Alignment with markings.pptx

1

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

110

Rat Sea urchin T. cruzi L. major

M A TE EA IIR IP PY HY I HV LDQN SNV SR V EV G PK TY IR Q DN ER V L FA PVR MV TV P PR HY C IV AN PV SR D TQ S SV LF DITGQ VR LR HA DQ EIR LAQ DPF PLY PG EV MA SKR G SNQ D ES IFR IP PY YY I HV LD HN DNV TK VVV G PK TY IR Q D HER V I FG P EK M I TIP PR HY C II EN PVV RN DTDQV VY DN LGQ VK LFHA DQ EIR LAR EPF PLY PG EV M G D IIR IK R H HYV HI LDNN TNV TR CMV G P LVY TR K EN ER CL FN PK P CIVV P PR FY C IV QN PCV R DA SG N PV IG EN SSVM LRM G E EEI CF EQ EPF PLQ PG EV M S DSV IR IK RY HY I HI LDNN TNV TR TISG PVVY TR K E HET CL FDP CP CV SV P PR HY CVV KN PCV R D EAG EV V L ESSGQ VK LR LG DA EIR F EG EPF PLY PG EE

Rat Sea urchin T. cruzi L. major

LE --- -K DIT PLQV V LPN TA LH LK A L LDF EDKN G DK VM AG D EW LF EG PG TY IPQK EV EVV EI IQA TV IK QNQ A LR LR AR K E CFDR EGK GRV TG EEW LV R SVGA Y L PAV FE LK --- -Q AV TA LKV VQA NA A LR LR A I LDF EDG TQ -K RV AG D EW LF EG PG TY IPRK EV VV D ET IRA TI IR PNQ A IK LR AR K E TN DR EG TARV TG EEW QV KK VGA Y L PGA Y E LK R EE EEW LFK LK L IPV N TGY HVR CL CDF TDKN SV LRR AG T EW LV EG PQ TYV PRV EV EV LR EV HA HI IS PN TA L HIR A LVK FTDR TGV PR EAG DLW TV R TVGA Y L PAV EE LD CR DGK GVQ K LQ L IPPN TG LHVR CV R DFK DA DR -LVG AG T EW MV AG PQ TY IPRV EV VVV EEVKA TV IY PN TA LMVQ AN VN FTDRG GV PRV AG EKW LV RA LGA Y LQ SV EE

Rat Sea urchin T. cruzi L. major

EV LDLV DAV I LT EK TA L HLRA LQN FR DLR GV LHR TG EEW LV TV Q D TEA HV PDV Y E EV LGV V P ITT LG PR HY CV I LDPMG PDGKN Q LGQ KRV VK G EK SF FLQ PG ER LER G I EV V DTVN AYV LT EK NA L HLRA TR T FV DMK GK TR KNG EEW LINM A D TDA HI PDV Y E EV VGV V D IN T LTNR QY CV IV DPVG PDGK PQ LGQ KK LVK G EV SF FLQ PG ET LEQ G I DV IG T FQ G IT LT DT EAV HL EA L SN FT DVY GK RR RAG ER W LV TK EDA SI HI PDV HEKV SGK VR A IV LN EK EY CVV QN P LG A DG LN EFGR K EV RK G ECR F FL HPQ EE LLG GM TV LG L IQ G TM LS DLKA LR L SAV R S FT DVY GK GR RAG EQ WQV TLK DA PV HI IDA Y EMK VA DVA AV S LSAK EYV II HHPV D DTG HN R FG E TLV RR G EC TF FLQ PG ETM PR GV

Rat Sea urchin T. cruzi L. major

Q DVYV LS EQQ G L LLKA LQ P LEEG E SE EKV SHQA G DCW L IRG PL EY V PSAK V EV V E ER QA I PL DQN EG IY VQ DVK TGK VR AV IG S TY M L TQ D EV LW EK E LP SGV EE LLN LG Q SV FI LG EDEG L ILRAQ ES FK DAN AA GAV -R Q PG DR WM IRG PC EY V PTV E LEV V TRR KA I PL DEN EG VY IR D TK TGK VR AV TG E TY M L SQ D EE LWA K E LS PAV EE LLQ SA Q P INV V SK DQ A L LLQAV DF FDDNG K I --- -R R PG EK WM LHG PA EY IPDVN VR I LEQR N LIA L DKN EG IY VMN TT TGV VR VV IGK PY M LN EN EV LW EK D LS PKV EE LLA FA EQ V LV VG K EEA L LL EAV CEYR D -R G EK -- -R Q PG SR WM VRG PL EY IPA N EVK L LE HR RMM A L DKN EG IY VMN TT TG EVR AV IGK PY M L DVN EV LW EK H LP LAV EE LLE SP

Rat Sea urchin T. cruzi L. major

HD PLA DR GQK G TAK PLQ PSA PR NK TR VV SYR V P HNA AV QVY DY RA KRA RV V FG PE LV TLD PE EQ F TV LS LSA GR PKR PHAR RA L CL LLG PD FF TDV IT IE TA D HA R LQ LQ K D PVA ER SDR RG D- -RA A PRAR EK TR V IS FR V P HNA AV Q IY DY K EKKA RV V FG PE LV M LG PD EQ F TQ LS LSG GK PKR PN V IKA L CL LLG PD FC TDI IT IE TA D HA R LQ LQ NG CM S E-G ER N P S- --- FK STR VR HR VVR FN VQ HNA AV Q IY DY KQ KK LRV V LG PN LV ILS PD EEF TV V S LSG GK PKV PN LL HCLQ L FLG PR FS SDR IV V E TSD HA R LE LD NG SI-Q T SER N PG - -FV SHR -- EK YR IVR FN VQ HNA AV Q IY DY RK KQ PR IV LG PN LV M LA PH EEF TV LS LSG G T PKV PN SLQ SLQ L FLG PR FS SDT IV V E TSD HA R LR LR

Rat Sea urchin T. cruzi L. major

LA YNW HF ELK NR N D PA EAA K LF SV PD FVG DA CK A IA SR VRG AV A SV TF DD FHK N SAR IIR MA V FG FEM S EDTG P DG T LL PK AR DQA V F PQN G LVV S SV DV Q SV EPV DQ R T LSYNW HF DV P DK TDVAA SA K LF SV PD FIG DA CK A IA SR IRG AV AG VQ F DD FHK N SAK IIR A SV FG F- -- DEK N - --- -- -K VR ER F LF PQN SLV IT SI DIQ SV EPV DQ R T LSYNW Y F DV -NR EE P-- DA K IF SV PD FIG DC CK TIA SR IRG AV AA EDF DS FHR N SAK IIR VA V FG R - --G EN G - --- -- -E IN T SLR F SAN N LVV TN I DIQ SV EP TDA K T LSYNW Y F DI- DR VN P-- SQ R TF SV PD FIG DC CK TIA SR VRG AV A S EDF DS FHR N SAK IIR TA V FG V - -- DETG - --- -- -E TKK N LR F TAN DFVV TN I DV Q SS EP TDEK T

Rat Sea urchin T. cruzi L. major

R DA LQ R SVQ LA I EI TTN SQ EAA AK HEAQR LEQ EARG R L ERQ K I LDQ SEA EKAR K E LL ELEAM SMA V E STGNA KA EA E SR A EAAR IEG EG SV LQ AK LKA QA LA I ET EA E LE R DA LQ K SVQ LA I EI TTN SQ EA TAR HEA ER LEQ EARG R L ERQ K IM D EA EA EK SR K E LL ELQ AN SAA V E STGQA KA EAQ SR A EAAR IEG EAAV DQ AR LKA EA AK I ES ESE LQ R D SLQ K SVQ LA I EI TTK SQ EAA AR HG K ER K DQ EARG K L ERQ K L LDK IEV ER TK TK W LQ LQ AQ SEA VQ A SGQ SVA EAK AK A E SLL IEV D SELKQ A EM RA KA YR I TA ESE LK R D SLQ K SVQ LA I EI TTK SQ EAA AR HG N ELK DQ EAKG Q L ERQ K L LDK IEV ENAR TK W L ELQ AK SEA VQ A SGQ SVA EAK AR A EA LL IEVR SEM QQ A EM RA RA YR I SA EA E LQ

Rat Sea urchin T. cruzi L. major

RV KKV R EM EL IY AR AQ L EL EV SKA QQ LAN V EAK K FK EM TEA LG PG TIR DLAVA G P EM QVK LLQ SLG LK S TLI TDG SS PIN L FSTA FG L LG LG S DGQ PPAQ K R L TNA R EA ETKY VR EQN A L EVN K TKQ M SD IE TER FR NM VQ S IG A D TIK AM AMA G P EM QVK LL SSLG LK S TLI TDG ST PIN L FN TAQ G L LGG FSAKR G I EHV EE ED KQ KQK LE LEL EF TK RQN EL DIM KA RQ IA E TEA ERVQ RM VNA IG R E TIV AV AQA G P EM QAK LLGG LG LKG Y LI TDGK S PV N L FN TAQ G L IDA G S SAQ EH S K LQQR QA LEL EY TQ RQN EI DV SKA RA AA EA EA EKVK RM V DC IG R D TLV A IARA G P ETQVK LL SSLG LKG Y LI TDGN S PV N L FG TAQ GM IG E PK K

120

230

340

450

560

670

780

130

240

350

460

570

680

790

140

250

360

470

580

690

800

150

260

370

480

590

700

810

160

270

380

490

600

710

820

170

280

390

500

610

720

830

180

290

400

510

620

730

840

190

300

410

520

630

740

850

200

310

420

530

640

750

860

210

220

320

330

430

440

540

550

650

660

760

870

770

875

MVP sequence alignment. Residues identified as forming intermolecular contacts across the MVP oligomerisation interface are color coded red boxes show hydrophobic interactions, blue show hydrogen bonding and green boxes show ionic bonding.

1

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

110

Rat Sea urchin T.cruzi L. major

M A TE EA IIR IP PY HY I HV LDQN SNV SR V EV G PK TY IR Q DN ER V L FA PVR MV TV P PR HY C IV AN PV SR D TQ S SV LF DITGQ VR LR HA DQ EIR LAQ DPF PLY PG EV MA SKR G SNQ D ES IFR IP PY YY I HV LD HN DNV TK VVV G PK TY IR Q D HER V I FG P EK M I TIP PR HY C II EN PVV RN DTDQV VY DN LGQ VK LFHA DQ EIR LAR EPF PLY PG EV M G D IIR IK R H HYV HI LDNN TNV TR CMV G P LVY TR K EN ER CL FN PK P CIVV P PR FY C IV QN PCV R DA SG N PV IG EN SSVM LRM G E EEI CF EQ EPF PLQ PG EV M S DSV IR IK RY HY I HI LDNN TNV TR TISG PVVY TR K E HET CL FDP CP CV SV P PR HY CVV KN PCV R D EAG EV V L ESSGQ VK LR LG DA EIR F EG EPF PLY PG EE

Rat Sea urchin T.cruzi L. major

LE --- -K DIT PLQV V LPN TA LH LK A L LDF EDKN G DK VM AG D EW LF EG PG TY IPQK EV EVV EI IQA TV IK QNQ A LR LR AR K E CFDR EGK GRV TG EEW LV R SVGA Y L PAV FE LK --- -Q AV TA LKV VQA NA A LR LR A I LDF EDG TQ -K RV AG D EW LF EG PG TY IPRK EV VV D ET IRA TI IR PNQ A IK LR AR K E TN DR EG TARV TG EEW QV KK VGA Y L PGA Y E LK R EE EEW LFK LK L IPV N TGY HVR CL CDF TDKN SV LRR AG T EW LV EG PQ TYV PRV EV EV LR EV HA HI IS PN TA L HIR A LVK FTDR TGV PR EAG DLW TV R TVGA Y L PAV EE LD CR DGK GVQ K LQ L IPPN TG LHVR CV R DFK DA DR -LVG AG T EW MV AG PQ TY IPRV EV VVV EEVKA TV IY PN TA LMVQ AN VN FTDRG GV PRV AG EKW LV RA LGA Y LQ SV EE

Rat Sea urchin T.cruzi L. major

EV LDLV DAV I LT EK TA L HLRA LQN FR DLR GV LHR TG EEW LV TV Q D TEA HV PDV Y E EV LGV V P ITT LG PR HY CV I LDPMG PDGKN Q LGQ KRV VK G EK SF FLQ PG ER LER G I EV V DTVN AYV LT EK NA L HLRA TR T FV DMK GK TR KNG EEW LINM A D TDA HI PDV Y E EV VGV V D IN T LTNR QY CV IV DPVG PDGK PQ LGQ KK LVK G EV SF FLQ PG ET LEQ G I DV IG T FQ G IT LT DT EAV HL EA L SN FT DVY GK RR RAG ER W LV TK EDA SI HI PDV HEKV SGK VR A IV LN EK EY CVV QN P LG A DG LN EFGR K EV RK G ECR F FL HPQ EE LLG GM TV LG L IQ G TM LS DLKA LR L SAV R S FT DVY GK GR RAG EQ WQV TLK DA PV HI IDA Y EMK VA DVA AV S LSAK EYV II HHPV D DTG HN R FG E TLV RR G EC TF FLQ PG ETM PR GV

Rat Sea urchin T.cruzi L. major

Q DVYV LS EQQ G L LLKA LQ P LEEG E SE EKV SHQA G DCW L IRG PL EY V PSAK V EV V E ER QA I PL DQN EG IY VQ DVK TGK VR AV IG S TY M L TQ D EV LW EK E LP SGV EE LLN LG Q SV FI LG EDEG L ILRAQ ES FK DAN AA GAV -R Q PG DR WM IRG PC EY V PTV E LEV V TRR KA I PL DEN EG VY IR D TK TGK VR AV TG E TY M L SQ D EE LWA K E LS PAV EE LLQ SA Q P INV V SK DQ A L LLQAV DF FDDNG K I --- -R R PG EK WM LHG PA EY IPDVN VR I LEQR N LIA L DKN EG IY VMN TT TGV VR VV IGK PY M LN EN EV LW EK D LS PKV EE LLA FA EQ V LV VG K EEA L LL EAV CEYR D -R G EK -- -R Q PG SR WM VRG PL EY IPA N EVK L LE HR RMM A L DKN EG IY VMN TT TG EVR AV IGK PY M L DVN EV LW EK H LP LAV EE LLE SP

Rat Sea urchin T.cruzi L. major

HD PLA DR GQK G TAK PLQ PSA PR NK TR VV SYR V P HNA AV QVY DY RA KRA RV V FG PE LV TLD PE EQ F TV LS LSA GR PKR PHAR RA L CL LLG PD FF TDV IT IE TA D HA R LQ LQ K D PVA ER SDR RG D- -RA A PRAR EK TR V IS FR V P HNA AV Q IY DY K EKKA RV V FG PE LV M LG PD EQ F TQ LS LSG GK PKR PN V IKA L CL LLG PD FC TDI IT IE TA D HA R LQ LQ NG CM S E-G ER N P S- --- FK STR VR HR VVR FN VQ HNA AV Q IY DY KQ KK LRV V LG PN LV ILS PD EEF TV V S LSG GK PKV PN LL HCLQ L FLG PR FS SDR IV V E TSD HA R LE LD NG SI-Q T SER N PG - -FV SHR -- EK YR IVR FN VQ HNA AV Q IY DY RK KQ PR IV LG PN LV M LA PH EEF TV LS LSG G T PKV PN SLQ SLQ L FLG PR FS SDT IV V E TSD HA R LR LR

Rat Sea urchin T.cruzi L. major

LA YNW HF ELK NR N D PA EAA K LF SV PD FVG DA CK A IA SR VRG AV A SV TF DD FHK N SAR IIR MA V FG FEM S EDTG P DG T LL PK AR DQA V F PQN G LVV S SV DV Q SV EPV DQ R T LSYNW HF DV P DK TDVAA SA K LF SV PD FIG DA CK A IA SR IRG AV AG VQ F DD FHK N SAK IIR A SV FG F- -- DEK N - --- -- -K VR ER F LF PQN SLV IT SI DIQ SV EPV DQ R T LSYNW Y F DV -NR EE P-- DA K IF SV PD FIG DC CK TIA SR IRG AV AA EDF DS FHR N SAK IIR VA V FG R - --G EN G - --- -- -E IN T SLR F SAN N LVV TN I DIQ SV EP TDA K T LSYNW Y F DI- DR VN P-- SQ R TF SV PD FIG DC CK TIA SR VRG AV A S EDF DS FHR N SAK IIR TA V FG V - -- DETG - --- -- -E TKK N LR F TAN DFVV TN I DV Q SS EP TDEK T

Rat Sea urchin T.cruzi L. major

R DA LQ R SVQ LA I EI TTN SQ EAA AK HEAQR LEQ EARG R L ERQ K I LDQ SEA EKAR K E LL ELEAM SMA V E STGNA KA EA E SR A EAAR IEG EG SV LQ AK LKA QA LA I ET EA E LE R DA LQ K SVQ LA I EI TTN SQ EA TAR HEA ER LEQ EARG R L ERQ K IM D EA EA EK SR K E LL ELQ AN SAA V E STGQA KA EAQ SR A EAAR IEG EAAV DQ AR LKA EA AK I ES ESE LQ R D SLQ K SVQ LA I EI TTK SQ EAA AR HG K ER K DQ EARG K L ERQ K L LDK IEV ER TK TK W LQ LQ AQ SEA VQ A SGQ SVA EAK AK A E SLL IEV D SELKQ A EM RA KA YR I TA ESE LK R D SLQ K SVQ LA I EI TTK SQ EAA AR HG N ELK DQ EAKG Q L ERQ K L LDK IEV ENAR TK W L ELQ AK SEA VQ A SGQ SVA EAK AR A EA LL IEVR SEM QQ A EM RA RA YR I SA EA E LQ

Rat Sea urchin T.cruzi L. major

RV KKV R EM EL IY AR AQ L EL EV SKA QQ LAN V EAK K FK EM TEA LG PG TIR DLAVA G P EM QVK LLQ SLG LK S TLI TDG SS PIN L FSTA FG L LG LG S DGQ PPAQ K R L TNA R EA ETKY VR EQN A L EVN K TKQ M SD IE TER FR NM VQ S IG A D TIK AM AMA G P EM QVK LL SSLG LK S TLI TDG ST PIN L FN TAQ G L LGG FSAKR G I EHV EE ED KQ KQK LE LEL EF TK RQN EL DIM KA RQ IA E TEA ERVQ RM VNA IG R E TIV AV AQA G P EM QAK LLGG LG LKG Y LI TDGK S PV N L FN TAQ G L IDA G S SAQ EH S K LQQR QA LEL EY TQ RQN EI DV SKA RA AA EA EA EKVK RM V DC IG R D TLV A IARA G P ETQVK LL SSLG LKG Y LI TDGN S PV N L FG TAQ GM IG E PK K

120

230

340

450

560

670

780

130

240

350

460

570

680

790

140

250

360

470

580

690

800

150

160

260

270

370

480

590

700

810

380

487

170

280

390

500

600

710

820

610

720

830

180

290

400

510

620

730

840

190

300

410

520

630

740

850

200

310

420

530

640

750

860

MVP sequence alignment marked by similarity for positive control sequences. Prepared in Geneious version 5.5.7 created by Biomatters. Available from http://www.geneious.com/

210

220

320

330

430

440

540

550

650

660

760

870

770

875