SUPPLEMENTARY FIGURE (TREE SSU rDNA - S1) - PLOS

Download PDF
1 downloads 0 Views 165KB Size Report
Comment
Myxobolus sandrae. Myxobolus osburni. Henneguya doori. Myxobolus arcticus. Myxobolus cerebralis. Myxobolus kisutchi. Myxidium melleni. BRAIN. Brazil-1.
SUPPLEMENTARY FIGURE (TREE SSU rDNA - S1) PhyML 3.0 (GTR+G+I) Alignment 1

BRAIN Brazil-1 Brazil-2 Myxidium melleni LIVER 89 Myxidium coryphaenoideum Sphaeromyxa hellandi 62 Sphaeromyxa longa 100 Sphaeromyxa zaharoni 100 Soricimyxum fegati Myxidium sp. 100 Myxidium truttae 78 Zschokkella icterica 55 0.2 Myxidium cuneiforme 58 Myxidium hardella 100 Myxidium chelonarum 100 Myxidium scripta Chloromyxum trijugum 82 Chloromyxum truttae 97 Chloromyxum cyprini 100 Chloromyxum auratum Myxidium lieberkuehni 100 Myxobolus sandrae 100 89 Myxobolus osburni 95 90 Henneguya doori 100 Myxobolus cerebralis 83 Myxobolus arcticus 97 66 Myxobolus kisutchi Myxidium giardi Chloromyxum leydigi 100 Sphaerospora ranae Sphaerospora truttae Myxidium incurvatum 89 Myxidium gadi 68 100 Kudoa thyrsites 100 Kudoa yasunagai Ceratomyxa shasta Buddenbrockia plumatellae 100 53 81

Alignment 2

BRAIN LIVER Myxidium melleni Brazil-2 61 97 Brazil-1 Myxidium coryphaenoideum Sphaeromyxa hellandi 62 Sphaeromyxa longa 99 100 Sphaeromyxa zaharoni Soricimyxum fegati Myxidium scripta 100 Myxidium chelonarum 69 Myxidium hardella 100 0.2 Myxidium sp. Myxidium cuneiforme 89 Zschokkella icterica Myxidium truttae Chloromyxum trijugum 94 100 Myxidium lieberkuehni 100 Myxidium giardi Myxobolus cerebralis 100 94 Myxobolus arcticus 89 Myxobolus sandrae 100 100 86 Myxobolus osburni 88 74 Henneguya doori Myxobolus kisutchi Chloromyxum truttae 69 100 Chloromyxum cyprini 100 Chloromyxum auratum Chloromyxum leydigi 100 Sphaerospora truttae Sphaerospora ranae 88 Myxidium incurvatum 67 Myxidium gadi 100 Kudoa thyrsites 100 Kudoa yasunagai Ceratomyxa shasta Buddenbrockia plumatellae 100

Alignment 3

BRAIN Brazil-1 LIVER Brazil-2 Myxidium melleni Soricimyxum fegati 100 Chloromyxum trijugum 100 Myxidium chelonarum 75 Myxidium hardella 69 Myxidium scripta 54 Myxidium sp. 62 Myxidium truttae Myxidium cuneiforme 99 0.2 Zschokkella icterica 96 72 Myxidium coryphaenoideum Sphaeromyxa hellandi 57 Sphaeromyxa longa 100 100 Sphaeromyxa zaharoni Chloromyxum truttae 100 Chloromyxum cyprini 100 Chloromyxum auratum 75 Myxidium lieberkuehni Myxobolus kisutchi 99 74 93 Myxobolus sandrae 93 Myxobolus osburni 79 Henneguya doori 65 100 Myxobolus cerebralis Myxobolus arcticus 88 Myxidium giardi Chloromyxum leydigi 100 Sphaerospora ranae Sphaerospora truttae 96 Myxidium incurvatum 64 Myxidium gadi 100 Kudoa thyrsites 100 Kudoa yasunagai Ceratomyxa shasta Buddenbrockia plumatellae 99 97 52

PAUP*4b10 / ModelTest3.7 Alignment 1 (GTR+G)

0.2

BRAIN Alignment 2 (GTR+G+I) Brazil-1 Brazil-2 Myxidium melleni LIVER Myxidium coryphaenoideum Sphaeromyxa hellandi Sphaeromyxa longa Sphaeromyxa zaharoni 0.2 Soricimyxum fegati Myxidium chelonarum Myxidium hardella Myxidium cuneiforme Zschokkella icterica Myxidium truttae Myxidium sp. Myxidium scripta Chloromyxum trijugum Chloromyxum auratum Chloromyxum cyprini Chloromyxum truttae Myxidium lieberkuehni Myxidium giardi Myxobolus kisutchi Henneguya doori Myxobolus osburni Myxobolus sandrae Myxobolus arcticus Myxobolus cerebralis Chloromyxum leydigi Sphaerospora ranae Sphaerospora truttae Ceratomyxa shasta Kudoa yasunagai Kudoa thyrsites Myxidium gadi Myxidium incurvatum Buddenbrockia plumatellae

BRAIN Alignment 3 (GTR+G+I) Brazil-1 Brazil-2 Myxidium melleni LIVER Myxidium coryphaenoideum Sphaeromyxa hellandi Sphaeromyxa longa Sphaeromyxa zaharoni 0.2 Soricimyxum fegati Myxidium chelonarum Myxidium hardella Myxidium cuneiforme Zschokkella icterica Myxidium truttae Myxidium sp. Myxidium scripta Chloromyxum trijugum Chloromyxum auratum Chloromyxum cyprini Chloromyxum truttae Myxidium lieberkuehni Myxidium giardi Myxobolus kisutchi Henneguya doori Myxobolus osburni Myxobolus sandrae Myxobolus arcticus Myxobolus cerebralis Chloromyxum leydigi Sphaerospora ranae Sphaerospora truttae Ceratomyxa shasta Kudoa yasunagai Kudoa thyrsites Myxidium gadi Myxidium incurvatum Buddenbrockia plumatellae

BRAIN Myxidium melleni Brazil-2 Brazil-1 LIVER Soricimyxum fegati Sphaeromyxa hellandi Sphaeromyxa longa Sphaeromyxa zaharoni Chloromyxum trijugum Myxidium chelonarum Myxidium hardella Myxidium scripta Myxidium cuneiforme Zschokkella icterica Myxidium sp. Myxidium truttae Myxidium coryphaenoideum Chloromyxum auratum Chloromyxum cyprini Chloromyxum truttae Myxidium lieberkuehni Myxidium giardi Myxobolus kisutchi Henneguya doori Myxobolus osburni Myxobolus sandrae Myxobolus arcticus Myxobolus cerebralis Chloromyxum leydigi Sphaerospora ranae Sphaerospora truttae Ceratomyxa shasta Kudoa yasunagai Kudoa thyrsites Myxidium gadi Myxidium incurvatum Buddenbrockia plumatellae

MrBayes3.1.2 (GTR+G+I) Alignment 1

Alignment 2 Alignment 3 BRAIN BRAIN Brazil-1 100 Brazil-1 Brazil-2 Brazil-2 92 100 Myxidium melleni 75 Myxidium melleni 98 LIVER 100 LIVER Myxidium coryphaenoideum Myxidium coryphaenoideum 99 Sphaeromyxa hellandi 95 Sphaeromyxa hellandi Sphaeromyxa longa 0.2 100 Sphaeromyxa longa 0.2 100 100 Sphaeromyxa zaharoni 100 0.2 100 Sphaeromyxa zaharoni 100 Soricimyxum fegati 51 Soricimyxum fegati Myxidium chelonarum 63 100 Myxidium chelonarum Myxidium hardella 100 100 Myxidium hardella 99 Myxidium cuneiforme 100 97 Myxidium cuneiforme Zschokkella icterica Zschokkella icterica 100 Myxidium truttae 100 Myxidium truttae Myxidium sp. Myxidium sp. 98 100 Myxidium scripta Myxidium scripta 100 Chloromyxum trijugum Chloromyxum trijugum Chloromyxum auratum 100 100100 100 Chloromyxum auratum 100 Chloromyxum cyprini 100 Chloromyxum cyprini Chloromyxum truttae Chloromyxum truttae Henneguya doori 100 Henneguya doori 100 100 Myxobolus osburni 100 Myxobolus osburni 100 Myxobolus sandrae 100 100 84 Myxobolus sandrae 100 100 92 Myxobolus arcticus 99 Myxobolus arcticus 100 93 Myxobolus cerebralis 100 Myxobolus cerebralis 100 Myxobolus kisutchi 100 Myxobolus kisutchi 94 100 Myxidium giardi 91 Myxidium giardi Myxidium lieberkuehni Myxidium lieberkuehni Chloromyxum leydigi Chloromyxum leydigi 100 Sphaerospora ranae Sphaerospora ranae 100 Sphaerospora truttae Sphaerospora truttae Ceratomyxa shasta 100 Ceratomyxa shasta 100 Kudoa yasunagai 100 Kudoa yasunagai 100 Kudoa thyrsites Kudoa thyrsites 100 Myxidium gadi 99 Myxidium gadi 100 Myxidium incurvatum 100 Myxidium incurvatum Buddenbrockia plumatellae Buddenbrockia plumatellae 100

BRAIN Myxidium melleni Brazil-2 Brazil-1 LIVER Soricimyxum fegati 56 Myxidium coryphaenoideum Sphaeromyxa hellandi 100 Sphaeromyxa longa 100 100 Sphaeromyxa zaharoni 100 Chloromyxum trijugum 99 Myxidium chelonarum Myxidium hardella 78 Myxidium scripta 97 Myxidium cuneiforme 98 Zschokkella icterica 100 100 Myxidium sp. Myxidium truttae 100 Chloromyxum auratum 100 Chloromyxum cyprini Chloromyxum truttae Henneguya doori 100 98 Myxobolus osburni 100 100 Myxobolus sandrae 81 100 Myxobolus arcticus Myxobolus cerebralis 100 91 Myxobolus kisutchi 100 Myxidium giardi Myxidium lieberkuehni Chloromyxum leydigi 100 Sphaerospora ranae Sphaerospora truttae Ceratomyxa shasta 100 100 Kudoa yasunagai 97 Kudoa thyrsites Myxidium gadi Myxidium incurvatum 100 Buddenbrockia plumatellae 100 100 66

MEGA4.1 (NJ/LogDet) Alignment 1

BRAIN Myxidium melleni Brazil-1 52 Brazil-2 71 99 LIVER Soricimyxum fegati 67 100 Myxidium chelonarum 67 0.02 Myxidium hardella 57 Myxidium scripta Chloromyxum trijugum Myxidium cuneiforme 99 86 99 Zschokkella icterica 62 Myxidium sp. 93 Myxidium truttae Myxidium coryphaenoideum 77 Sphaeromyxa hellandi 64 Sphaeromyxa longa 98 Sphaeromyxa zaharoni Chloromyxum truttae 97 Chloromyxum auratum 100 Chloromyxum cyprini Myxidium lieberkuehni 62 Myxobolus osburni 77 Myxobolus sandrae 94 Henneguya doori 95 Myxobolus kisutchi 91 Myxidium giardi 56 100 Myxobolus arcticus Myxobolus cerebralis Chloromyxum leydigi Ceratomyxa shasta Sphaerospora ranae 100 81 Sphaerospora truttae Kudoa yasunagai 100 Kudoa thyrsites 56 Myxidium gadi 99 Myxidium incurvatum Buddenbrockia plumatellae 64

Alignment 2

100

0.02

99

85

53 99 65

Alignment 3 BRAIN 61 BRAIN Brazil-1 99 95 Brazil-1 56 Brazil-2 98 Brazil-2 100 80 71 Myxidium melleni Myxidium melleni 74 LIVER LIVER 80 Soricimyxum fegati Soricimyxum fegati Myxidium coryphaenoideum 67 Myxidium cuneiforme Sphaeromyxa hellandi Zschokkella icterica 83 99 100 Myxidium truttae Sphaeromyxa longa 0.02 99 100 Myxidium sp. 83 Sphaeromyxa zaharoni Chloromyxum trijugum 100 Myxidium chelonarum 79 100 Myxidium chelonarum 100 Myxidium hardella Myxidium hardella Myxidium scripta 70 96 Myxidium scripta 86 Chloromyxum trijugum 54 Myxidium cuneiforme Myxidium coryphaenoideum 53 Zschokkella icterica Sphaeromyxa hellandi 98 98 99 Myxidium sp. Sphaeromyxa longa 92 87 Myxidium truttae Sphaeromyxa zaharoni 99 Chloromyxum auratum Chloromyxum auratum 100 100 97 100 Chloromyxum cyprini Chloromyxum cyprini Chloromyxum truttae Chloromyxum truttae Myxidium lieberkuehni Myxidium lieberkuehni 97 Myxobolus kisutchi Myxobolus arcticus 100 97 99 94 Myxidium giardi Myxobolus cerebralis 100 Myxobolus arcticus Myxobolus kisutchi 95 60 Myxobolus cerebralis Myxidium giardi Henneguya doori Henneguya doori 56 60 50 67 61 Myxobolus sandrae Myxobolus sandrae 67 Myxobolus osburni Myxobolus osburni Chloromyxum leydigi Chloromyxum leydigi 100 Sphaerospora ranae 100 Sphaerospora ranae Sphaerospora truttae Sphaerospora truttae Ceratomyxa shasta Ceratomyxa shasta 100 Kudoa yasunagai Kudoa yasunagai 100 100 Kudoa thyrsites Kudoa thyrsites 69 99 Myxidium gadi Myxidium gadi 99 Myxidium incurvatum Myxidium incurvatum Buddenbrockia plumatellae Buddenbrockia plumatellae