ConnecPng GPlates to data: use of the pyGPlates API ...

66 downloads 247 Views 1MB Size Report
below) provides a framework to incorporate GPlates func5onality into exis5ng external Python-‐based analyses. The unofficial public release of the pyGPlates ...
Connec&ng  GPlates  to  data:  use  of  the  pyGPlates  API  in  the   automated  download,  processing,  and  analysis  of  remote  datasets   Michael  G.  Tetley1,  Simon  E.  Williams1,  Nathaniel  P.  Bu@erworth1,  John  Cannon1,  and  R.  Dietmar  Müller1    1EarthByte  Group,  School  of  Geosciences,  University  of  Sydney,  NSW,  Australia.  [email protected]  

What  is  GPlates?  

What  is  the  pyGPlates  API?  

GPlates   is   an   open-­‐source,   cross-­‐pla  Query  MagIC  database  <  /Python  >   (  return:  MagIC  SmartBook  )   <  Python  >  Process  MagIC  data  <  /Python  >   (  return:  Python-­‐ready  dataset  )   <  Python  >  Calculate  paleomagne&c  sta&s&cs  /  poles  <  /Python>   (  return:  processed  paleomagne;c  data  )   <  pyGPlates  >  Assign  reconstruc&on  plate  IDs  <  /pyGPlates  >   (  return:  loca;on  and  age-­‐coded  data  )   <  pyGPlates  >  Generate  GPML  +  VGP  files  <  /pyGPlates  >   (  return:  GPlates-­‐ready  input  files  )   <  GPlates  >  Drag  &  drop  to  visualise  reconstruc&on  poles  <  /GPlates  >   Figure  3:  Symbolic  workflow  for  retrieval,  processing,  and  output  of  MagIC  paleomagne&c  data.  

Figure  4:  Tectonic  blocks  bounding  EarthChem  copper  (Cu)  geochemical  data  reconstructed  to  650Ma.   Data  points  are  colour-­‐coded  by  Cu  content  (ppm).  

Acknowledgements  

References  

•  Lisa   Tauxe,   Cathy   Constable   &   Rupert   Minne\,   MagIC   database,   Scripps  Ins=tute  of  Oceanography,  UC  San  Diego   •  Zheng-­‐Xiang  Li  from  Cur=n  University,  WA   •  Jason  Ash,  Leslie  Hsu  &  Kers=n  Lehnert  from  EarthChem  

Eglington,  B.  M.,  Pehrsson,  S.  J.,  Ansdell,  K.  M.,  Lescuyer,  J.  L.,  Quirt,  D.,  Milesi,  J.  P.,  &  Brown,  P.  (2013).  A  domain-­‐based  digital  summary  of  the  evolu=on  of  the  Palaeoproterozoic   of  North  America  and  Greenland  and  associated  unconformity-­‐related  uranium  mineraliza=on.  Precambrian  Research,  232,  4-­‐26.  doi:10.1016/j.precamres.2013.01.021   Li,  Z.  X.,  Bogdanova,  S.  V,  Collins,  A.  S.,  Davidson,  A.,  De  Waele,  B.,  Ernst,  R.  E.,  …  Vernikovsky,  V.  (2008).  Assembly,  configura=on,  and  break-­‐up  history  of  Rodinia:  A  synthesis.   Precambrian  Research,  160(1-­‐2),  179-­‐210.  doi:10.1016/j.precamres.2007.04.021   Li,  Z.-­‐X.,  Evans,  D.  A.  D.,  &  Halverson,  G.  P.  (2013).  Neoproterozoic  glacia=ons  in  a  revised  global  palaeogeography  from  the  breakup  of  Rodinia  to  the  assembly  of  Gondwanaland.   Sedimentary  Geology,  294,  219-­‐232.  doi:10.1016/j.sedgeo.2013.05.016