Additional file 3

SNP ID SNP1_351 SNP129_237 SNP135_316 SNP189_131 SNP191_100 SNP197_82 SNP209_255 SNP217_190 SNP227_191 SNP229_112 SNP241_201 SNP249_125 SNP255_265 SNP259_199 SNP269_308 SNP273_298 SNP273_361 SNP273_469 SNP281_64 SNP283_32 SNP289_84 SNP293_20 SNP311_198 SNP317_155 SNP325_65 SNP341_196 SNP345_421 SNP351_85 SNP355_154 SNP357_371 SNP377_251 SNP391_170 SNP397_331 SNP415_209 SNP421_234 SNP425_205 SNP437_129 SNP447_244 SNP451_287 SNP453_375 SNP457_192 SNP459_140 SNP463_296 SNP477_239 SNP497_281 SNP517_224 SNP533_161 SNP543_268 SNP551_351 SNP553_98 SNP555_132 SNP557_104 SNP559_110 SNP561_120 SNP567_341 SNP571_227 SNP575_128 SNP579_187 SNP581_114 SNP591_148 SNP593_149 SNP605_120i SNP613_315 SNP625_278 SNP635_21 SNP649_567 SNP651_658 SNP653_90 SNP655_93 SNP659_73 SNP683_120 SNP691_139 SNP697_296 SNP699_311 SNP709_258 SNP715_260 SNP811_42 SNP817_209 SNP819_210 SNP829_281 Mean

Genotyped accessions Gene diversity Heterozygosity 0.30 0.13 0.45 0.32 0.37 0.30 0.32 0.34 0.31 0.23 0.47 0.51 0.30 0.26 0.27 0.26 0.42 0.33 0.48 0.48 0.28 0.27 0.15 0.16 0.46 0.49 0.48 0.44 0.50 0.44 0.27 0.27 0.10 0.11 0.07 0.07 0.44 0.38 0.21 0.18 0.42 0.39 0.12 0.12 0.49 0.34 0.34 0.31 0.28 0.26 0.45 0.43 0.09 0.09 0.40 0.38 0.49 0.42 0.49 0.48 0.47 0.50 0.24 0.24 0.24 0.20 0.28 0.28 0.25 0.17 0.12 0.09 0.31 0.25 0.47 0.44 0.45 0.45 0.49 0.48 0.10 0.09 0.36 0.36 0.05 0.05 0.29 0.21 0.12 0.12 0.48 0.34 0.02 0.02 0.19 0.20 0.23 0.23 0.47 0.40 0.47 0.41 0.29 0.23 0.37 0.37 0.07 0.06 0.35 0.41 0.50 0.56 0.26 0.27 0.23 0.22 0.46 0.57 0.45 0.43 0.47 0.47 0.24 0.21 0.44 0.50 0.13 0.10 0.27 0.22 0.49 0.36 0.03 0.03 0.44 0.31 0.28 0.26 0.48 0.41 0.08 0.07 0.50 0.41 0.26 0.23 0.28 0.24 0.38 0.40 0.10 0.11 0.39 0.43 0.12 0.13 0.49 0.47 0.50 0.44 0.32 0.30

MAF 0.17 0.32 0.26 0.25 0.17 0.36 0.18 0.14 0.30 0.36 0.21 0.08 0.37 0.40 0.50 0.16 0.06 0.03 0.33 0.14 0.33 0.07 0.42 0.24 0.20 0.35 0.04 0.30 0.44 0.45 0.37 0.12 0.13 0.16 0.13 0.06 0.19 0.45 0.35 0.44 0.04 0.22 0.02 0.16 0.07 0.39 0.01 0.10 0.12 0.39 0.38 0.17 0.23 0.03 0.21 0.48 0.14 0.14 0.39 0.35 0.39 0.14 0.33 0.08 0.16 0.40 0.01 0.30 0.16 0.40 0.05 0.49 0.14 0.14 0.25 0.06 0.28 0.07 0.43 0.48 0.24

Original accessions MAF 0.25 0.45 0.40 0.15 0.11 0.41 0.25 0.14 0.32 0.45 0.25 0.09 0.40 0.45 0.40 0.14 0.05 0.14 0.36 0.10 0.25 0.15 0.32 0.45 0.19 0.40 0.07 0.50 0.33 0.25 0.45 0.08 0.20 0.25 0.14 0.09 0.40 0.40 0.36 0.50 0.10 0.33 0.15 0.21 0.15 0.45 0.07 0.23 0.28 0.27 0.38 0.15 0.50 0.07 0.15 0.36 0.25 0.09 0.32 0.27 0.32 0.18 0.20 0.09 0.13 0.50 0.14 0.23 0.23 0.32 0.09 0.27 0.14 0.17 0.33 0.20 0.40 0.11 0.45 0.50 0.26