Supplemental Table 1

Download PDF
3 downloads 0 Views 75KB Size Report
Comment
Supplemental Table 1. Agilent probes used for CIN70 analysis. Probe ID. Gene. Probe ID. Gene. A_23_P131865. AURKA. NM_014791_1_2145. MELK.
   

Supplemental  Table  1.  Agilent  probes  used  for  CIN70  analysis   Probe  ID   A_23_P131865   A_23_P131866   NKI_NM_003600   NM_003600_1_2022   NM_003600_1_2082   A_23_P68608   A_23_P68610   NM_012112_2_2787   NM_012112_2_3332   A_23_P206050   A_23_P206059   NKI_NM_003981   NM_003981_1_2856   NM_003981_1_2900   A_23_P151145   NM_021953_1_2813   NM_021953_1_3088   A_23_P138504   A_23_P138507   A_32_P87849   A_32_P87852   NM_001786_2_892   A_23_P102582   A_23_P102585   A_24_P194184   A_23_P79791   A_23_P79794   A_23_P250801   A_23_P250808   A_32_P103633   A_23_P133143   A_23_P133146   A_23_P133147   A_24_P354468   A_32_P159268   A_32_P159271   A_23_P118832   A_23_P118834   NM_001067_2_5423   NM_001067_2_5468   A_23_P28883   A_23_P28886   NM_002592_1_533   NM_002592_1_578   A_23_P143207   A_24_P297539   NM_007019_1_406   A_23_P94419   A_23_P94422   NKI_NM_014791  

Gene   AURKA   AURKA   AURKA   AURKA   AURKA   TPX2   TPX2   TPX2   TPX2   PRC1   PRC1   PRC1   PRC1   PRC1   FOXM1   FOXM1   FOXM1   CDC2   CDC2   CDC2   CDC2   CDC2   C20orf24   C20orf24   C20orf24   TGIF2   TGIF2   MCM2   MCM2   MCM2   H2AFZ   H2AFZ   H2AFZ   H2AFZ   H2AFZ   H2AFZ   TOP2A   TOP2A   TOP2A   TOP2A   PCNA   PCNA   PCNA   PCNA   UBE2C   UBE2C   UBE2C   MELK   MELK   MELK  

Probe  ID   NM_014791_1_2145   A_23_P167606   A_23_P167607   A_24_P277576   NKI_U96131   NM_004237_2_1999   A_23_P25293   A_23_P25294   A_24_P638455   NM_014865_1_4859   A_23_P93689   A_23_P93690   A_32_P30554   A_32_P30558   A_23_P164826   A_23_P164827   A_23_P99292   A_23_P99293   A_23_P256956   A_24_P243324   A_23_P57376   A_23_P57379   NM_003504_2_1120   A_23_P92439   A_23_P92441   NKI_NM_002358   NM_002358_2_560   A_23_P32706   A_23_P32707   A_32_P119004   A_32_P119007   A_23_P65757   A_23_P65758   A_24_P84712   NKI_NM_004701   NM_004701_2_1403   A_23_P87192   A_23_P87194   A_24_P73158   A_24_P84898   NM_004111_4_2139   A_23_P259586   A_24_P234901   NM_003318_2_2861   A_23_P257861   A_23_P257863   A_24_P328867   A_24_P328872   A_24_P58761   BC002971_1_1748  

Gene   MELK   TRIP13   TRIP13   TRIP13   TRIP13   TRIP13   CNAP1   CNAP1   CNAP1   CNAP1   MCM7   MCM7   MCM7   MCM7   RNASEH2A   RNASEH2A   RAD51AP1   RAD51AP1   KIF20A   KIF20A   CDC45L   CDC45L   CDC45L   MAD2L1   MAD2L1   MAD2L1   MAD2L1   ESPL1   ESPL1   ESPL1   ESPL1   CCNB2   CCNB2   CCNB2   CCNB2   CCNB2   FEN1   FEN1   FEN1   FEN1   FEN1   TTK   TTK   TTK   CCT5   CCT5   CCT5   CCT5   CCT5   CCT5    

Page  1  of  3  

   

 

Probe  ID   A_23_P18192   A_23_P18196   NKI_NM_002916   NM_002916_1_1340   A_23_P216060   A_23_P216068   A_24_P59596   NKI_NM_014109   NM_014109_2_4032   NM_014109_2_4718   A_23_P135977   A_23_P135979   A_24_P300841   A_24_P6710   A_32_P51084   A_23_P149195   A_23_P149196   A_23_P149200   NM_001255_1_1403   NM_001255_1_1579   A_23_P71727   A_23_P71728   NKI_NM_001827   NM_001827_1_441   A_23_P136222   A_24_P225616   A_24_P234196   NKI_Contig41413_RC   NM_001034_1_2330   A_23_P136213   A_23_P208470   A_23_P208474   A_23_P208477   A_23_P388681   A_32_P200164   A_32_P200165   A_23_P122193   A_23_P122197   A_23_P87349   A_23_P87351   A_23_P130173   A_23_P130182   NM_004217_1_474   A_23_P102200   A_23_P102202   A_23_P259641   A_23_P259643   A_32_P122579   A_32_P122580   NKI_NM_004456  

Gene   RFC4   RFC4   RFC4   RFC4   ATAD2   ATAD2   ATAD2   ATAD2   ATAD2   ATAD2   chTOG   chTOG   chTOG   NUP205   NUP205   CDC20   CDC20   CDC20   CDC20   CDC20   CKS2   CKS2   CKS2   CKS2   RRM2   RRM2   RRM2   RRM2   RRM2   RRM2   ELAVL1   ELAVL1   ELAVL1   ELAVL1   ELAVL1   ELAVL1   CCNB1   CCNB1   RRM1   RRM1   AURKB   AURKB   AURKB   MSH6   MSH6   EZH2   EZH2   EZH2   EZH2   EZH2  

Probe  ID   NM_004456_3_2455   NM_004456_3_2590   A_23_P21703   A_23_P21706   NKI_NM_001905   NM_001905_1_2389   NM_001905_1_2598   A_23_P137143   A_23_P137144   A_23_P379614   A_23_P379615   A_23_P373   A_23_P375   NM_018101_1_1620   NM_004219_2_4   A_23_P115872   A_23_P115873   NM_018131_2_2531   A_23_P319432   A_23_P47370   A_24_P38895   A_24_P38896   A_23_P48014   A_32_P73041   A_32_P73045   A_23_P258754   A_23_P415443   A_23_P415444   BC024211_1_1961   A_23_P161473   A_23_P161474   A_24_P412088   A_23_P153755   A_23_P153757   A_24_P224776   NM_012321_1_632   A_23_P414343   A_23_P119253   A_23_P119254   NM_018154_1_937   A_23_P63789   A_23_P63790   A_24_P299503   A_23_P82699   A_32_P62997   A_23_P112672   A_23_P112673   A_23_P162476   A_23_P162479   A_23_P162481  

Gene   EZH2   EZH2   CTPS   CTPS   CTPS   CTPS   CTPS   DKC1   DKC1   OIP5   OIP5   CDCA8   CDCA8   CDCA8   PTTG1   CEP55   CEP55   CEP55   H2AFX   H2AFX   H2AFX   H2AFX   CMAS   CMAS   CMAS   BRRN1   BRRN1   BRRN1   BRRN1   MCM10   MCM10   MCM10   LSM4   LSM4   LSM4   LSM4   MTB   ASF1B   ASF1B   ASF1B   ZWINT   ZWINT   ZWINT   TOPK   TOPK   FLJ10036   FLJ10036   CDCA3   CDCA3   CDCA3    

Page  2  of  3  

   

 

 

 

 

Probe  ID   A_24_P218979   A_23_P44684   A_23_P44685   A_23_P9571   A_23_P9572   A_23_P9574   A_24_P366033   A_24_P366034   NKI_Contig25991   NKI_NM_018098   NM_018098_4_3188   A_23_P49965   A_23_P49972   NM_001254_2_2130   A_23_P76388   A_23_P76391   A_24_P398585   NM_003362_2_1980   A_23_P64008   A_23_P64010   A_24_P934563   A_23_P20462   A_23_P20463   A_32_P195137   A_32_P195138   NKI_NM_006265   NM_006265_1_2935  

Gene   CDCA3   ECT2   ECT2   ECT2   ECT2   ECT2   ECT2   ECT2   ECT2   ECT2   ECT2   CDC6   CDC6   CDC6   UNG   UNG   UNG   UNG   MTCH2   MTCH2   MTCH2   RAD21   RAD21   RAD21   RAD21   RAD21   RAD21  

Probe  ID   NM_006265_1_3043   A_23_P69248   A_23_P69249   A_24_P102125   A_24_P108451   A_23_P250494   A_23_P250499   NM_000175_2_1983   A_23_P77768   A_23_P77776   A_23_P149239   A_24_P376706   A_24_P376707   A_23_P251691   A_23_P251695   A_23_P35214   A_23_P35219   A_24_P319613   A_23_P24444   A_23_P24445   A_23_P140959   A_23_P140960   A_23_P53346   A_23_P53350   A_24_P126628   A_24_P126621    

Gene   RAD21   ACTL6A   ACTL6A   ACTL6A   LOC100133951/GPI   LOC100133951/GPI   LOC100133951/GPI   LOC100133951/GPI   SFRS2   SFRS2   HDGF   HDGF   HDGF   NXT1   NXT1   NEK2   NEK2   NEK2   DHCR7   DHCR7   NDUFAB1   NDUFAB1   TMEM194A   TMEM194A   TMEM194A   TMEM194A    

 

 

 

Page  3  of  3