Additional File 3

Additional file 3: ROF7 Two Hybrid Screen Results using human cDNA library Gene Name (Best Match)

Start Stop

Frame

Orientation

Global PBS

CHD7 ; GID: 54112402 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 DDX23 ; GID: 41327770 HEY-L ; GID: 105990530 LOC342897 ; GID: 41150997 MMP1 ; GID: 13027798 MYCBP2 ; GID: 126116564 NUDT4 ; GID: 98985815 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195

2538 ND 684 684 684 684 684 684 684 819 819 831 834 834 834 834 834 939 939 939 939 939 1056 33 345 93 7080 1433 -139 -139 -139 -128 -125 -125 -125 -125 -125 -125 -122 -122 -119 -119 -119

IF ?? IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF OOF2 IF IF IF OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2

Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense

D A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A F D D D N/A A A A A A A A A A A A A A A A

3597 2356 1994 1994 1994 1994 1994 1994 1994 2388 2388 2140 2357 2357 2357 2357 ND 2378 2378 2378 2378 2378 2406 646 1308 805 7772 2740 523 523 523 670 539 539 539 539 539 539 640 640 541 541 538

RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195

-119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -119 -117 -107 -107

541 541 541 541 537 541 541 541 541 541 541 538 541 541 538 541 537 537 537 537 541 541 541 537 541 537 538 537 541 541 541 541 541 541 541 541 537 537 541 541 541 541 537 538 538 538

OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF1 OOF2 OOF2

Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense A Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense A Sense Sense Sense Sense Sense

A A A A A A A A A A A A A A Sense A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A Sense A A A A A

RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195

-107 -107 -107 -107 -107 -107 -107 -107 -107 -107 -107 -107 -103 -101 -101 -101 -101 -101 -99 -99 -78 -74 -74 -74 -67 -67 -67 -59 -59 -59 -44 -44 -44 -43 -32 -32 -32 -32 -32 -32 -32 -32 -32 -32 -32 -32

2278 538 538 538 538 538 538 538 538 538 538 2278 538 579 579 579 579 579 538 538 579 538 538 538 536 536 536 538 538 538 ND 1195 1284 539 538 538 538 538 538 538 538 538 538 538 538 538

OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 IF OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF1 OOF1 OOF1 OOF2 OOF2 OOF2 IF IF IF OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 IF OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2

Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A

A A A A A A A A A A A A Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense

RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 41350195 RAB1A ; GID: 54695927 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RAB1B ; GID: 116014337 RBM22 ; GID: 14733998

-32 -32 -32 -32 -32 -32 ND ND ND ND 18 18 39 -32 -49 -49 -49 -49 -45 -45 -45 -45 -45 -45 -43 -43 -43 -43 -43 -43 -43 -43 -43 -43 -33 -33 -33 -33 -33 -33 -33 -22 -13 21 21 -61

538 538 538 538 538 538 536 537 537 537 671 671 649 538 878 517 567 878 567 567 567 567 567 567 499 499 499 878 499 499 499 499 499 499 568 568 568 568 568 568 568 516 924 875 532 679

OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 OOF2 ?? ?? ?? ?? IF IF IF OOF2 IF IF IF IF OOF1 OOF1 OOF1 OOF1 OOF1 OOF1 IF IF IF IF IF IF IF IF IF IF OOF1 OOF1 OOF1 OOF1 OOF1 OOF1 OOF1 IF IF IF IF IF

A A A A A A A A A A A A A N/A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A

Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense

RBM22 ; GID: 14733998 -25 RBM22 ; GID: 14733998 -16 RBM22 ; GID: 14733998 -13 RBM22 ; GID: 14733998 9 RBM22 ; GID: 14733998 45 RBM22 ; GID: 14733998 45 RBM22 ; GID: 14733998 45 VMAC ; GID: 84992991 -35 VMAC ; GID: 84992991 ND Human - GenMatch ; GID: 4003398 -1 Human - GenMatch ; GID: 4003398 90 Human - GenMatch ; GID: 4003398 90

ND : no data PBS, Predicted Biological Score

920 677 576 576 1101 1101 1101 995 994

IF IF IF IF IF IF IF OOF2 ??

A A A A A A A N/A N/A

Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense Sense

647

IF

B

Sense

412

IF

B

Sense

412

IF

B

Sense