronomie, aux ´etudiants pr´eparant les concours de l’enseignement, et aussi `a tous les curieux qui s’int´eressent aux questions des interactions en biologie et `a la notion d’immunit´e. Le premier objectif de ce module est la pluridisciplinarit´e. Nous souhaitons qu’au cours de ces deux semaines les ´etudiants fassent un tour d’horizon des diff´erentes disciplines qui apportent un ´eclairage particulier `a la probl´ematique des interactions plantes pathog`enes. Ainsi, ils pourront r´einvestir les connaissances g´en´erales acquises au cours de leur licence pour raisonner sur un probl`eme biologique concret, et acqu´erir l’ouverture d’esprit n´ecessaire `a une carri`ere Projet p´edagogique

11

2006-2007

4. Conclusion de chercheur mais aussi d’enseignant ou d’ing´enieur, technicien en agronomie. Peut ˆetre que le programme de ces deux semaines est un peu ambitieux, et il sera important d’´evaluer suite `a la premi`ere ´edition du module, l’efficacit´e de cette approche et ce que les ´etudiants en ont retenu. Nous sommes conscients que tous les ´el`eves inscrits au module n’ont pas forc´ement la mˆeme formation initiale et les mˆemes connaissances, et nous essaierons au mieux d’en tenir compte pour l’´elaboration des groupes de lecture et d’analyse d’articles. En outre, le champ de la phytopathologie ayant une implication directe dans des questions agronomiques et environnementales, nous voulons qu’`a la suite de ce module, les ´etudiants aient les moyens d’avoir une vision ´eclair´ee et argument´ee, qui leur permettent de prendre position pour l’´elaboration et le d´eveloppement d’une agriculture durable. Les questions agronomiques sont trop souvent laiss´ees pour compte dans les formations universitaires de recherche, et il nous parait pourtant crucial que l’universit´e, en plus de former des futurs sp´ecialistes, doit aussi former des citoyen capables de s’engager dans les d´ebats de soci´et´e actuels. L’objectif d’un module de M1 est aussi l’initiation `a la recherche. Au-del`a de l’importance de cette premi`ere prise de contact pour les ´etudiants qui souhaiteraient poursuivre dans cette voie, il est tout `a fait important que des futurs enseignants, comme des futurs ing´enieurs aient ´et´e familiaris´es avec cet univers, et puissent alors continuer `a interagir avec les chercheurs. Enfin, nous proposons au cours de ce module d’´elargir la r´eflexion au mod`ele animal. Puisque  rien n’a de sens en biologie, qu’`a la lumi`ere de l’´evolution  (Theodosius Dobzhansky, 1973), nous avons souhait´e que les ´etudiants aient l’opportunit´e de comparer les points communs et les diff´erences dans les m´ecanismes d‘interactions entre les pathog`enes et leurs hˆotes animaux et v´eg´etaux, et qu’ils donnent ainsi une perspective ´evolutive `a leur r´eflexion sur les interactions pathog`enes-cellules eucaryotes.

Projet p´edagogique

12

2006-2007