Additional file 10: list of multiple sequence

Additional file 10: list of multiple sequence alignments

Platynereis pNPs belonging to eumetazoan pNPs families:

Multiple sequence alignment of annelid and mollusk FMRFa pNPs.

Multiple sequence alignment of annelid and mollusk RYa pNPs. These pNPs also share a conserved peptide in the C-terminus of the precursor, potentially yielding Pro rich RFamide-related peptides.

Multiple sequence alignment of trimmed Platynereis and Capitella teleta WI peptide and MIP pNPs. The mature WI peptides share two conserved Trp-residues with MIPs.

Platynereis_MIP Helobdella_jgi|Helro1|192887 Aplysia_ABD17759.1 Drosophila_XP_001972955 Culex_XP_001842234 Aedes_XP_001655873 Acyrthosiphon_XP_001949765 Tribolium_NP_001137202

10 20 30 40 50 MD R V T I T C - - - F S L C L A S V L I P L V H S E E N V - D L D E D K R A WMK N N I A WG K R GWK QG - A N N E L I D A MK P F H L L V T L V V L C Y P L V L G S A - Y E P L Q T S S L T S S Q T A Y L QQ P H K V A - I A Y S L T S A V QG L E P L P A A S L S D S P A S G A D V P P L P S S A A T N A A V D K E W L R Q K L E E GQ F A H T K T R K T - - - Y G L L MV L L I L G S A C A N L V A - S G S A A S P A S N E P GGGG L S E Q V V L D - Q H R HQWT N - - - L V N L I V L L V F S S V I N H I WA A A E E P S L A A - - - - - - - - DQ HQQQQ H - Q H L I L WT N - - - F G K L L L L L V L C S L V S N I - - - - - Q T E S A S - - - - - - - - L E Q HQME H - L S GGMQ N V - - - L G R I A A T L V I L C P V I V F T I - P E S A I Q A S S I K S S - - - Q T E Q D N S D - A A A I MR D A - - - V A P V L G A V L L T C Y S L Q A T L - A L S - - - - - - - - - - - - - D E T P L K S S - -


100 110 120 130 140 150 160 170 180 MR V WG K R - - - - S D E D D K R GW - K D S S MR V WG K R A - - - - - - - G E D D N N K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - WG K N N L - R V WG K R A D D L E V L E GG D D D D Y S S S V P D D V T K R R W - D K N S MN V WG K R S - - - - G D E F S D V N K R Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - WG T R S M - N V WG K R - - - - - - - L L V N N V Q N - - - Y D D S S K R K W - S K F S S - - WG K R D A S E E T P E GG E G E DG L G A V K K WK NMA V WG K R A E DG L D K R W - - K QM - A T WG K R E DG D V L G L - - - - - - - - - - - L Y G N N K R A W - Q S L Q S - S WG K R S - - - - - S S G D A S D P D I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Y MT G H F V P - L V I T - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q H S L Q K R T W - K N L QG - GWG K R N - P A P N D P S S E S D P D Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Y - - G S Y - P GGG HG - - - - - - - - - - - - - - - - - - S H S P Q K R T W - K N L QG - GWG K R T - - - P T S E Q P D P N A D Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Y G Y - - - - - - T G R N - - - - - - - - - - - - - - - - - - E DQ E E K R A W - R D L Q T A GWG K R G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - W - - Q N L K T T WG K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - E D E MS K R DWN K D L H I - - WG K R G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - W - - N N L H E GWG R K - - - - - - - -


190 200 210 220 D K R A WG D N NMR V WG K R S D L E D D K R A WN K N S - - - - - - - - - - - - - - - - - T A L L G Y DQ P Q A I D E D S Q N E D T Y P - - - - - - - - - - G T D K R W - K QMA S WG K R L D D S D R D K K WK QMS V WG K R E D NG E P - - - - - - - - - - - - - - - - - - DG T N T I DWD T F E - - - - - - - - - - - - - - - - - GE E NP I GDD - - - - I PGND L E K LQ - - - - - - - - - - - - - - - - - DDT A DYG - - - - - - NA E NE L DK L N - - - - - - - - - - - - A Q DWQ N L H S S WG K R - - - - - - - QGWQ K L HGGWG K R - - - - - - - - - - - R S V P A WE E Q - - - - Q E K R A WQ S L Q - - - - - - - - - - -


280 290 300 310 320 330 340 350 360 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A D E D D K R GWNG N S MR V WG K R G - - - - - - - - WHG NG V R - QWG K R L H L D D V E P I L D D E E S K R A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V R G K K S Y W I K QMP V K L T R P R - - - - - - - - - - - D E MK - - - - R R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A T WG K R N S S E N Y D K R WK QMS V WG K R DG DG D L D K R WK - QMS V - WG K R DG DG D L D K R W - - K QMS - V WG K R NG DG D L D K R WK QMS V WG K R DG D E D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G E S D V E K R A WK - S MN V A WG K R R Q A QG - - - - W - - N K F R G A WG K R - - - - - - E P T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E E Y P G A E K R A WN - K MQGGWG - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A WG K R - - - - - - E P G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E E Y P - V E K R A WN - K I NGGWG K R V N A G P A Q - - W - - N K F R G S WG K R - - - - - - E P G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E E N P N E A E K R S WD - N F QG S WG K R A A D - - - - - - W - - T S F R G S WG K R - - - - - - N P V D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P E I E T N D D E K R NWG - Q F HGGWG K R S K - - - - - - - W - - D N F R G S WG K R - - - - - - E P A - - - - - - - - - - - - - - -


370 380 390 400 410 420 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - WA K N NMR V WG K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - WK E N T MN V WG - V E K R WK QMS V WG K R DG D A D L D K R WK QMS V WG K R D E DG N L D K R W - - K QMS V WG K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - WN - N L K GMWG K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - WN - N L K G L WG K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - WN - N L K G L WG K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - YM - NE Y SGYGDN - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - WS - N L K G I WG K R

60 70 80 90 - - - A S Y S WG K R D S E G DG L MS D E E K R A WN K N - - - - N - - - T E DK D I HE E K S I ND L I R R R R NV A E V A S L K S L D L P QQ D K R WGG I N S WMT H R L GG P S E R D S S Q D S L D K Q - - - QLSESD- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ESAP - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A DE S T H - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - YT RSF D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - NDNPQ I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

230 240 250 260 270 - - - - - - - MR V WG K R DME E D E D N K R A WK GQ S A R V WG K R - - - - - - - - - - - - - - - Y V L L G D D A L T R R K P L MN P E E D R E E K G V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L D K K WK E MS V WG K R D T L D D P E K R WK QMA V - - - - WG K R QG L D D R N D K R WK QM - - - - R L A S G P S A QQQQQQQ E QQ P L QQQ S Q - - - - S G E D F D D L A - - - - - - - - - - - T Y L I K G L MNQQ R - - - - - - - - - - - MA Q - - - - MD T Q Y DG P D - - - - - - - - - - - K Y L I K G L I NQ R - - - - - - - - - - - - L A Q - - - - L D T Q Y DG S D - - - - - - - - - GWK DMQ S GGWG K R F K - - - DQ P A S S Q L S Q - - - - F D E Y L D K Y E - - - - - - - - - - - - - - - - S GWG K R F A P E D E Y A I R Q L A A M - - - - L D S Q Y D D Y N - - - - - - - - -

Multiple sequence alignment of Platynereis MIP pNP with protostome MIP/allatostatin-B pNPs.

Platynereis_Bursicon-A Platynereis_Bursicon-B Capitella_EY633285 Crassostrea_CU992776 Ixodes_XP_002407512 Callinectes_ACG50067 Bombyx_NP_001091845 Nasonia_Bursicon-alpha Anopheles_BURS_ANOGA Tetranychus_bursicon Amphibalanus_AFK81933 Nasonia_Bursicon-beta Manduca_ABB92831 Apis_NP_001035352 Daphnia_ABX55997 Callinectes_ACG50066 Anopheles_XP_313804 Strongylocentrotus_NP_001103717

10 - MT G A A A K R S F V CG F I C MT T E WG T S L L L L V - - - - - MA S S I D T D L L V L L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ML I CV R - - - - - - MN S N L T WA MV G - - - - - - - MS V L N T F L V - - - - - MA H Y R C K E Y F F I T - - - - - MK S T F L V V L E L - - - - - - - MK S T L E I F L F - - - - - - - - - - MA R L R A A G - - - - - - - - - - - MR L I V - - - - - - MG F L S G K I V F V - - - - - - - MK E N F S I MF I H S I - - - MF WY V - - - - - - - - - - - - - - MWCG R G T A V - - - - - - MC N S V R T A L A A S N C C S - - - - - - - - ML L L L - - - - -


100 110 120 130 140 150 160 170 180 GQ C E S Y T Q Y S T D T - N D I E R V C S C CQ P HG R K L R R I R M - R C R N P K T F M - - - P E I H F V Q V Y I - - P N S CMC R P C S V S I D N V P D V V N P L E A MS D N P P G T C T S E V S P S V V R F P G F K K D C K C C R E S R L D E K S Y L L - P C Y Y G N A L - - - - I P G E T V R L H I K E P MD CQ C S E C A M - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G F C T S R V S P S V V Q Y P G F K K N C T C C K E T R L R N R V V L L T N C F E G DQ A - - - - L P D E S A S L F I R E P D D C A C S S C E I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G S C L S T A S P N V H T Y P D F K K D C K C C K E G R L V S R Q I A L Q V C Y - S NG V V L A G V Q P T T - - - S L T E P A D C D C F P C T N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G S C S S Y V Q V S G S R Y WQ V E R S CMC CQ E MG E R E A T K A V - F C P K G P G - - - - - - - P K F R K L I T R A P V E CMC R P C T A P D E A S I L P Q E F V G L - - - - - G R C T S Y V Q V S G S K L WQ T E R S CMC CQ E S G E R E A A I T L - N C P K P R P - - - - - G E P K E K K V L T R A P I D CMC R P C T D V E E G T V L A Q E I A N F I Q D S P M G K C T S Y V Q V S G S K I WQME R T C N C CQ E S G E R E A T V V L - F C P D A Q N - - - - - E E K R F R K V S T K A P L Q CMC R P CG S I E E S S I I P Q E V A G Y S E E G P L G R C S S Y L Q V S G S K I WQME R S CMC CQ E S G E R E A S V S L - F C P K T K A - - - - - G D R K F R K V I T K A P L D CMC R P C T S I E E R I V I P Q E I A G L S N NG P L G R C A S Y I Q V S G S K I WQME R S CMC CQ E S G E R E A S V S L - F C P K A K N - - - - - G E K K F R K V S T K A P L E CMC R P C T G I E D A N V I P Q E L T S F A D E G T L G T C V S S L Q P S V V H S S G F L K K C N C C R E S R MK S R S I R L S H C F D P DG K K T T - G E K G S ME I E ME E P E S C H C L K C S P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G T C S S Q V Q P S V I S P S G F N K E C S C C K E T G L R V R E I T L T R C F N P DGQQ V A - G DQG R L T V K L R E P S D C R C S R C E N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G Y C D S Q V Q P S I V T S T G F T K E C S C C R E E F L E E R T V Y L N N C Y D S NG K Q F S L L D N S NMA I K I R E P T N C K C I K CG F L - - - - - - - - - - - - - - - - - - GMC N S Q V H P S I S T S T G F Q K E C F C C R E N F L R E R L V T L T H C Y D P DGMR L E D E D N A I ME V R L R E P E E C K C S K CG E F S R - - - - - - - - - - - - - - - - G F C N S Q V Q P S V A S T T G F S K E C Y C C R E S Y L K E R H I T L H H C Y D A DG I K L MN E E NG V ME I K I R E P V E C K C I K CG D I S Q - - - - - - - - - - - - - - - - G S C S S Q V Q P S V V H P S G F L K E CMC C R E S F L R E R V V T L T H C Y D A NG N R L T - G K S S S L D V K MR E P A D C K C F R CG D S A E - - - - - - - - - - - - - - - - G A C N CQ V H P S V N T P S G F L K D C R C C R E V H L R A R D I T L T H C Y DG DG A R L S - G A K A T QQ V K L R E P A D CQ C F K CG D S T R - - - - - - - - - - - - - - - - G K C N S Q V Q P S V I T A T G F L K E C Y C C R E S F L R E R Q L Q L T H C Y D P DG V R MT D H E S A T ME I R L K E P V D C K C F K CG E MV R - - - - - - - - - - - - - - - - G K C I S Q V S P T V L Q - HG F D K K C H C C R E HGMV H K K V V MT N C Y D - H A L G I T D P D F - T HQ V T L K Q P E A C R CQ I C T F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -


190 ME F M L L R H K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - DS V P F L K - - - - - Y NHF R K S L - - - - S NS A HF R NT F K L T T GY F QK S HY K S I E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

I -

20 30 40 - - C L I CS V A S EGNT - - - E V D L P T G I V V - - P A I L I L - - - - - - - - - - - - A HCP L S S - - F G L V L L L S T - - - - - - - - - S K A DT SQ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S P C S L L A S W L I L - - - A V L A A S MG P E - - A A V T V L V V I - - - - - - - - - GV DV A R A - - I - V A L I L CY V NDF P V T GHE VQ L P PGT - - N Y F N I S L GWF I L - - - F I NG L S A I V H - - A F F L L P G R V L Y A Q K D S E DGG S H Y S S - - S LVS LT T LF I SS - - - F A LEP I D I AH - - L L L A L L T V S - - - - - - - - - - GCR A A R - - S L L I A MF L K - - - - - - K I V L A N A L V N - - F S L H L L F I I - - - - - - - - - - I NS V A E - - F L I L I I F I Y S - - - - - NE T I AQV T DD - - L I I L L G A G S S R E - - - T L A S K T N L MS - - A V V V V A V V L A V L - - - P E V V HS R T YG V L C C V L L L T L T L T V - - - A V T A Q H NQ A D - - V V L L CG A G S - - - - - - V S R V S S L A DG -

- - - - - - KF - - - - - - - - - - - -

50 60 70 80 90 - - P A CR I RW - I V HR I E - - - L P H - - - - - - - - - CT QK R L L S L A CK - - A S C N T D F T E I F L N K E K P Y E Y - NG R P A R L T C Y R K - V T I R K C E - - E E C N T L H S T V T F S S P K T I E L E DG R R R R I F C T G E - V T V K K C E - - MD I T R T L T V T H - - - - - - - - - - E G V L K T V D C V A R - V S V N E C E - - E S CQ L R P - V I H V L K - - - Q P G - - - - - - - - - CQ P K P I P S F A CQ - - D E C S L R P - V I H I L S - - - Y P G - - - - - - - - - C T S K P I P S F A CQ F CQ E CQMT A - V I H V L K - - - H R G - - - - - - - - - C K P K A I P S F A C I - I DE CE V T P - V I HV LQ - - - Y T G - - - - - - - - - CV P K P I P S F A CK - - D D CQ V T P - V I H V L Q - - - Y P G - - - - - - - - - C V P K P I P S F A C I - - E NCA I L P GS I HV V K E E - L DV - AGNV I R S - CE GD - F L V NK CE - - P Q C E T I P S T I H I T K D E - F S S - S GQ L E R T - C E G D - I P V N K C E - - E NCE K L DS E I R I T K DE - Y S E - T GK L F R T - CS DE - I QV S K CE - - E MC E T V A S E I H V T K E E - F D D - MG R L I R S - C S G D - V S V N K C E - - E NCE T LQS E V H I T K DE - Y DE - I GR L K R T - CSGD - I S V T K CE - - G T C E T L P S T I H I T K E E - Y T D - GG I L S R T - C E G D - I G V A K C E - - V E CE T L P S T I H I S K E E - Y DD - T GR L V R V - CE E D - V A V NK CE - - E T C E T L P S E I H L I K E E - Y D E - L G R L Y R T - C NG D - V T V N K C E - - E T C E L S HG E T T I D V E V - V D D N L Q R T L R - - C R K R - V Q V NQ C E

Multiple sequence alignment of Platynereis bursicon alpha and beta with bilaterian bursicon pNPs.

Truncated multiple sequence alignment of Platynereis prokineticin with bilaterian and cnidarian prokineticin pNPs. In Platynereis and Capitella teleta, this pNP also gives rise to amidated peptides located at the N-terminus of the pNP.

Platynereis pNPs belonging to bilaterian pNPs families: Platynereis_GPB5 Aedes_XP_001653381 Drosophila_Q4V484_DROME Daphnia_Dappu1:319430 Pediculus_C6SUQ7_PEDHC Ciona_C6SUS0_CIOIN Bufo_Q8JFA5_BUFJA Petromyzon_C6SUS2_PETMA Coturnix_LSHB_COTJA Odontesthes_Q6VYH5_9SMEG

10 20 30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MN K GGG H K GQ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M I NL I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T ML A DS A T L T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MA N T Y Q F Q R I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M I N I N L I RG I I - MN S I A V L R MF L C V S V A A T F V E A S T S I N P K S F I H E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MA D D S F H R G H L P P P A A MQ L D S G S G L R G A S F L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MGG A Q V L L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MV A Q V S I T MF P MM - -

Platynereis_GPB5 Aedes_XP_001653381 Drosophila_Q4V484_DROME Daphnia_Dappu1:319430 Pediculus_C6SUQ7_PEDHC Ciona_C6SUS0_CIOIN Bufo_Q8JFA5_BUFJA Petromyzon_C6SUS2_PETMA Coturnix_LSHB_COTJA Odontesthes_Q6VYH5_9SMEG

100 110 120 - S V T S - - - - CG - L Y H HWK I A V N R D Y L A E NG T - E K K A P M L GCH - K R V F T Y R I S QA DS KGR E - V T P L G - - - - C H - R R V Y T Y K V T Q S D L QG H E - DA T P T - - - - CF - R R P Y T F K V YQE DS EGR S - DS S L D - - - - CN - R R A Y S HR V T QT DS EGR I - - HRGT T CNT C L L T R R NHR HR L P R R RGCHN - - A F S L - - - - CM - L - T E Y I MY V E K E - E C A Y - - S F V G - - - - CA - V - R E F T F V A R K P - GCRG - - GR P P - - - - CR - P - I NV T V A V E K E - E CPQ - - Q L P L - - - - CQ - P - I NQ T V S L E K D - G C A R - -

Platynereis_GPB5 Aedes_XP_001653381 Drosophila_Q4V484_DROME Daphnia_Dappu1:319430 Pediculus_C6SUQ7_PEDHC Ciona_C6SUS0_CIOIN Bufo_Q8JFA5_BUFJA Petromyzon_C6SUS2_PETMA Coturnix_LSHB_COTJA Odontesthes_Q6VYH5_9SMEG

190 200 210 220 230 - - F A K V F D A V S C V CQ P C S R S N A S C E S L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A K L Y E Y ME P K S C S CQ T C T S MD T S C E G P K Q L S T D A A T K I F Q I D D E E I E S E Y A V S K Y Q Y ME A V N C H CQ T C S T Q D T S C E A P A N N E MA GG S R A I MV G A D T K N L D Y T E L Y MA L D A V T C R C E L C H T D T T N C E G P - H Y D R R I T T H R L N - - - - - - - - - - T E I H E F ME A I S C E C S L C K S S E A N CQG V - R Y K G DG E I F R F Q R N R T - - - - - - - - F F Y I T V P T S CNCR NCDP T R A I C L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L Y T Y P I A L S CK CE K CNT E Y I DCVQD - R I DS NY CT K P R E P K Y L L Y NF LQ - - V F S F P V A L S C V C K MC S T D D T E C E T Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K V I L P V A L S C R C A R C P I A T S D C T V Q - G L G P A F CG A P GG F GGQ - - - - - - - - T V S Y P V A V S C H CGG C A MD T S D C T F E - S L Q P N F CMN D I D F Y Y S L Q - - - - -

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40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T S A NG I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

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50 60 70 80 90 - L L W L L S I MV I A MA V MT S S G H P WT G D S R A K Q K R N E R - - - - F NG N - S V W I L S M I A L S WA V E D S L F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I S G F - L A I F V G T S V V L V S V S S S S L S E I K P M - - - - - - - - - - - - - - N NG H I - F L L A V L I A N S F R L N S A MF E Q P D S Q - - - - - - - - - - - - - - - S K E QM - I I Y F I V L I N Y C Y CQ N V I T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D S T NM R L R R S LQP DT V DF S F QS F S S E T L L E R V A R S S S R F S A S F R K S A I P - MA A I L L V S L L F C I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A F G H - L G V A L A C C C C C C R C C S C S A V P G V V A G A L QQQQQG A A T R T L R L D - L L T L L G T P L V T HG T P P L V V D P S I G S Q L G L G S V L G L D L G S MGG S - MS L F L G V S F F I WP L A P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A V A F -

130 140 150 160 170 180 P C S A I V E V S I C A GG C D T S - E I P D Y K V P F K I I N - H P V C T Y G E V R P R T V R I CG - D N H P A P - CWD H V S V WS C HG R C D S N - E I S DWR F P Y K R S H - H P V CMH A G R T R S V A T L R H C H P E A D A E - CWD Y V S V WS CWG R C D S S - E I S DWK F P Y K R S F - H P V C V H A Q R Q L V V A I L K N C H P K A E D S - CWD V V T V T S CWG R C S S N - E I A DWR F P F K R S Q - H P V CQ H D S I L P R A I I L R N C D P E V N P G - CWD T I T V V S CWG R C D S N - E I S DWR F P Y K R S H - H P V C I HG E R K P K T V I L S N C D N D V E P G - K T - Y T R I QK CE GY CE S Y - E I P K V NDR I E R I - - HS V CT AQT T R T V R V V NP Y CE P GV NP - C I - A V N T T I C S G Y C K T M - D P N V K G R Q L K T L S NQ N V C T Y H N Y I H K T V S V P G C P V H V N S - A R - - V T T D A CWG R CQ T WE K P T - L E P P H V E A H - H R V C S Y N E T R A G S V R L P G C A P H V D P - CM - A V T T T A CGG Y C R T R - E P V - Y R S P L G P P P - Q S S C T Y G A L R Y E R WD L WG C P I G S D P - C H - P V E A T I C S G H C V T K - D P V - MK T WF S NMY - Q S V C T Y Q E F Y Y K T F E L P D C L P G V D P -

Multiple sequence alignment of Platynereis glycoprotein beta with bilaterian glycoprotein beta pNPs.

Multiple sequence alignment of annelid vasotocin-neurophysin pNPs shows a potential C-terminally located peptide (SYPamide in Platynereis and SLGamide in Capitella teleta).

-

-

-

-

-

-

-

-

10 - - - - - SL - - - - - - - - - - - - -

20 30 40 50 60 70 80 90 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MT Q I L K L S L L F L I L L G D K L L T CG K V L E E M - - - - - P T L QQ I P L - - - - - - - - - - - K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M - - - - - RG - - - - - - - - - - - - - - - - - P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MR WT Y L V L G L D L L F A V F L T F K L T S A - - - - - Q NME G - - - - - - - - - - - - - - P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MN L L F MWS T L V A L L L S A N L I I S Y P L T F T G - - - - - P F E E DG L R L K R D P S F I S S G P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MS N L I N K V V I F A L L F V A P S L S D S S L D D I D V H - - - - - P I S V R S K A K - - - - - - - - - - P L E L K F V F K R K E N I S V M L I L GQQ S T P MD A T K R P R K C L L P L L L Y L L L V V L T L T I D S A E - - - - - G N I G DG - - - - - - - - - - - - - P - - - - X S GMN F C P A I P H L N L S MS R S G S S A MT E V MK L S Q I L I L L L L G L S V I I C S V H A N - - - - - T D D D D A R L V MV MS QMH - - - P - - X I R N I V L I K QQ K K G K MF A K S G F L K D F S N I S K Y S A A L I L F L I V V S MC E N V G A MD NQ Y S D L P P - - - - - - - - - - - - - - - - - P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MQM L P A F I F V T T F V T C I I Y A G F C Y G D P I R P I - - - - - Y E R N E NM L - - - - - - - - - - - R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MHQ N N N S NMV R V V V Y I G F V I Y V MV L A T T C C C H P V T S T - - - - - E V E S I A - - - - - - - - - - - - - R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MC H T MR C I L I V C V A I A L L A A G C S V E A S - - - - - N S - - - - - - - - - - - - - - - - - R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MQ S K C T S N N V Y MF V A L L T F G I M I V H C E - - - - - P Q P MA - - - - - - - - - - - - - - R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M I S K T T MQ P Y S N T I Y L Y L A L F I F G I M I V HG E - - - - - P E P MA - - - - - - - - - - - - - - R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MR V S L A MMH L T Y L T L T V L A L G S V S V Q S E - - - - - P E P MA - - - - - - - - - - - - - - R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MWT R MS L V R F L G C L F L V A V V G T T N A Y A E - - - - - P E P MA - - - - - - - - - - - - - - R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MA A A C R C L S L L L L S T C V A L L L Q P L L G A R - - - - - G A P L - - - - - - - - - - - - - - - E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ME R S R R L W L Y - V L T C A L I L L V G L E T L A E S Y - - - - - P S - - - - - - - - - - - - - - - - - K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MG L CG L T L A L S L L V C L G V L A E G Y - - - - - P S - - - - - - - - - - - - - - - - - K

Platynereis_NPY1 Platynereis_NPY2 Platynereis_NPY3 Platynereis_NPY4 Helobdella_179309 Lumbricus_CO048390 Capitella_EY648133 Brachionus_FM936847 Pediculus_XP_002428285 Acyrthosiphon_XP_001944865 Drosophila_XP_001953779 Megachile_XP_003704248 Apis_XP_003690867 Nasonia_NP_001161193 Harpegnathos_EFN77166 Pongo_XP_002827208 Monodelphis_XP_001369320 Cricetulus_EGV94736

-

Platynereis_NPY1 Platynereis_NPY2 Platynereis_NPY3 Platynereis_NPY4 Helobdella_179309 Lumbricus_CO048390 Capitella_EY648133 Brachionus_FM936847 Pediculus_XP_002428285 Acyrthosiphon_XP_001944865 Drosophila_XP_001953779 Megachile_XP_003704248 Apis_XP_003690867 Nasonia_NP_001161193 Harpegnathos_EFN77166 Pongo_XP_002827208 Monodelphis_XP_001369320 Cricetulus_EGV94736

100 110 120 P V R P NR F R NK DE L HS Y LQS L R DY Y S V I GR P R F GK R P L R P A V F HNP K E L R S Y L K S L NE Y F A I VGR P R F GR K P P R P A I F R T PQE L R DY L S D L NE Y F M I VGR P R F GR S P V R P S S F K S P E E L ME Y L Q K V R A Y Y N V MS R P R F G K R L P L P A L F K N I DQ L D K M L T D S F H S S S V Y G R P R F G K R P V R P D R F R T V A E L N K Y MA D L T E Y Y T V L G R P R F G K R P K R P E H F R NMD E L N V Y L D K L R Q Y Y T I L G R P R F G R S P A K P E R F T S K QQ L K E Y L V K L H E Y Y A I I G R P R F G R S P T R P K I F S S P NDF K S Y L E D L GNF Y A I AGR P R F GK R P T R P K T F G S P D E L R S Y L DQ L GQ Y L A V V S R P R F G K R P P R K N D V N T MA D A Y K F L Q D L D T Y Y G D R A R V R F G K R P T R P E V F T S P E E L R R Y I DHV R E Y Y T L SGK A R YGK R P T R P E I F T S P E E L R R Y I DHV S DY Y L L SGK A R YGK R P T R P K V F E S P E E L RQY L D L V K E Y Y S L S GK A R Y GK R P T R P K A I A S P E E L E R Y F D L V R DY Y S L R - R A R YGK R P L Y P E D N T T L K QMA Q Y T A E L R R C I NM L T K P R Y G E R P DS P RQDA A A E D L A R Y Y S A L R HY I N L I T RQR Y GK R P D N P G E D A P A E DMA R Y Y S A L R H Y I N L I T R Q R Y G K R

Truncated multiple sequence alignment of Platynereis NPY pNPs with bilaterian NPY/NPF pNPs.

Multiple sequence alignment of annelid and mollusk RGWamide and APGWamide pNPs. These precursors share a Cys-containing stretch at the C-terminus of the precursor.

10 20 30 40 50 60 70 80 90 Platynereis_AKH1 - - MR A W L V L L V A C I V I A Y - - - - Q A H T S D A Q F S F S L P G K W - - - - - - G NG K R A A L GW - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G K R G E CG D F D Platynereis_AKH2 - MMR L WV V Y L T V C V MM L F A F F P H V C H S Q L T Q S L G - - - - WG S A G S S G K R S V K S P I Y Y G D D - - D D Y D Y D V R Q V R K N R - - - - - - - L T L S E A L C S Q D E Capitella_EY628641 - - MK H F T L L L V A C I V V A Y - - - - HMN T A S A Q F S F S L P G K W - - - - - - G NG K R A F S F S - - - - - - L P G R WG A QG K R A S G - - - - - - - WT G A T T D C S R ME Malacoceros_FR764845 - MR S C V F L L V V A A I V V A Y - - - - Q L Q D A E A K F S F S L P G R W - - - - - - GG A K R G S A F S F S - - - - L P G R WGG A G K R S - - - - - - - - - - - E E L G A CG E V D Aplysia_FF069541 MR A R G L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P A G A N V H P G - - - - W - - - - - - G K R S GG - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D Y C E T L E Drosophila_XP_001353031 MN T K S E V I I I A A V L C F L L - - - - A C V E GQ L T F S P D - - - - W - - - - - - G K R S V GG A GGG S - - - - - - - - - - - - - - S G V F - - - - - - - F E P QQG N C K T - S Locusta_AKH3_LOCMI MQ V R A V L V L - A V V A L V A V - - - - A T S R A Q L N F T P W - - - - W - - - - - - G K R A L G A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P A A G D C V S A S Cherax_AAV80404 - MV R G S V A L - L L V V L V A S - - - - S C V S A Q L N F S P G - - - - W - - - - - - G K R T G T A A GG P D - - - - - - - - - Q T I L H S S S P - - - - - - - A A V A S D N CG T I P Carcinus_RPCH_CARMA MV R R T G V T L L V V A L V V V A - - L V S S V S A Q L N F S P G - - - - W - - - - - - G K R A A A G S G S S GG V G E A V S A L H H S V GG A P GG V V P P G S S S S S G D S CG P I P Rimicaris_ACZ51370 - MV R S G V I L - A MA V V M L V - - - - S C V T A Q L N F S P G - - - - W - - - - - - G K R A G L A A G A GG DGGQ L H A A S G L A L P A T S S - - - - - - - V G A R G D N C A T I P Macrobrachium_ABV46765 - MV R S G V S L - V L A V L V L V - - - - S C V S A Q L N F S P G - - - - W - - - - - - G K R A A A A G V G T G S E A Q L H S A S G L A L P G S S V - - - - - - - - - T R G D N C A S MQ Culex_XP_001842492 MD L V K L F S V L L V C A A L I F - - - - - V C E A Q L T F T P S - - - - W - - - - - - G K R S - A A P L A MN - - - - L P N S F - - - - - - - - - - - - - - - - - - G I Q D S C K T - P Rhodnius_ACZ52614 - MA T N L F I T - S V L V L L T F - - - - H Y T L A Q L T F S T D - - - - W - - - - - - G K R S V R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H N A P D C T P - N Tribolium_ABB58739 - MS R MF - - - - L I V V L I A F - - - V G V C T A Q L N F S T D - - - - W - - - - - - G K R S G S S A G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S D A N N C K E - P Acyrthosiphon_NP_001243520 MR T L L L L A V F M L C A C I A V - - - - - - - - GQ V N F T P T - - - - W - - - - - - GQG K R N A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P A S D E C K S - 100 110 Platynereis_AKH1 P D A I F N V Y R A I Q A E A L R I N E CMQQ Platynereis_AKH2 K DA I S K I K K L I QR E V V RQR Y CNR K K Capitella_EY628641 S DGMMS V Y A A I Q E E A I K M L E CMG K Malacoceros_FR764845 P E A MY Y I Y S I I Q A E S I R MS D CMNG Aplysia_FF069541 K MV D A Y I Y K A V E V D S R R L A D CG S G Drosophila_XP_001353031 NE M L L E I F R F V QS QAQ L F L DCK HR Locusta_AKH3_LOCMI P QA L L S I L NA AQA E V QK L I DCS R F Cherax_AAV80404 V S A V MH I Y R L I R T E A A R L V Q CQ E E Carcinus_RPCH_CARMA V S A V MH I Y R L I R N E A V R L V Q CQ D E Rimicaris_ACZ51370 I S T V MH I C K L I K R E A S R L I Q CQ E E Macrobrachium_ABV46765 I S T V MH I Y R L I K R E A S R L V Q CQ D E Culex_XP_001842492 V D S L MV I Y R M I Q T E A Q K I L E C NQ K Rhodnius_ACZ52614 P D T V I F L Y K Y L Q N E F Y K M I E CG K T Tribolium_ABB58739 V E T I M L I Y K I I QNE AQK I I E CE K Y Acyrthosiphon_NP_001243520 MD T L I Y I Y K L V Q N E A Q R I A MC E R M -

Truncated multiple sequence alignment of Platynereis AKH pNPs with protostome AKH/RPCH pNPs.

Platynereis_GnRH1 Platynereis_GnRH2 Dysdercus_ACN54268 Bombyx_NP_001036899 Daphnia_ACJ05606 Bombus_XP_003494000 Megachile_XP_003706036 Drosophila_XP_001955601 Camponotus_EFN63812 Carassius_GON3_CARAU Verasper_GON3_VERMO Homo_NP_001492 Mizuhopecten_BAH47639 Alvinella_GO150661 Lottia_FC805607 Aplysia_NP_001191482 Uroteuthis_BAH09303

-

-

-

10 20 30 40 - - - MQ N C S WV S C L L A L A T - A W L T L S A L L T P V S S Q A Y H F S - - - - - MR F C V - - - - - - - - - I A L V L V A MT A L T S A Q H A H F S - - - - - - - - - - MR R T S L - - - T I A L F S P S N D V Y MCQ T F Q Y S - - - - - - - - MV T N I - - - - - - T L I L T L MT L A S V T A Q T F Q Y S - MF I NQ Y V R Y S S S I A MA V R L Y F V L L L V V V S A MA Q T F Q Y S - - - - - - MG N A R V L - - - - - - I L F I L S L T V MT V T CQ S Y H F S - - - - - - MV V T R I L - - - - - - L F F V F S L T MT T V I CQ T F Q Y S - - - - - - MMR L L L L P L F - - - L L S L S V A CMGQ T - - - - F Q Y S - - - - - - - - - - - M L - - - - - - V L F V L S L V V S C A L CQ T F Q Y S - - - - - - ME G K G R V - - L - - - V Q L L M L A C V - L E V S L CQ HWS - - - - - - ME A S S R L - - - - - - V V Q V L V L M L V V Q V A L S Q HWS - - - - - - MA S S R R G - - - - - - L L L L L L L T A H L G P S E A Q HWS - - - - - - MS S Y T Q I L V A - - - Q L L L A G L L V A V V S GQ N F H Y S - MD L R MT T I A V T L - - - - - - T V L V I MS S V H S V Y S Q A Y H F S - - - - - - MMP V P L K Y F G - - - L A L T L A L V T E L A V GQ H Y H F S - - - - - - MA C R I T S A T T T L F S I L L L I V I A E L C S A Q N Y H F S MS T S P V T S T L R R MV F L T C - A I F L L S L CMQ T Q A Q N - Y H F S

I -

50 NGWMP G - - - K R S S L T GWT P G F G I G K R ME R GWT NG - - - - K R S F R GWT NG K R DG H K R R GWT NG - - - R K R S D P DWT N E - - - K T S I F HGWT NG - - - K R S V S R GWT NG - - - - K R A L R GWT NG - - - K R S N F Y GW L P G - - - G K R S V Y GW L P G - - - G K R S V HGWY P G - - - G K R A L NGWQ P G - - - K R A P M NGWF P G - - - R K R S I NGWK S G - - - R K R S G NGWY A G - - - K K R S S NGWH P G - - - G K R S G

Truncated multiple sequence alignment of Platynereis GnRH pNPs with bilaterian GnRH/corazonin pNPs.

Platynereis_7B2 - Capitella_EY548619 - Crassostrea_CU992556 - Daphnia_EFX89982 ML Drosophila_NP_001014608 - Aplysia_NP_0011916287B2 - Platynereis_7B2 Capitella_EY548619 Crassostrea_CU992556 Daphnia_EFX89982 Drosophila_NP_001014608 Aplysia_NP_0011916287B2

I -

T -

T -

10 - - MR T W - - - - MK L - - - MA F T - VT RRRS - - ML F RSQT - MN I L L - -

20 30 40 50 60 70 80 - - A MT G L A G L M L V L L V A - N V R A - - - D Y Y - - - - - - - - - - - - - - - D D Y L V Q D L Y K R L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L I C F V A S L V V A S MA M - N L D S Q L Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - E D L L ME D F Y R R - - - - - L A - - - - - - - - - - - - - - - - M I L S V L A I S F L M - A E A K V S P - DG S L V W - - - - - - - - - P D L - - GQ L Y A L D D L R NG - - - - L G - - - - - - - - - - NG Y Y D - - A T G R MV S L L F L S C V V - A L A T - A F R S H - - - - - - - - - - Q D T M L S D V Y L R G I MN H L G D K M L A - - - - - - - D A P E G Y L D H V F P G V Y MMV A M L V V A L - S G Y Q - V Q S Y S - - - - - - - - - - A K D I L A D V L MT D L L N R - - - - - MD K DMQ V G Y Y D V G N E A A - - L A A T L V G V T L A - - - - - S Y D P - - - - Y V DMA Q L Y R MQ L L A N A F D D Y L P E S Q L L D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

90 100 110 120 130 140 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S Q L D D - Y L A E D N E A Y - - - GG N S DW L D D R I P - - - - - - - - - - - L L D D E D P Y Y P Q T N E MN E V P I A P P E S S L S E G I S L - - - - - - - - L E S R S S P NQ DWS N A G Y Q E P T L N D D I F S E - - - - - - - - - - - - - A S I - - - - - - - - Y P L P S Y E DMMMG P S V T S E T E S E MK E Y E E A P E S L N E P R E R L G L G L - - - - - - - - A G S K D N V D L V S R S E Y A R L C DGG S D C I L Q - - - - - - - - - - - - - S G S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S R S E E P Y WP E L E D V A E P Q D D K D A I Y N D R F Y S G A - - - - - - - - -

150 160 170 L D S R D - G T T D I R D H E Y L E H S A S K G - - G F Q Y I S - GG A - D S R G DG E T M I R D S E Y V E H S S N A G S HG F I HMS - GG A - - - - - - - - - - - R DQ E Y Q E N S P L W - - - G Y Q S V S - GG T - - - - - - - - - S L R DQ E Y L K H S S L F S R QQ E D DQ P P S G T - A S G A A S H P S L R D D E F L Q H S S L W - - - G HQ F I S - GGM - - - - - - - - - H L R DQ E H L E H S A L H - - - G Y Q S V S - GG A

180 190 200 210 220 230 240 Platynereis_7B2 G E G NQ H L T P E G T Q N N T H - E V K S D E A L P - F Y C H P P N P C P K G F T - E E - - - DG CQ L D - - V K D T A E DQ K K W I Capitella_EY548619 G E GMQ H L T P E G T Q N N H L - E V K T D E G L P - F Y C H P P N P C P K G Y N P T S - - - D E C I D S K L F K D T A E S Q K MW I Crassostrea_CU992556 G DG K D N - - - - - - - P K Q V K - - - T D K V L P - A Y C N P P N P C P I G Y T - S D - - - D N C V E N - - F E N S P D N N R K L Daphnia_EFX89982 P T G S V K V S T P S S S S G K - - - - - T E N V L P - A Y C N P P N P C P I G Y T - A E - - - DG C L E E - - F E N T A A F S R E Y Drosophila_NP_001014608 G E - - - - - G P N R Y - P T I V K - - - N D A G L P - A Y C N P P N P C P E G Y D - ME T QGG S C I V D - - F E N T A I F S R E F Aplysia_NP_0011916287B2 S E - - - - - - - - - - V P P N P K Q V K S D K Q L P E - Y C N P P N P C P V G K T - A K - - - D N C V E N - - F D N S A E N N E R L -

250 260 S K MMA S GQ C S C D E E HMF S C P K E A MT K QG R C S C DQ E HMF E C P K - - - MK QQ E C P C D K E HMF S C P S - - - Q A A Q D CMC D T E HMF D C P A - - - Q A A Q D C T C D N E HMF D C S E - - - L S QQ D C P C D T E HMF S C P A

270 280 290 300 310 320 330 340 350 Platynereis_7B2 D R S T - - - MN A D K G H E G R D D L D N V L D S L L A G K - - - - - - - - - - - - MD N P Y S V G N K R E K MV A K K - - - - - - - - G H P G N L N L G N P F L DGQ V V H T Capitella_EY548619 E Q T - S NG I S G L GG S S K G V E S R E D F D S I F S N F - - - - - - - - - - - - - - - - - WD DGQ T E D L - - - - - - - - - - - - - - F G A Q D K R H P F V V A R N L L X Crassostrea_CU992556 D T S - - - - - - - - - I S T K S G P S L D S V I E Q L G NM - - - - - - - - - - - E N N A Y MS T N E K R K S L - - - - V A K K S P H L V K R E A E Q A R N P Y F DG P H N K V Daphnia_EFX89982 S S L - - - - - - - N H K N D K N R A T A NMV D T A I R K I - - - - - - - - - - - - - - - MS D F QG E H K S L V S K K - - - - - - - - - - F F A D K S E N P Y L QG D K L P I Drosophila_NP_001014608 Q D S - - - A D V GG D K G D L N S A V E Q Y I MQMGQ E N S L N N V N S L A K K A G Y P V MP D P R L D D A V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I N P F L QG D R L P I Aplysia_NP_0011916287B2 G S Q - - - - - - T V S S K A Q S S G NQQMA L N K V MD E I A K ME H DG E S L E N N P T MS E T R K R V T L V A K K - - S P H I I H K R S E Q S D H S N P F L QG A P V A I Platynereis_7B2 Capitella_EY548619 Crassostrea_CU992556 Daphnia_EFX89982 Drosophila_NP_001014608 Aplysia_NP_0011916287B2

360 VAKK - - - VKRN - - - AAKK - - - AAKK - - - AAKK - - - A A K K DP NT

370 380 - - GG V G S V MMK - - - - - - - - A A D D A M I E E Q L A K MK X - G S Y I P R HQ - - - - - - - - - - GNR V V A - - - - - - - - - - - GN L L F H - - - - - - - - - A Q R V I P QWA R Y DQ P L R - -

Multiple sequence alignment of Platynereis 7B2 pNP with protostome 7B2 pNPs.

10 20 Platynereis_achatin S T L F P Y T T L F RSGK L T L VQV V S F A Helobdella_jgi|Helro1|177126 MR L S L S K I I - - - - - L L A L M L Y S V S T Achatina_BAA82260 MA S S P H Y L L - - - - - L V V V L V V T L T Aplysia_NP_001191589 MT S S A Q C L L - - - - - L T M L L V A T L D Lehmannia_BAJ34721 MA S L S L Y F L - - - - - A T V A MA V A L N Saccoglossus_XP_002732147 MA S S L L H R I - - - - - I L F L L V S T F L -

S -

I -

30 40 50 - - - - - - - - - - - - - - - - - L L V L V I A NDE - - A S A WK A H R T N E D T I D H L L H P S D I R N N S E A P - - - - - - - - - - - - - - - - H I T A S DF E F L E - - - - - - - - - - - - - - - - - - F L Y AE D I GF AE - - - - - - - - - - - - - - - - - - L I AASD I EYSE - - - - - - KV RT E S S E S S P N L H I VGN I Q L T E - - -

Platynereis_achatin Helobdella_jgi|Helro1|177126 Achatina_BAA82260 Aplysia_NP_001191589 Lehmannia_BAJ34721 Saccoglossus_XP_002732147

90 100 110 120 S R E L E - - - - - - - - - E NE I Y DE I R DF GN - - - - - - - - - L T NF S DY L R RQ I Y RGE D - F D L DY E - - T V - - - - - - - - V E P F E - - - - - - - - - E DV - F L L - - - - - - - - - - - - - - - L T P F A - - - - - - - - - GA V - A DHV L K EGF G - - - - - - - - LGS F E - - - - - - - - - E DE - Y I S - - - - - - - - - - - - - - - I D E N E V K R G F G N K R E D V V F A D D V K R G F G N K R DG F Q T I


180 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E NS K V S DS DS E S V DT


260 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S K DE E S NA A L S DF - - - - - - - - - - - - K R V DT L T E LQA D -


350 360 DK RGF GDK RGF GDK RGF GDK RGF GDK - - - - - - - - - - - - - - - - GF GDK RGF GDK - - - - - - - - - - - - - - - - - L L A R QG L WE - - - - - - - - - - - - - - - - - - L L A K QG F WE N - - - - - - - - - - - - - - - - - L L A R QG F L E - - NK RGF GNK RGF GNK RGF GNK RGF GNK R T

I

- - - - - - - - - - AD I

- LS - - - - -

130 140 - - - - K RGF GD - - - - - - - - - - - - - - - K RGF GD - - - - - - - - - - - - - - - K RGF A D - - - - - - - - - - - - - - - K RGY F D - - - - - - - - - - - - - - - K RGF A D - - - - - - - - - - - L DDE K RGF GNK R A E P E K I Y GNT

190 200 210 - - - - - GF GDK RGF GDK RG - - - - - - - - - GF GDK RGF GDK RG - - - - - - - - - GF A DK RGF A DK RG - - - - - - - - - GDA S K RGF F DK RG - - - - - - - - - GF A DK RGF A DK RG - - - - S E L K Y G L E N K R G F G N K R G S S S ME

220 - F GDK R S A E A E - F GD - - - - - - - F AD - - - - - - - FFD- - - - - - - F AD - - - - - - L I DD - - - - - - -

I -

Y NDK V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

60 - - - L K NK - - - - - - - - - - - - I

I -

T -

70 80 - - - - - - - - - - - - - - - - NL LD E K DE DE NK NT E E NE T P DD L N - - - - - - - - - - - - - - - - P DQ D - - - - - - - - - - - - - - - - T DS E - - - - - - - - - - - - - - - - S DS D - - - - - - - - - L A DQG D D A L I E

150 160 - - - - - - - - - - - - - - - K RGF GDK R - - - - - - - - - - - - - - - - K RGF GDK R - - - - - - - - - - - - - - - - K RGF A DK R - - - - - - - - - - - - - - - - K RGF F DK R - - - - - - - - - - - - - - - - K RGF A DK R - F GV A S L K D L E E DE GR K RGF GNK R DF

230 L E EG I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

KER - - - - - - - - - - -

I -

240 N A MF - - - - - - - - - - - - - - - -

DS - - - - - -

250 L P A A Y K RGF G - - - - - K RGF G - - - - - K RGF A - - - - - KKSYAD - - - - - K RGF A - - - - - K RGF GN

270 280 290 300 310 320 330 - - D K R G F G D K R G F G D K R A A D K R G F G D K R G H E E A F N S Q E L N D Y L E N L N NQ L K F R MF A H H V F D K R G F G D K R G F G - - DK RGF GDK RGF GDK R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - DK RGF A DK RGF GDK R - - - - - - - - - - - - - - DE I S P A L L R L L QHS Y QS Q - P L P L RGHS A F S R - - - - - - - - - A E D K R G F F G K R Y Y G S K R - - - - - - - - - - - - - - E E I S P R V L N L L L R N Y Q I H - P S P L NG H N A F S R - - - - - - - - - - - D K R G F A D K R G F A D K R - - - - - - - - - - - - - - E N I N P L V V K L L QGG F L G K - N DQG T G H S S F S R - - - - - - - - - DDDK RGF GNK RGF GNK R V DT F E E F QV DDDDK RGF GNK RGF GNK RGF GNK R V DT F E E F QV DDD - - - - DK RGF G 370 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E T AGY E P DS P

380 - - - - - - - - - - - - - - - L KGF

I

390 400 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D K WR K ME E E A V S D R L S E K K N S

Multiple sequence alignment of Platynereis achatin pNP with bilaterian achatin pNPs.

Platynereis_Luqin Capitella_EY612671 Saccoglossus_FF486270.1 Strongylocentrotus_XP_003723362.1

10 20 30 40 50 60 70 80 90 M L C K Y L A V A T I L A V - - - - - L A P Q L A Q S - - - WR P QG R F G K R T L D S N S L S E V F Y G N K G L D A D Y G - - D D L S D S E DMP N A - - F R H N N L V C L R K S Q S - MS K L I I MG I L S A I L A L L S I T P S S A E GQ F A WR P QG R F G K R - MD S T P V N S L D N A E S P L T N T L Q R L N S L R G S I H L L E S A MF E T E D A I C I N A G T K MT T K V T C V C I V L I A - - - F I F T S Y V D A E G - - S N T F L R WG K R F N P T T T - - - - - - - - E P E E T T - - - - C E L P R E I S MH I - - - F G D E E V Y C R R F Q K G MF L V L L L T C L L L Q CG S G S A S A Q E I R S P GG K P H K F MR WG K R F L D T Q A L N A - - - - - K P T P V E S G S - D E L P N E L M I P V - - - I G T D R I L C K H I A A G

Platynereis_Luqin Capitella_EY612671 Saccoglossus_FF486270.1 Strongylocentrotus_XP_003723362.1

100 110 G L Y K C I R L RGAQDV P L D L HT A GY Y K CY S F S E DE R L PQF - - - G L Y R C E S R K NG K Y C E - - - - - G L Y K C I S Y R T P K S D S V Y DME Q

Multiple sequence alignment of Platynereis luqin pNP with bilaterian luqin pNPs showing the conservation of a small amidated peptide and a C-terminal Cys-containing peptide.

Platynereis_tachykinin-1 Platynereis_tachykinin-2 Alvinella_GO121455 Rhyparobia_AAX11211 Periplaneta_AAX11212 Solenopsis_EFZ11618 Megachile_XP_003703494 Bombus_XP_003397025

10 20 30 40 50 60 70 80 90 - - - - - - - - - MT S A M L L T V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G L L S L I G H L S WA K I V I P D V Y - - - DQ D D N S D L F E F E D F A N T QQ K R R - - - - D T - - - - - - - - - MT S T I V L T L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G L L S L I G H V T WA K L V L N D V Y - - - DQ E D N N D L F E Y E D F A N S Q K R S D - - - - D N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MA F P C P R S R V G A L I L V T L S L I A V V L C A P E E S P - - - - K R A P S G F L G V R G K K D N - - - V I P E F N S D E F N E A A D K R A P A MG F QG V R G K K D - - - - - MV L P R H R S R A G A L F F I T L S L I A V V L C A P E E S P - - - - K R A P S G F L G V R G K K DG - - - - G F S V E D P S Y N E V L D K R A P A MG F QG V R G K K D - QQ E P L - - - - - - - M L I S S I F F L V V WT S S S F A E E S S S S D A A S A K R A P MG F QGMR G K K D L - - - - I P T I A - - - E H N E L S K - R T L V D F QG K D S S A S - D I E D N - - - - - - - M I I R S I A L L MV S L T F A C A E E S D I L E - - - - K R V S MG F QGMR G K R E F - - - - - - - - - - - - L S D E L S K R A P M - G F QGMR G K K S L - - - E S - - - - - - - M I I P S T F L L MV S V T F A I A E E S MS E N V L S D K R A V MG F QGMR G K K N F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D S


100 110 L I E D P E D - - E Q V D S Y P F K R MD S NQ - L I E E E - - - - D R V D T Y P F K R MD S NQ - MA A E R Y E - - K R A P P S G F NG V R G K R - - Q D E D L G Y D K R G P S MG F HGMR G K K - E Q D A G F D - - K R G P S MG F HGMR G K K - L L R D E L D - - K R A P M - G F QGMR G K K - E L A E A I D - - K R A P M - G F QG T R G K K - L D S E D F G I L K R A I M - G F QGMR G K K N S


190 200 210 220 230 240 250 260 270 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - F F HMR G R R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - F F HMR G R R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R P P A - GY V V V RGK R V K R A P S MG F QGMR G K K D Y - F D D E D E Y F K R M - - - - G F MGMR G K K E G D F E V D D Y P - - - - E DG L W - - - - S E DG E G E E MD K R A P A A G F F GMR G K K V K R A P S A G F HGMR G K K D F - D DG D F MA E K R M - - - - G F MGMR G K K E S D F E G D D Y P E G L A D D D V WG DQ D E E F T GG E D V N K R A P A S G F F GMR G K K V K R A A - MG F Y G T R G K K T Y V F E Y P Q D Y E K R L L E M - G L Q DMH D R MK E - - - - - - - - - - - - F P A E W - - - - - - - - - - - - - E K R A L M - G F QGMR G K K T E R - - - - R F L D P R E N Y I N - S D Y P E E K R - - - - - - - WY QG V C D E N D - - - - - - - - - - - - - D P A E W - - - - - - - - - - - - - E K R A P M - G F QG T R G K K I K T T T - - R F Q D P R S K DMY V I D Y P E D Y E K R I L S ME G Y P N I F D K E - - - - - - - - - - - - - - G E F L W - - - - - - - - - - - - - E K R A P M - G F HGMR G K K L


280 290 300 310 320 330 340 350 360 - - - - - - - - - - - - - - - - - - NGQ S E - - - - - - - - - - - - - V MV D E Q D P E A L L K L A - - - - - - - - - - R Y F R Y L Q A K R S L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - NGG E S - - - - - - - - - - - - - L T V D DQ D P E T L L K L A - - - - - - - - - - R Y F R Y L Q A K R S L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P P S G F T G L R G K K A - - - - - - - - - - - - - - - - - - A P S G D V QG Y D - - WR E K K S P P E G F L G L R G K K A A A P D V V N A - - - - - - - - - - - - - - - - P A S G F F GMR G K K G P S V G F F A - - - - - - MR G K K A P S A G F MGMR - - - - - G K K A P S G F MGMR G K R - - E D L DG E D L D S L L Q Y - - - - - - - - - - P A S G F F GMR G K K G P S V G F F A - - - - - - MR G K K A P S A G F MGMR - - - - G K K A P G S G F MGMR G K K D S E ME G A E D L D S L L Q Y L D - - E E L E K R A L MG F QGMR G K K DG Y E N Y V D Y Y V D P DMD F D K R A P MG F QGMR G K K D T D K R A P MG F QGMR G K R S V GQ R F E P GMD F G T R P L D A L E E L E K R D - MD F QG L R G K K D P F D D Y L D Y S I - S P S D Y E K R A L D - L R D S E - G S E S F K R A R I G F HGMR G K R D A A K I Y G S N S S I A R T L D P WQ D L D K Q D V ME F QG L Q R R K D T F D D Y L D Y S M - N P S D Y E K R A A D - F Q D I E S G S D S F K R A R MG F HGMR G K R N V E E I Y G S N S N P T Q T -


370 380 390 400 410 420 - - - - - - R N D S P S G L S A K R Q P P QG F H A V R G K R S V L H - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R S NV P - S L S A K RQP P KGF HA V RGK R S F HH - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S DE R R L R HY I A SML H - A E R A P S - - - - - - GE S DNK P DF R F A L N - - - - - - - - - - - - - - - - - Y Q HG R D K R NG E R A P G - S K K A P S G F L G T R G K K D - - WP T QQG A E A G T E P D I H T S L S D - - - - Y Q HG R E K R NG E R A P A - S K K A P S G F L G T R G K K D - - WP S QQ V L T A I - - - - - - - - - - - - - - - Y QGMS D R R H A L A S CQ V E K R S P F R Y Y DMR G K K N P R WE L R GMF V G V R G K K WA R A P Y E D N S P F Y R QG S D R E N E L A A Y G I D K R S P F R Y L G A R G K K N P R WE F R G K F V G V R G K K S S S G T V E R V F - Y QG V N N R G N N L A V Y E I E K R S P F R Y L G V R G K K N P R WE F R G K F V G V R G K K A S S - - L Q S V Y - -

I

120 130 140 150 160 170 180 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E QQ D F L R D L V D K R G P NMG F MGMR G K K D P L D F D Y Y E K R A P S MG F QGMR G K K DQWE E - - D A DMY D P I T QQ E F L Q E F L D K R A P NMG F MGMR G K K D P T D F D Y F D K R A P S L G F QGMR G K K DQWE E - - D P DMY - - - - - D Y L I P D F E D - - - - - - - - - - - - - - - - - S L R E D Y E K R A P - MG F QGMR G K K I I V K L Q V L S D I E - - D P L A S L E Y Y D Y E K R A P - MG F QGMR G K K - - - - - E D Y R K R A P - MG F QGMR G K K S - L E Q - I L D E L K I A D V E NQ L F P E E T N K R A P - MG F QGMR G K K A - S L D D E Y Y K R A P - MG F QGMR G K K S - L E E - I L D E I K

I -

430 - - - - - - - - - - RLF - - - - -

- - - - - - - - - - DNT - - - - -

- - - - - ER - - -

440 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I G V DG D S P A T - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - - LGN - - - - -

Multiple sequence alignment of Platynereis tachykinin pNPs with protostome tachykinin pNPs. Deuterostome sequences were not included because of low sequence identity.

Multiple sequence alignment of annelid calcitonin pNPs shows an additional conserved C-terminal amidated peptide (e.g., DTSLYQKLVGamide in Platynereis).

L I I

- - - - - - - - - - DT G L - DS A - LGAA - - F HE - - T MG - -T IG

Platynereis_pedal-peptide1 Capitella_jgi|Capca1|224693 Aplysia_AAV84473 Helix_AAB51694 Lottia_jgi|Lotgi1|54854 Nasonia_XP_003426062 Nasonia_orcokinin Brugia_XP_001893561

10 20 30 40 - - - - - - - - - - - - - - MV L WK L L L P L L A T V L L V N A A P E K S HMK R S MG T Y L ME A L K R Q R R I H A R G P L GMT A D H T Y T K A H S P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MN V A K I P I F L L L V L CG S A L C E - - - - - - - - - - - - - - - - - - ME L S R I V A L A F V V L C V C A A N E E T N - - - - - - - N K R R Y D A I GG T S NMGG F K K R S Y F R N R R S L D S I N A F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ML L V V A L CC - - - - - - - MQ E WK S P K Q Y H Y S GG N L D H I GGG N L L R K K V V K I P N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ML S L I L L V L A LGE F NDA - - - - - - - -


100 110 120 I P L Y G R Q L D S L GG A E I P L Y G R Q L D S L GG A Q I R E L N D R E L D T L GGGQ V P L F D R Q L D S L GG - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L DK L T S DS E I E A E DV E DV DK R P F DS I SG - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R R MD S I DG - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T S V P V E T T T S D L K A DR R L I GV A E L - - I R I E K R S L D A L QG E G F GMK K R A L D A L E G - - -


190 200 210 220 230 240 250 260 270 S S NF AG L DK R P F DS I GHS S S F AG L K K R P F DS I GHS S S F - AG L K R A F DS I GHHS A F S G L R K R R S A E K R S F DS I GHS S NF AG L DK - - - K S F DS P S R D L G D N K R S F D S I G HMS S F GG L - K R N F D S I A H T S S F - GG L K R N F D P I G H S S S F GG F - - - - - - - K R A F D S I G H N S A F GG L K K R K R R S MD A T HGMS G F A K R P F D S I S QG E G L S G F A K R P L D S V Y G T HG L S G F A K R P L D S V Y G T HGMS G F - - - - - - A K R P L D S V Y G T HGMS G F A K - - - R P L D S S HG L S G F A K R P F D S I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S HGMS G F - - - - - - A K R P F D S I S G S HG L S G F A K - - - R P F D S F S GMGG Y R K R G L D S I S S F S GMGG F K K R G L D S I N S L S GM - GG F K R G V D A I DG F S GMGG F - - - - - - - K R G Y D K I NG F S GMGG Y K K - - - R G L D A V Q A L A K E L E K E G V A E L K S Q A E E R Q T R N A R N D Y D S - P D Y - G HGQ K F T G H R K P D S T H R L I - - - - - - N K G F S E T I I Y P S D I I E Y T NQ K - R N F D E T H R L I N K G F S E T I I Y P S D I I E Y T NQ K R N F D E I D - R S G F S G F S K R N F D E I D R S G F S G F N - - - - - - K K R N F D E I D - R T G F S G F N K - - - R N F D E - - - - - G F GMK K R A L D A L E G E G F GMK K R A L D A L E G - E G F - GMK K R A L D A L E G E G F - - GM - - - - - - K K R A L D A L E - G E G F - GMK K - - - R A L D A


280 290 300 310 320 330 340 350 360 I G H S S N F A G L D K K S F D S I G H S S N F A G - L D K R P F D S I GQ S S N F A G L D K K S F D S I G H S S N F A G L D K R S F D S I G H S S N F A G L D K R P F D S I GQ S S I DG Y S S F GG F D K R S F D A I D H N S A F GG - L D K R N F D L I G H A S A F GG L D K K S F D R I G H V S S F GG L E K K A F DQ I GG L S N F GG F D K K A F D N I G HQ S V Y G T HGMS G F A K R P L D S V Y G T HGMS G - F A K R P L D S V Y G T HGMS G F A K R P L D S V Y G T HGMS G F A K R P L D S V Y G T HGMS G F A K R P L D S V Y G T H I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S HG L S G - F A K R P F D S I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S H I DG L S GMGG F - K R GMD A I DG Y S GMGG - - Y K R G L D T I N S F S GMGG Y K K R Q L D S I NG L S GMGG F - K R GMD A I DG F S GMGG Y K K R R MD S I DG V S I DR - S GF S GF S K R NF DE I DR - S GF S GF NK K R NF DE I DR T E A V S P A S T RG - - - - - - - T S T R S T E A R NF DE I DR T - GF S GF NK R NF DE I DR - S I DR - SGF SGF NK R NF DE I DR - SGF SG - F NK R NF DE I DR - - - - - - - - - - - - - - - - - - SGF SGF NK R NF DE I DR T - GF SGF NK R NF DE I DR - S L E G - E G F - GMK K R A L D A L E G - E G F - G - MK K R A L D A L E G - - - - - - - - - - - - - - - - - - E G F - GMK K R A L D A L E G E - G F - GMK K R A L D A L E G - E


370 380 390 400 410 420 430 440 450 NF AG L DK R S F DS I GHS S NF AG L D - K R A F DS I GHS S NF AG L DK K S F DS I GHS S NF AG L DK K S F DS I GHS S NF AG L DK R S F DS I GHS S NF AG L S F GG L E K K S F D R I GG N S E F GG L E - K K S F D S I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G HQ S S F GG L K K R A T E L G E L H R A L A K R GMS G F A K R P L D S V Y G T HGMS G F A - K R P L D S V Y G T HGMS G F A K R P L D S V Y G T HGMS G F A K R P L D S V Y G T HGMS G F A K R P L D S V Y G T HGMS G F G L S G F A K R P F D S I S G S HG L S G F A - K R P F D S I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S HGMS G F GMGG Y K K R R MD S I DG V S GMGG Y K - K R R MD S I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - DG V S GMGG Y K K R R MD S I DG V S GMG K F GF SGF NK R NF DE I DR S - GF SGF NR K R NF DE I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - DR S GV P GF A K R S I A S S R S GK S QR T H GF SGF NK R NF DE I DR S - GF SGF NR K R NF DE I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - DR S GV P GF A K R S I A S S R S DR I F C I S G F - GMK K R A L D A L E G E - G F - GMK - K R A L D A L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E G E G F - G I D K R V L D A L E G A G L R MN R


460 470 480 490 DK R P - F DS I GHS S NF AG L DK K S F NS I GHA S NF AG L K K G R - - - L D R I D S P N DWS F K L MP K L K S R R F S S Y V P G H DG A K R P - L D S V Y G T HGMS G F A K R P L D S V Y G T HGMS G F A K A K R P - F D S I S G S HG L S G F A K R P F D S I S G S HGMS G F A K G K R T - L D E I D S V S G L G D L G K R Q F D T I A R N S GMGG F G K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I I Y HAQD I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P L K S SG I F L I L I S F L DS - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

P -

I -

50 60 70 80 V D D D D E N S I Y A G K GQ - - - - - S A R Q L D S L GG A E I P L Y G R Q L D S L GG A E - - - - - - - A L Y L S A P L A T P T K T E V K R S V R D D E R R E L D T L GGG N V P L Y E - - - - E T NDV T A DS DS - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E I I A NE DS - - - - - - - - - R A E K R S NV L L E K I DDNS E I HA S E - - - - - - - S DMGQ F G K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A L V AG L QA - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - EYFTETTT - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K S K F D E I K K MR D T I K G S R F R A K Q S L N S I DG S E F DG L GG I R

130 140 150 160 L Y G R Q L D T L GGGQ I P A E D K R A F D S I G H H S A F GG L K R A F D S - - - - - - - G F V P L Y E R A L H N R Q L D S L GG T - - - - - - - - - - - - - - - - E E V E A A K R A P E V A K R P L DS V YGT - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S HG L S G F A K R P F D S I S G S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - F S A MGG Y K K R A L D S I NG V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S P I S PQR E I I P L NA E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K S QA E E RQT R NA R NDY DS P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E G F GMK K R A L D A L E G E - - - - - - - - - - - -

170 180 I G H H S A F GG L K R S F D S I G H - - - - - - - - - - - - - - - -F IH - - - HGMS G F A K R P L D S V Y G - - - HG L S G F A K R P F D S I S G - - - - S GMGG F K R G L D S I N S - - - - - - - - - - - - A F AQP E Y - - - D Y G HGQ K F T G H R K P D S - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Truncated multiple sequence alignment of Platynereis pedal-peptide-1 pNP with protostome pedalpeptide-1 and orcokinin pNPs.

10 20 30 - - M I R S DV T L A F L F V C L A V R S F - - - - - - - - - - - - R L CGMS MV T V G L W I L A L A V S D S - - - - - - - - - - - - - - - - MWK L S F G A I K MQ S L L N V L - - - - - - - - - - - - - - - - - - ME H F T L T T L L L V F S S Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - MA K V G V S S L C L V L I L L C S A V S GG E V P DG V - - M I MMWR L L L L A L V S A A V L - - - - - - - - - - - - - - -

Platynereis_pedal-peptide2 Alvinella_FP490158 Crassostrea_CU988049 Lottia_FC762285 Aplysia_ABF18973 Lymnaea_CN810424

- MT - - - - -


G- - - - - A- - S- - GS S F G- - -


170 180 ML DE VGS S L L K - - - - - - - - - A F DT I GS S L L K - - - - - - - - - R L DR L S T GF I K R DDDT - - - - P V DS LGYG L I K - - - - - - - - - P V DS I GS S F I K R P V DS I GS S F P I DS I GS S F I - - - - - - - - - - -


250 260 S L L R K R V V DP I GS - - S L L DK RM I DP I GS - - GF I R R S NF DR I GS - - G L I K K R QMDQ L G Y - - S F I - K R P V DS I GS S F I GF I - K R P I DS I GS - - -


330 - - - - - - - - - - - - - - - - - - E- - - - - DS I GS S F - - - - - - -

I -

40 50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GF - - - - - - - - L KKKSQF VQAS S V S E T - - - - - - - - - - - - - - - -

60 70 80 - - - - - - - - - - - - - - - - A A R E K L E E QQ F M I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L V T L T I S CC I NR A T GT - S E A Y N HQ E D K R S L D R L G S G L V K K - - - - A E G A G DG S L S K R H V G S I G S S F I K R P V D S I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

90 100 110 120 130 140 150 160 - - - - S E A E DG - L H K R M L DQ V G S S L L - K K R MS P Q E D Y L MK - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S QGQ K R M L D E V G S S L L K K R - - - - HCDE HD - K DK RM L DH I GS S L L K K R L L DP V GS A L L D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R A L DP V GS S L L R K K - - - - D E E R S S - R H K R M L D R L G S G L I - K R E P D S K I D D L V P K L R Y Y L A K A I S E Q D DG S S P T E V D K R R L D R L DMG F I K K R - - - - D S I E DG - F N K R G L D V L G S G L V - K K P I DQ L G Y G L I K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R P I D S L G Y G L I - K R K R P V DS I GS S - F I K R P V DS I GS S F I - K R P V DS I GS S F I K R P V DS I GS S F I K R P V DS I GS S F I K R P V DS I GS S F I - K R - - - - D E V P DG D I K K R T I D L E N I E L E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S R G I D S I G S G F I - K R

I -

I -

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R P V DS - - - - - -

190 200 K RM - L DE V GS S L L K K RM L - R N DGQ D NM I E G P E - K R I L - E Y E N E N E DG E DQMD K R Y L - K R P - I DS LGYG L I - K R P V DS K R P - V DS I GS S F I - K R P V DS - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

210 - - - - - - - - - - - - - - - LGYG L I I GS S F I - - - - - -

- - - - - - - - - KKRP KRPV - - - -

I -

220 230 DE VGS S L L K - - - - - - - - - DP I GS A L L E - - - - - - - - - DR L DSGF L K R F V PGE D - - DS LGYG L I K - - - - - - - - - DS I GS S F I K R P V DS I GS S F - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

I -

240 K RM L DE V GS K R L L DP VGS K R Y F DR LGS K R P I DS LGY K R P V DS I GS K K N I DS I GS

270 280 290 300 310 320 - A - - L K K R M L D E V G S S L L R K R Y L D R L G S S L I - K K D A E E MME E G D R V A Y A A N N P - - S - - L L K R A F DP I GS N L L K R A F - DP VGS S L L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G - - F I K R R F DR LGSGF I K R R F - DR L NSG L I - K R N L DR L NSG I I K - - - - - - - - - - G - - L I K R P V D E L G F G L I K R P V - D E L G Y G L I K K R P V D S L GMG L I K K S D E L T D A D E I GS S F I K R P V DS I GS S F I K R P V - DS I GS S F I - K RGV DS I GS S F I K R P I DT I GS S F - S - - F I K RG I DS I GS GF I K R P I - DS I GS S F I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

- - - - - - - - - - - - LG L Y N I K RGV - - - - -

340 KRS Y S RE E V E E L LGK KRAF D - - - - - - - - - RQR L DR L G - S GF I K R K R S MD H I G - Y G L I K K K R P V DS I GS S F I K K R K RG I DX - - - - - - - - -

Truncated multiple sequence alignment of Platynereis pedal-peptide-2 pNP with annelid and mollusk pedal-peptide-2 pNPs.

Platynereis_pedal-peptide-related-3 Platynereis_pedal-peptide-related-1 Platynereis_pedal-peptide-related-5 Platynereis_pedal-peptide-related-4 Platynereis_pedal-peptide-related-2 Platynereis_pedal-peptide-related-6

10 K K N - N NQ NG Y DMK R - - - N NQ NG F D K K K K N - Y NQ NG F D K K - K N - N NQ NG F D K K K K N Y N NQ NG F E K K K K D Y N NQ NG F - - -

Multiple sequence alignment of Platynereis pedal-peptide-related peptides.

Platynereis_allatotropin Aplysia_NP_001191666 Tetranychus_allatotropin Ixodes_XP_002407036 Daphnia_Dappu1:308952 Aedes_AAB06179 Rhodnius_ACS45387 Samia_AAY68370 Helicoverpa_AAT92286 Saccoglossus_XP_002734994.1

10 20 30 40 50 60 70 80 90 - - - - - MK V V L C L F V V - - - - - - V F V V - - S V NGMD L R - - - - - - - - - - A P R A K R G F R T G A Y D R F S HG F G K R G E L T N E D D - - - - - - - - - - - - - - - - - M L S A P S I A H T G V A L L V L M - C L C P - - F S Q S T E A S L S R A K - - - - - - - - - - R G F R L N S A S R V A HG Y G K R G Y A S S S G A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MK I S K I F V T I L L G L MG T L V V L S L A Q K P R L R A Y R G L - - - - - - - - Q T R G - Y MP L T I S T A R G F G K R T N S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MA A L G R T S A L V A A A L - F L C L - - A A A G S E T P E A - - - - - - - - S D R Q H R GG F Q K L R L S T A R G F G K R I P P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MK G K G A F L MV L A GWG L I G L - M I L T T A V E A A P H P A D Y T S S S V N NQ R D F R S R R G F K T V G L A T A R G F G K R A P S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ME V T K MS A C R W L F L V I L C S V - L L C C H T S N A G P A R Q L A S L A A R A S K I P R S I R A P F R N S E MMT A R G F G K R R A P I G V N V GG S S G N V G V K H - - - - - - - - MMR WS S L L V L V A L A S I - I N C I - - K A G S P S S A L Y S S A A R A S G R T R T I R G - F K N V Q L S T A R G F G K R T Y P D S Q L Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MN F S MQ L V V V V - - A V - C L C L - - A D S A P E A R L V R T K - - - - - QQ R P T R G - F K N V E MMT A R G F G K R DG P H S R T E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MN F S MH L A V A V A A A A - C L C I - - V A A A P E G R I T R T K - - - - - QQ R P T R G - F K N V E MMT A R G F G K R D R P H T R A E R D V E HQ A P T S R S H R G T - - - - - - - - - M L I F S A V L V A V - L F T H - - T S AQP QC - - - - CRGV GCK I P P NCK CP F QS I I C - - - - - - - - - DNP T K NV L - - - - - - - - - - - - - - - -


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - KSPT - - - -


200 210 220 230 240 250 260 270 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G L MS V E DMA E L I T N T P K L A L S F V K R Y MD R N D D - - G V I S K E E L L F V P E Q - - - - - P E L A R D V L D N L R A E E E E K E L E - - - - - - - - - - - - WS I MS V D E L A S L L Q S H P K L A R A L V K K F V D I NG D - - N L V T A E E L F R P P T R K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P L S K T I S L - - - - P E I L T A Q L ME R L E S D A H - - - - - E MN E Q S R - - - - - - - - - L A F L R Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R NQ E P A D P I I K K G F - - R K MK I S T A R G F G K R E D P D L S F L L E N E D I D P V D L K - - - - F N S F Q D A A E QMMQQQ E E N P N S D - - - - - - - - - - - P D V F P V DW L V N Y L Q N K P D V I R Y MV E H L L D H NG D - - GQ V T S Q E MMT S L QQQ R E D - E T A P WS Y D K R E T G K L I E E L T A D N A D P V QQ I I G E Q E S F P L DWF V N E MS S N P A L A R T I L Q H F V D S N K D - - G L V T T N E L L S S S A S D S N D L F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P D L I P A DWMA E E L S S N P E L A R F I I R R F I D V DQ D - - G L V S P V E L L R N T V CQ E P N - L E N F WDM L E S A S E R E NQ D S N D E N T - - - - - - - - - L E S I P L DWF V N E M L N N P D F A R S V V R K F I D L NQ D - - G A L S S D E L L R N V - - - - - - - L D N F WE M L E A S P E R E GQ D A N D E K T - - - - - - - - - L E S I P L DWF V N E M L N N P D F A R S V V R K F I D L NQ D - - GM L S S E E L L R N V V - - - - - - K R N Y L P I S K S N E L S T Y Q R P V S D A K - - - - - - - - - T N V V T S D D I V N L I R S S P S L I R K I V K A - I D L NG D - - DM I S K A E - L Q S L V Y D - - - - -

100 - - - - - - - - - - - - - - - - VG I - - -

110 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A R DF GK R A P E - - - - - - - - - -

120 130 140 150 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H P I S Y E S H P R K K F N P K N S L MV A Y D F G K R S G N D D N V D E - - L DG E DQ D S Y E P H A R R K F N P K S N L MV A Y D F G K R S G N D D V N D E E E E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

I -

160 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R V T RGV F - - - - - - -

170 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R P NS NV L I - - - - - - - -

- - - - - - - - PT - -

F -

180 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - VPY - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -G - - - - - - - - - - - - - - - LSN - - - - - - - - - - - - - - -MIE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V YG A RGY GK R A A L P K NDR V Y G - - - - - - - - - - - - - - - T AG

Multiple sequence alignment of Platynereis allatotropin pNP with bilaterian allatotropin pNPs. The Platynereis pNP shares an N-terminal GF/Yamide peptide with protostome pNPs, and a C-terminal conserved cryptic peptide with protostome and Saccoglossus pNPs.

Multiple sequence alignment of annelid and mollusk pyrokinin-related sCAP pNPs.

Multiple sequence alignment of bilaterian pyrokinin-related peptides, including annelid/mollusk sCAP, mollusk pleurin, insect pyrokinins and vertebrate neuromedin-U.

Platynereis_Sulfakinin Dermacentor_ACC99604 Gryllus_CAL48349 Psacothea_BAH11170 Homarus_CN952349 Daphnia_Dappu1:242979 Rhodnius_ACS45388 Pediculus_XP_002424661 Calliphora_CSK_CALVO Drosophila_NP_524845 Anopheles_AAW82713

10 20 30 40 50 60 70 80 90 - - - - - - D L T P A E V A K R QQG A WDMD Y GW - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MQ L P A R F L L F L L V A I MA A A S S A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L G Y S A A S P V S S QQQQQQ R - - - - - - - - - - H R I S - - MG C S M L T A A F F V V S V Y L L V H HQ H H A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V S G H A L P L P P S E GG A GGG A GGG A GG A L R G R - - - - - - - - - - - A L V - - - - MK S F F T GMF L L T S L Y L - L L T Y Q F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G F S S A A T GG P T NQ E - - - - - - - - - - - - - - - - - - MR WT S WT A A V L V V MA A - - - - - - F M L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S GG V S A P A R P S S L A - - - - - - - - - - - - - - - - MP I I R Q S S V K T L N L L L Y I - - - V R V V C A V DGQ E E A QQQQQQQ H R MK L T M L A T V L A A V L V L G V G R A T A A P A D S S S T A T G R R L L H S P N P T S H S K S - - - MG S S F L I T L L L A I G V Y MF I E N S H F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MC L A E P A E R R - - - - - - - - - - - - - - - - MF S V I E K P S L R T Y L I I L P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N T F G D D L T N K - - - - - - - - - - - - - - - - MY S QQ R I F N S K Y F I F F I A - - - V L S I F W - - - - - - - - - - - - - - - - - - L P T MS A R N L E N S K N E NG I S G S N S G NG K MN S Q Y N T G S P S A Y Y S - - A K H - - - - MG P R S C T H F A T L F MP L WA L A F C F - - - - - - - - - - - - - - - - - - L V V L P I P A Q T T S L Q - N A K D D R R L Q E L E S K I GG E I DQ P I A N L V - - - - - - - - MA R V T L A F L V S L V A - - - Y L A Y Y A - - - - - - - - - - - - - - - - - - L V S D A Q P I G S L V L T S S G S G H S P A S S P N A D D T G D N V QQ H A W L K D T N S Y


100 110 120 130 140 150 160 170 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V G R W L K S V L P A A A A A A S A G D S D S R N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T A D L D A A - - - DM I D P V - - - L G R R A P P V A P Q L L R A R L A V A D D A T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V QG L L G D - - - - F V V D D - - - V HR P R T R I LGR F A R P V T QY A R L K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P E P Y L ND - - - - F I DDD - - - - - R V L A P V V RQR L E E S H L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P P A L V E E L V QDF E DP E L L - I D S W L R W L L L R S R I G D K E K T K NG V P S N S F Q L A R S P V E L G S S N P K L Q A K L P P A I V Q S N D D D E T T G F G D E - - - D F A D E D V P L V - - - S L I R I RPEPA - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - LF AAED - - - - - - S K L K Y F E K R QQ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I E R L P F I - - - S L V L E R - - - N L R S M L MA P K D Y QQ K L H A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K I P L N L D L MD F L L E Y E - - - - G P S F S L F G D R R NQ K T MS - - - F G R R V P - - - - - - - - - - - - - - - L I S R P - - - - - - - - - - - - - - I I P I E L D - - - L L MD N D - - - R A R T K N R L F D K K H T G S T A Y Q A F R R T A P F P V L A L K E Q A A S S T S E L L S P E S A D L G K A DQ L R F N L A G Y L T DGG P T L L D E E - - - -


190 200 210 220 230 - - - - - - - GGG R F G K R A P L G K R Y DMY G I GG R F G R D V S R A QQ A A A R Q A D L Q - - Q E D D Y G HMR F G R S - - - - - - - D D Y G - HMR F G R K - - - - - - - - - - - - - - - - Q S D D Y G HMR F G K R - - - - E P F D D Y G - HMR F G R S A E - - - - - - - - - - - - - - T S D D Y G H L R F G K R G E - - E S F D D Y G - HMR F G R S G T E E - - - - - - - - - - - - E F D E Y G HMR F G K R GG - - G E Y D D Y G - H L R F G R S L T H S DQ H H H H D T T V N - - Q P D D Y G HMR Y G K R - - - - - D F D D Y G - HMR F G R R - - - - - - - - - - - - - - - - Q F N E Y G HMR F G K R GG S D E K F D D Y G - Y MR F G R S R P L A N S L P N - - - - - Q DQ F D D Y G HMR F G K R G - - - E D L D D Y G - HMR F G K R Y - - - - - - - - - - - - - S K R F D D Y G HMR F G K R GG E - E Q F D D Y G - HMR F G R S I - - - - - - - - - - - - - A K R F D D Y G HMR F G K R GG D - DQ F D D Y G - HMR F G R - - - - - - - - - - - - - - - V K R F D D Y G HMR F G K R GG E G DQ F D D Y G - HMR F G R - - - - - - - - - - - - - - - -

180 - - - - - - - - - - - - L L ASGF AKR - - E E L G E MS K R - - D L I E F S K RQ - - DF HDA AGK R L P E GRQA A S K R - - DP L D I V DK R - - K Q D NMA D K R - - DE D - - - - - R - - DE R T - - - - K - - D E D D E I GG L

Multiple sequence alignment of Platynereis sulfakinin pNP with arthropod sulfakinin pNPs.

10 20 30 40 50 Platynereis_CCAP - - - - - - - MNQ S T C - - - L S V V L T F I T L S V C L Y Q S S A S R D S L T S Q T F HQ - - - - - - - - Crassostrea_FQ665313 - - MV S F QQ S F A T C V G I L T I L S F Y Q C S Q Y S Y A D E L L Q K N E N S K L G V K K L A A L L A N E L Conus_CBM40422.1 - - MV S L G H V L F V I - - - L L P V L L P V A A D D P D DQM L S Q I S L P S S S R S E Y D D N D V - - - Daphnia_Dappu1:300598 MT R P L F Y S L L M L A - - - WM I I S L Y I S A S S S Q P L K N NQ N D S D S A E E I E QWS F K - - - - NasoniaNV_04678 - - MP DG S I K E Q V - - - - L K L V L S L L I I I E S V E I A - - - R A D DG L E I V A - - - - - - - - - Drosophila_CCAP_DROME - - - - - - MR I S - - - - - - L R L L A L L A C A I C S Q A S L E R E N N E G T NMA N H K L S G V I QWK Y Tribolium_ADM26614CCAP - - MK NMT T A K L - - - - - F V I C I F A A L A I E T H S R F L P K S I S K N L G A T E R V L E P - - - - Rhodnius_NP_001124369 - - - - MT S R V L - - - - - - L V L V V A L L C A E C C V T A T I P - R N F D P R S N E E MV T MP - - - - Rhodnius_ADK73625 - - - - - - MQ L L V P C - - - F L L F T A L V S A V L T D D V F L Q K R L Y F P G E I A E P I D P K - - - - Periplaneta_CCAP_PERAM - - - MQMY H V V L G C S L A I L L V I L D I P Q A S C D D V V I Q K R Q V D P A E MD R L L D P K - - - - Ixodes_XP_002402276 - MK P D L S T V I S S S - - - L Y I L L L S A C L S A A L E - - - - - K Q D D T A D D S Y L V E - - - - - - Platynereis_CCAP Crassostrea_FQ665313 Conus_CBM40422.1 Daphnia_Dappu1:300598 NasoniaNV_04678 Drosophila_CCAP_DROME Tribolium_ADM26614CCAP Rhodnius_NP_001124369 Rhodnius_ADK73625 Periplaneta_CCAP_PERAM Ixodes_XP_002402276

60 - - - - - - L S E DK D I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

70 80 90 - - - QK R I F CN - F F GC - - GS K R S S - - - - - T Q K D K R V F C NG F F G C S NG K K R S N - - - - - - - - S K R V F C NG F T G CG - G R H R D R S R R Q E R - - - E K R P F CNA F AGC - - GR K R S M - - - - - - - - MK R P F C N A F T G C - - G R K R D - - - - - - - - - E K R P F CNA F T GC - - GR K R T Y - - - - - - - - K K R P F CNA F T GC - - GR K R S N - - - - - - - - K K R P F CNA F T GC - - GR K R SQ - - - - - - - - MK K P F C N A F T G C - - G K K R S D - - - - - - - - R K R P F CNA F T GC - - GK K R S D - - - - - - - - Q K R P F C N A F T G C - - GG K R S S - - - - - -

100 110 120 130 140 150 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S L P V GGQ E T H D P R L T E L L Q E A K R S G A L Y Q D D L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S MN L N P L D Y P V D A P E P E T K T D F R K R L F C N T GG C F G R R K R S T Y G K R L I P V L A K R P F C N S F G C Y NG K R S L S G A G P A L S T P V D P S R N N K A R T MA R M L D A A A S A R H E QQ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I K DT K HP P Y E K A A S NHP R L P NA DT K L L DK L F A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P S Y A S G L Q L P I P L Y R A L L R L S S L R NG A A - - P S Y P P F S L F K R N E V E E K P Y N N E Y L S E G L S D L I D I N A E P A V E N V Q K Q I MS Q A K I F E A I K E A S K - - - - - - - L P A L P - - - - - - - - E Q S E V V D E N L G S L L E L S A E P A V E D L S R Q I MS E A K L WE A I Q E A NM T A P GMP NQ D L MR - - - - - - - - Q R Q Y V D E D T L G T M L D - - S E S A I D E L S R Q I L S E A K L WE A I Q E A S A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E S MA T L V D L N S E P A V E E L S R Q I L S E A K L WE A I Q E A R M - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E S MG T L V E MN S E P A V D D L S R Q I L S E V K L WE A I Q E A R V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P NR I D L L A R LQNR L L S E I R N L E L R T R L E E -

160 170 180 - - P L V A R SGS S S NS I Y DD I - F DDDT K K - S QT L E R R L NN - - - - - - - - - RGS K DV - QQ L L QQ R E Q R G L E S R D P A A S G D L S K R - - K I Q HQ R A N F - - - - - - - - - V Q L D D P E - - A E V R MR Q R P - - - - - - - - - L G L I G P E - - E I F RQK NKQ - - - - - - - - - KM L QNE K - - E L HR R RQE S - - - - - - - - - A E S S E E D - - E I A R R KQK E - - - - - - - - - F Y NS Q - - - E L L N R K QQQ - - - - - - - - - S D R I P L Q - - E L L R R R Q E Q L QQQ S NQ F G A GMD R P L - - GP S R R HDE Y - - - - - - - - - T DNV S R L

190 200 210 220 Platynereis_CCAP MA A R S S L S D F S S E S V D P E A L L K K A S L L S L L R S Q I R R H S Q L K G S K Crassostrea_FQ665313 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Conus_CBM40422.1 L L C NG Y GG C R GG K R T L Y S P W L E R MN E V A D D R S A R N A L C T R L GWR E Daphnia_Dappu1:300598 Y Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - NasoniaNV_04678 N L V Q - - L G P Q A P R L MA A P V V V P S L Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Drosophila_CCAP_DROME E MQQ - - L E E R E S K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Tribolium_ADM26614CCAP A A V P - - A R S A T A S C A L P P C Y I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Rhodnius_NP_001124369 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Rhodnius_ADK73625 P L P L - - T T I R K R S HY L Y T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Periplaneta_CCAP_PERAM P L P I - - A G Y R R K R F A D P E S Q A P A P H S N L P R A T S Q L Q E E I T K P WS R Ixodes_XP_002402276 NK R E E S I S DA S S T R DR CP - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Multiple sequence alignment of Platynereis CCAP pNP with protostome CCAP pNPs.

Multiple sequence alignment of trimmed Platynereis allatostatin-A-2 pNPs with mollusk allatostatin-A-2 pNPs.

Multiple sequence alignment of trimmed annelid and mollusk allatostatin-A-2 pNPs.

Multiple sequence alignment of trimmed annelid and mollusk allatostatin-A-3 pNPs.

Multiple sequence alignment of trimmed annelid allatostatin-C pNPs. Besides the Cys-containing allatostatin-C peptide, these pNPs share other conserved peptide stretches (e.g., QLEI peptides).

Multiple sequence alignment of lophotrochozoan FFamide and arthropod SIFamide pNPs shows besides a conserved amidated peptide conserved cystein-residues in the C-terminus of the pNPs.

Platynereis_L11 Aplysia_NP_001191479 Daphnia_EFX89671 Tetranychus_GW018633 Peripatopsis_FN235505 Alvinella_FP533670 Lottia_FC759395 Caenorhabditis_T34077 Necator_BU087674

10 20 30 40 50 60 70 80 90 MC K - - - - - - V C L A F L V I L I L F S E S S E - - - A R R R P D C T R F V F H P S C R G V A A K R S E S E E F V L D P R S S I NQ E GG A D H Y I S NG A D E D F I E F S E D D F A E H R L - - - - - - L L V T A L C L L I T S L F A QQ K - - R R P R I D C T R F V F A P A C R G V S A K R A L D P R A V T L D E N V A P S F S D L D D E I L - - - - R S F L A Y N R H K QQ E F N S MS S S S T I L L L F A G I V I F A A V H V - - - - H S R D L D C R R F V F A P MC R G A T I K R S - - - - - - - - - - - F I P N I G V NQ D D V H - - - - E L L L D Y P K QQ V MD MV S S V NQ L T V L V T L L S I V L F N L I V V S - - - T A Y P V D C S K F V F A P T C R G V I A K R I - - - - - - - - - - - - N S NG F K T N S K S T - - - - Q N D L T D R S D P WP E M I T - - - - - - Q I I I L I S A I T V L I NA T DT E T T I R P L DCR K T V F HP DCRG I S A K S N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E F K R N L F S R F C L - - - - - - A L I WT A S L MT Y H K T - - - - - - S A WR V D C S K F V F A P K C R G V S A K R A - - - - - - - L D S D H E E S A D K NQ S Y GQ - - - - R L S P K S L A D S L S R MA E - - - - - - K V F S I F G L L L I V L V L I T - - - D S R K L D C T K F V F A P K C R G V A A K R N T D Y N F - - - - - P I I P S HQ R L Q S K I V - - - - - - - - P S L E D NWT S F T P - - - - - - L L M I L L A L V P - - - - - - - - - - L Y Y S L D C R K F S F A P A C R G I M L K R S GG H P M I A E QQ P M I D N A K A R E V QMM - - - - E L L I R N I E D E A L I MR I - - - - - - I L F V F L S L I A - - - - - - - - - - I A L S L D C R K F S F A P A C R G I M L K R S - - - - - - - - - - E T T E R QQ S L E L Y Q L - - - - A Q N L E M L S L L I R E

Platynereis_L11 Aplysia_NP_001191479 Daphnia_EFX89671 Tetranychus_GW018633 Peripatopsis_FN235505 Alvinella_FP533670 Lottia_FC759395 Caenorhabditis_T34077 Necator_BU087674

100 110 120 130 140 150 160 N K R Q A DQ A S S Y D L G L A A K L WP H I K K A L L G R T N R G S Q D V E A F A P Q K R N N E A K L E K WS K V L R H L L DQQ E - Q A A P R P D A P S S L L R L V A Q R G L R H R T P H S L H R P V P WS V E Q S F L K T G S DG A L S WP N S I K S L Q E D - - - - - - A E T Q P L L - - - - I P I L I D R R I F E A R S A A N R HQ P Q L D A E D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MN P S S S S Y K N I I S K L F P S MV K E MH P S N T N S G - - - - - - WD R F D - - - - - - - - - - - - - - S L Y QG N DG L L F G S D E L K A L S S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - DGG F V E D F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S Q S K Q R E L L S I I HW L A E Q E T N R D D V K H L A T E P P P G D F L QQ Y QQG P P Q K R R Q H S E D Y V F Y E S I V - - - - - E D D D S L Q F L K G L R Y L I S K MN N K Q P S P P Y S T D - - D S R F WR K F F P S R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A N S D C V S - - - - MS W L R D R L V N - - - - - - - - A K NG S Y N I W - - F L P S V R Y E L K Q - - E WF K I F R R N L R K S F I W A E A EG I K E C I P I SW I R NK L A T - - - - - - - - - - - - - - - - - - L Y L P S R S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Multiple sequence alignment of Platynereis L11 pNP with protostome L11 pNPs.

Platynereis_GGNa/EP Capitella_EY625406 Bombyx_NP_001123587 Daphnia_Dappu1:304056 Alvinella_GO200823 Perinereis_BAB83127 Lottia_FC746004

10 20 30 40 50 60 70 80 90 MD R T G L WY L L L V S V L Y I WT G - Q K V S G - K C S GQWA - I H A C A GG NG K R S - E G A L S S I G D R E R D S R MS L - - - - - - - - Q R I L R G F G E Y S N E V E DQ N - - - - - - - - - V L V G I A V L F S L Q S V V QG T K C R G S WA - I H A C A GG NG K R S - E G S A G A R A P P A L V E QQ E P G D R L K R L F Q R Y I E S F A E E P Q N DQ T E E MA Q I C L A V S I A V L L MMS - QG V S A K R G - - C S A F - - - G H S C F GG HG K R S G E P A P MDMA NQ DMMV R HQ L G - - - - - - - Q E E T P P H P G Y P H S S Y N V L - - - MH I F F Y V I H V T A M L - - - - A I V S G - N C N K Y - - - G N A C F G A HG R S D - - - - - - - - - - - - - F K R T S A V D L S - - - - DQ I WP V A A NWN P T R P D E MD R V T M L L I T V L V M L C L W L G N N A V E G - K C R G L WK N H H A C L GG NG K R S - D P S E T L - - - - - - I D D E R - - - - - - - - - A Q I L D T F L N R N A A MP E D E MD R T G I WY L L L V S I L Y I WT G - Q K V S G - K C T G P WA - I H A CGGG NG K R S - D V E A GG L G D R E K E S R I S L - - - - - - - - Q R I L R G F G E Y S N E D E D S T ME V R C T T L F A V T S L L Y L T I S V S L V S G - K C S G R WA - I H A C F GG NG K R S - D P S L T D N T E N S R Q E T L L - - - - - - - - - R Q I L L P Q T Y E Y H K S N D A L

Platynereis_GGNa/EP Capitella_EY625406 Bombyx_NP_001123587 Daphnia_Dappu1:304056 Alvinella_GO200823 Perinereis_BAB83127 Lottia_FC746004

100 110 120 R F A S E P E L S NY E DV L SQPQP D L T Y LQP D L T T Y GQ - - - - - - - Q A L L G P E NM L L S L D DG S K Q P G D - - - - - - - D I I P I R DGG V Y D H D A A A R - P I Q - - - - - - - E R R QMK P L P A L Q - - - - - - Q - - - - - - - - - - - - - NDF P NY D L AM I R S R - H F G D - P D L S N Y V E D V L S QQ P D L A Y I - - - - LQDD - - - - - - - - - - - D I NT Y E K S HE E SQR -

Y -

130 140 150 L QK E NR KQK S V L R K L F T I L K L RQNRQN L QN - - - E Y D Y D R L R S L WR T A L L A K R MQ R R G R K - - - - - - D V MK Y K L R N I F K HWMD N Y R R S Q N T N D E Y F L E T - L E S V L V Y N D I P R S A E H S R Y L NQ E D Y N N - - - - - V H P G L K Y Y E L L R K L M - - L A L Q E DG R V D - - - - - Q K E N R K QQ S L L R K L V A M L K L R Q N L Q N L Q N - - - MR D L R A L N I L L K T L MME Q K V R T E N S V MA - - - -

I -

Multiple sequence alignment of Platynereis GGNa/excitatory peptide pNP with protostome GGNa/ excitatory-peptide/CCHa pNPs.

Platynereis_PDF - - - - - Capitella_ELU12143.1 ML R CE V Aplysia_NP_001191498.1 - - - - - Armadillidium_BAI67599 - - - - - Eurydice_PDH_EURPU - - - - - Marsupenaeus_BAB91011 - - - - - Callinectes_PDH2_CALSI - - - - - Cancer_ABV68727 - - - - - Orconectes_PDHA_ORCLI - - - - - Callinectes_PDH1_CALSI - - - - - Litopenaeus_CAA72409 - - - - - -

10 20 30 40 50 60 70 80 90 - - - - - - - - - - - - - - - - MG S S K T V Q V A V V V C L V S MF V MQ V V C Y P T Q R S N L R N S L T D A D R Q E I L R Y A A K I A R I A MG D N V D F K A G P N K R L HQ V Q A D R K R D D V G A R MR N S I M L N L T V V V C I I S L T V F Q V C A R P Y D - - - - - T Q L S E K D R Q E I MH Y A A S I L K I A F GQ - - G Y L P T Q E K R - - - - - - - - - - - - - MF G Y R S L L V L L V T L S L C L L L Q S S H C S A V R T Y G - - - - - N D L D A R A R R E I I S L A A R L I K L S M - - Y G P E D D S F V K R - - - - - - - - - - - - M I G K Y L S WF M L A F L F G F V L E S Y R V Q S - - - - - - - - - - - - Q D L N P T E K E V L S NM L D F L Q R H S R T T Y MF P L L S E S K R - - - - - - - - - - - - - - - - MR - F I I L G V L F I A V A S M I L S NG V MA Q S - - - - - - - R D F S I S E R E I V A S L A K Q L L R V A R MG Y V P E G D L P R K R - - - - - - - - - - - - - - - MC R A A V L L F L M L A V A A V MV T E A Q - - - - - - - - - - - - R E P T A S K CQ A A T E L A I Q I L Q A V K G A H T G V A A G P H K R - - - - - - - - - - - - - - - - MR S G V F V A V L V V V V F - A L L T QG - - - - - - - - - - - - Q E L H V P E R E A V A N L A A R I L K I V H A P H D A A A G V P H K R - - - - - - - - - - - - - - - - MR T GMV MT V V V V V V L A A V L T QG - - - - - - - - - - - - Q E V N V S E R E A V A T L A A H I Q K V V C T P L E G A GG L P H K R - - - - - - - - - - - - - - - - MR S A MV - - V L V L V A MV A V F T R A - - - - - - - - - - - - Q E L K Y P E R E V V A E L A A Q I Y GWP - G S L G T MA GG P H K R - - - - - - - - - - - - - - - - MR S S V I V A V L V V V A L A A L L T QG - - - - - - - - - - - - Q E L K Y Q E R E MV A E L A QQ I Y R V A Q A P W - A A A V G P H K R - - - - - - - - - - - - - - - MMR S A V V V A L L V MV A MS L Q L T A A Q - - - - - - - - - - - E D L K Y F E R E V V A E L A A Q I L R V A QG P S - A F V A G P H K R

100 110 Platynereis_PDF N P G T L D A V L DMP D L MS - L G R K Capitella_ELU12143.1 N S GM L D A V I NMP D L F K - A G R K Aplysia_NP_001191498.1 NGG T A D A L Y N L P D L E K - I G K R Armadillidium_BAI67599 N S E L I N S L L G A P R V L N N A G R Eurydice_PDH_EURPU N A E L I N S L L G V P R V MS D A G R R Marsupenaeus_BAB91011 N S E L I N S L L G L P K F M I D A G R R Callinectes_PDH2_CALSI N S E L I N S L L G I S A L MN E A G R R Cancer_ABV68727 N S E L I N S L L G L S R L MN E A G R R Orconectes_PDHA_ORCLI N S E L I N S I L G L P K V MN E A G R R Callinectes_PDH1_CALSI N S E L I N S I L G L P K V MN D A G R R Litopenaeus_CAA72409 N S E L I N S L L G I P K V MN D A G R R

Multiple sequence alignment of Platynereis pdf pNP with protostome pdf/cerebrin pNPs.

10 Platynereis_leucokinin MS S A K S T L Y S S NG F Capitella_jgi|Capca1|220760 MS T P T - - - - - - - - Danaus_EHJ73323 MA F - - - - - - - - - - Bombyx_NP_001124363 MS H - - - - - - - - - - Trichinella_XP_003377687 MS S V K S C - - - - - - -

20 30 L HF L L L L CT H L L HS I DA T DY P S - - F A V L L V A T F V A MV T A A V L P S - - Y W I F I A F S WF G F A S L Q Y I N T - - HW I L I T F S W L G T A S L Q Y I N T - - I C I F T AF CL LASF T - - - - - -

100 110 120 Platynereis_leucokinin WS G K R S E L E D D K R A F S P WS G K R S E L E N D K R A F Capitella_jgi|Capca1|220760 WGG - - - - - - - - K R G F H A WGG K R S - - - - - - - - Danaus_EHJ73323 F T E Q D L E S L D S K R MR R T T D E D K D A K E R NWQ P Bombyx_NP_001124363 DGG V - - - - - - - Q R R R R T A D D K E Q V R D K R W L P Trichinella_XP_003377687 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Platynereis_leucokinin Capitella_jgi|Capca1|220760 Danaus_EHJ73323 Bombyx_NP_001124363 Trichinella_XP_003377687

190 L E DDK R A F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Platynereis_leucokinin RKF Capitella_jgi|Capca1|220760 - - Danaus_EHJ73323 TR I Bombyx_NP_001124363 EK I Trichinella_XP_003377687 - - -

L -

40 50 60 70 80 90 L R T GGG S A R L T D S L T H A Q Y R R G A F N P WK G K R S F S P WA G K R D L S E V D A D D K R A F S P - - T E G D I E D L MD A Q D D I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D K R A F S A - - A G A D A E T L MD P L D S T I H - - - - Y P P L P Y V N Y F N V L T P R N NME T L Q N NG NMD H S Q - - GG P G A D T I L D P L D S S L Q - - - - - Y S L P Y A N Y F N V - - P D A QMD P D T S DGQ Y G I V H - - - - - - S A T L V DS P S S A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

130 140 150 160 170 S P WS G K R S E L E N D K R A F S P WS G K R S E L D N D K R A F S P WS G K R S E L D N D K R A F - - - - - - - E D N E MD K R A F S A WGG - - - - - - - - K R A F N P WGG K R S F E DQ E - - - - - - - - - - N L I DS DK T I Y L P S DT F G I - - - R T P F I VQA Y S DT S S E K NT T - - - - - - - - - - N L A D I D K T MY I K N N E - - - - - - V A T P S L V G F S G N S D E N D T - - - - - - - - - - - K E V QM I P V F Y S D T V G - - - - - - - D H H V I D P T V D N L E D V - - - - - - -

180 S P WS G K R S E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

200 210 220 230 240 250 260 270 S P WS G K R S E L E D D K R A F S P WS G K R S E L E N D K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A F S P WS G K R S E L D A D K R A F S P WS G K R S D L D A E K - - - - A E R G N F E E Q K R Q F G P WGG K R A S P E I Y K K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A F N P WGG K R S S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D I S N S L - - E K R S F S P WGG K R N R P N T I E QMWT WK K S A G I R E P S MP K R V R F S P WGG K R S GQM I Y K P G T K G S K V I F S A S V P E L - - - - A L L DQ V - - D K K N F S P WGG K R D K P S - F E HMWT WK R S S S V R E P S MP K R V R F S P WGG K R S GQMV Y K P G S K S S K L I F S A T V P E L - - - - S E L N N L - - MK R K F Y A WA G K R A S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R F Y QWA G K R NG - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

280 290 300 T P WA G K R S D N N D E V V D K R K F T P WA G K R S D D - - - - - - - T S S L E D F L S K R S F N P WGG K R S S D V S N Y S P NG N R L N - - MA G L Q F I P S P D K R H P I V S NY L P S GE R L N - - L AG L HY I P S V DK R F P L - - - - - - - - E K V E - - K V R R K F Y P WA A K C N K K

Truncated multiple sequence alignment of Platynereis leucokinin pNP with protostome leucokinin pNPs.

Platynereis pNPs belonging to protostome pNPs families:

Platynereis_prohormone-3 Capitella_EY611212 Alvinella_GO221762 Helobdella_EY363235 Bombyx_NP_001124360 Culex_XP_001846959 Nasonia_XP_001604833 Harpegnathos_EFN77169

20 30 40 50 60 70 80 90 10 MK S S T F L A V F A T L L A T A L G - - - W - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S K Y Y E D S F D E L P A R R S Y - C V N S GG K C F T S S E C C K G Y - MT T S H L V Y L A V I A T V V G V A Y A WP - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N L Y E L E R WN R V S R R S DMR C I E S GG K C Y S T H E C CGG F MG A K GG L F T F V T V L V L A T T V MS WP - - Y D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D E Y S A WR L A R T S R R S H H - C T G S GG K C F S T A E C CQG F F Y S Y S P S T R P T S R P A Y Q E G S T V R MA L HG R T L V F M L V G L N C I A T S L QQ S Y V G - - - - - NG Y F QG Y E L K DMN V K K K E C L T V T S E C Y T T E Q C C S D L - - - - - MT A T A I L V L G C L S G A H A WGG L F N R F S S DM L A N L G Y G R S P Y R H Y P Y GQ V E P D E A Y E A L E N N R I S N V I D E P A H C Y S S P C V T NG D C CGG L MK A T A L WA A I G A V L V F S G T A N A WGG L F N R F S P E M L A NMG Y G S HGG A Y R P Q A F L - - - Q N E I L D E DQQ NQ R V E E D - - V C Y G K P C Y S N E N C C P G L - MK T T C A M L L A V L A L MN CG A D A WGG L F N R F S P E M L S NMG Y G S HGG Y L G R S S A F - - L Q HG S S F S D NG L D DG A D E - - P C Y E R R C N T N E D C C P G S MN A C A V I T L V L V A N T A Y I G V E A WGG L F N R F S P E M L S N L G Y GG HG S Y MN R P G L L Q S L S DG Y NGMY G E G A E P T E E - - P C Y E R K C A Y N E H C C P G T


100 110 120 130 140 150 160 V CA A F DD L F - AGY - - - - - - - - - - - - - - - C I - - - - L E K S L K P CA K DV DCA E DA R CV S L GR K DE R Y C I QR A DS V C A V F N D Y - - F A D K E E S - D D E N P E V P G T C V - - - - K E K D L T E C S S S L D C P MS Y K C L T L S R S G D R Y C I K R Q R S V C A A F D D Y - - F GQ R GQ P V E GMN P E I P G F C V - - - - K E K D L Q P C F S T R D C A P N A K C V S L G R DG E S Y C V R R P K T S A C V D T N N DG I S G K - - - - - - - - - - - - - - - C L - - - - A K K R L R R C T E S I Q CG E MT T C S S V I G S N S K Y C - - V P D K L C L E T D DG - - - G R - - - - - - - - - - - - - - - C L S A F A G R K L G E I C N R E NQ C D A G L I C E E A A P G E MH I C - - R P P S V C V N V DG V - - I G H - - - - - - - - - - - - - - - C V F P L - G R K Y G E L C R R D S D C E S G L V C D I S T L S G A S V C - - R P P M V CMN P E G E WP E G R - - - - - - - - - - - - - - - CMF I Y - G L K QG E L C R R D N D C E T G L MC A E V A G S D S L S C - - Q P P V I CMN P DG V - - I G T - - - - - - - - - - - - - - - C V D D L - GMK QG E L C R R D N D C E T G L MCQQ I P G R D A R S C - - Q P P L -


190 200 R T AG - - - - - - - - - - - - - DF S S - - - - - - - - - - - - - MA S S - - - - - - - - - - - - - NSQS V Y S R NY DT QA YGT L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

L -

I -

- - - - EDL - - - - - - - - - - -

170 180 - - - - - - - - - - P NDV I Y - - - MP V Y P K S G S N R K Y I E D L P V I N V P S A NQ L S L E T S Y D F A R D F K D K MY - - - - - - - - - - T GR KQY - - - - - - - - - - V L A KQY - - - - - - - - - - T S NKQY - - - - - - - - - - T S NK L Y

210 220 230 240 250 260 - - - - P K A K L GQ E C T T N A D C E K Y G K D - G N E L C CQ K I R R F R Q K A K T I C D R V N HMS A C I P N N A D DW L - - - - A K GG L G S D C E D D D D C K Q Y V S DG S S K L C CQ A V N R G R QG T R K MC D R I R P I S H C I G K K - - - - - - - - G K GG L G T K C E D N S D C R P F E K P GG A Q L C CQ R V S R G R QG V T R MC D R V T A I S K C I A G - - - - - L R K P G S K G T GMP C I S T D D CQMT D S Y S G D P L C CQ K I S QG K MG S K L K C H T I I N V D D C K P WS N - - - - - - - - - - - - N E D C T T S S E C - - - - - E I T R G L C C I MQ R R H R Q K S R K S CG Y F K E P L V C I G P V A I DQ I - - - - - - - - - A E D CMT S S D C - - - - - D I S R G L C CQ V Q R R H R Q V A R K V C S Y F K D P L L C I G T V A A DQ V - - - - - - - - - S E T C S MS S E C - - - - - D I S R G L C CQ L Q R R H R Q T P R K MC S Y F K D P L V C I G P V A A DQ V - - - - - - - - - N E E C NMS N E C - - - - - D I S R G L C CQ L Q R R H R Q T P R K V C S Y F K D P L V C I G P V A T DQ I

Multiple sequence alignment of Platynereis prohormone-3 pNP with protostome prohormone-3 pNPs.

Platynereis_myomodulin Capitella_|Capca1|226517 Helobdella_gnl|Helro1|167674 Tritonia_ABU82757myomodulin-like Aplysia_NP_001191423 Haliotis_AFN20272 Lymnaea_MYOM_LYMST Schmidtea_DAA33906TPA_inf:

10 20 30 40 50 60 70 80 90 MT N C F A L C L L V S C L C A L S S A E N D R E K R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A I R M L R MG K R G F GM L R L G R S A P - - - - - - - Y DQ Y E S R Q L F D - - MK V A L L F S L Q C I Y V I A S A D D S A R A R R D L S M L R MG K R S E F S S L P P L V P P S Y D L S A D D F D E R Q V WMK I P R V G K D I D E D T P H L R L A R Y - - - - - P P - ME K MA MF F L MA T L S V MS G I V H C S D H S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K S V S P E L G E QG H D A N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - MQ V C V L T L I G V I F A F H A S C E A T K E T - - - - - - - - - - - - - - - L S P A L S N H E L L H K A A P S R V K R G N Y DM L R L T R G L N - - - - M L R L G K R A G S - - T D - - - MQ V Y M L L P L A V F A S L T Y QG A C E E T - - - - - - - - A A A Q T S S D A S T S S A S S E H A E N E L S R A K R G S Y R MMR L G R G L H - - - - M L R L G K R GG P V E P E - MN A A L F A K A V T V L L L V I C K QG S S E E Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T Q S E S Q D E P A S R E K R G L NM L R L G R G L Q - - - - M L R L G K R GG L NM L R - - MQG A F L I T F I V L T MT L V S I G N T E E S - - - - - - - - GGQ T S S N D K T - - - - - - - - - E P A Q S R T K R R S R E MG R V V R G L Q - - - - M L R L G K R D S V S T S E - MS K L T Y F I F M I M L F I F V Q T I D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -


100 110 120 130 140 150 160 170 180 V P R MG K D L V D I ME P S K R H P P I P R V G N L D K V I D E Y R R MV A D E A T S F D E L P R F G R F V R S A E E V A N E V E G S H K E K R E V S GG V L P R - - - - - - - - - - - V P R L G S A L D S L I E E Y R - - - - - R D I G - - - - - S N D D E D E I R - - Q V L F - K I P R V G R N R R S A D DQ E N V E MK E Q V K R A A P L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D P E F N S DQ I L T L E D E Y - - - - - P E S Y L Y Q P S P D D Y Q K A L A A L NG E Y - Y T S R G L R Y R R S T P S D DQMV T A V P T L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S E E N L E T L L N L L QG Y Y - - - - - S D V P E Y P S E F D D T D L A Y P - - Y E E Y - D A P A H P R Y R R S T P P T DG V V A P D V L Q K G S S E F E D F G D S Q L D E S D E G Y Y G L G R S S P S S D E L S D Y L Y D L L Q N E Y L V N P E V L NG E D DMM - - - - - - - - - - Y P D S G R Y R R S A D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D P G D I D D I L S L L Q A Y Q - - - - - E Q N P E F A - - F N E E E R E L S - - G D E L - E V P E H H R F R R S T E N S G - - V A P Q E V QQ S Q S F K D S G E H E L K L E E A E P Y L Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -


190 200 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Y DP E NY L YGDF E DY - - - - - - - - - - - - - F P DG D F Y Y G D V D E L - - - - - - - - - - - - - -


290 300 L R D L - - - - - - D K K A V S M L R MG R S E E T A A P L P R L G Y Y E K R N V GM L R MG - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R D R L NM L R L G - - - - - - - - - - - - - - I KRT L SML R LG - - - - - - - - - - - - - - E K R A L GM L R L G - - - - - - - - - - - - - - DK R S L SML R LG - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -


380 390 400 410 420 430 440 450 Q Y K R K MS M L R MG K R GMS M L R MG K R D D E QQ E - - - - - - - - - - - - - - - - F T E E G K R K MNM L R MG K R A MS M L R MG K R D L D - - QQ K R A MS M L R MG K R GMN L L R MG R S E Q P A E E E E K R A MS M L R MG R S E P A V E A E K R P MS M L R MG K R P MS M L R MG K R E MD D E V - - - - - - - - - R S S S A N N NQ L D E Q Y D E E A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N S P S R K F F Y D S P N Y F V D D A E K E N Y K - - - - K R Q L NM L R L G K R Q L NM L R L G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R Q L NM L R L G K R Q L NM L R L G K R - - - - - - - K R P MS M L R L G K R P MS M L R L G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R P MS M L R L G K R P MS M L R L G K R P MS - - - - K R P MNM L R L G K R P MNM L R L G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R P MNM L R L G K R P MNM L R L G K R E D E - - - - K R P MS M L R L G K R P MS M L R L G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R P MS M L R L G K R P MS M L R L G K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K A V R L MR L G K R S - - - - - - - - - DMA - - -


MG K R E F N D MG K R D T D D MG - - - - - LGK R S V DD LGK R DDDE LGK R S DE K LGK R E DDE - - - - - - - -

210 220 230 240 250 260 270 280 - - LG L R DV E NE I R A A P L P R LGY R A I P R P R VGY R D L E T L P R LG L R E L E YQR A A P L P R LG L R E NF A DE DDK E E R A V P L P R LG - - P R L GM L E E R A A P L P R L G L Y E R A A F L P R L G Y R D L D E - - - - - - - - - - E E R A A P L P R L G V R E E D Y E N E V G D N S Y L K E E D E R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L L R I L E E P QQ E - - - - - - - - D S N K R A I GM L R MG R S L P Y Y T D D D A GM - - - - - - - - - - E E G D V I E D D NMK L P S D L E D E F P S Y Y P K L A Y A V V D D - - - G E G D E I R S K R QWHM L K V G E S G - - - D E E N NG L K MA E E K - - L E P E E GG L G E E K R S L S M L R L G K R G L S M L R L G K R E G E E - - - - - G D E M - D K K - - - - - - - - - - - - - - Q D E S L N D D F E N D D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GV R A V A L P R I GK E L E DE - - - E YGDE Y - E K R A L SML R LGR SGEGV E DE A EG L E P E E E E - - L E G D N E DG S A D K R Q I P M L R L G K R S MS M L R L G K R E E D D - - - A D F D E - - E K R S L S M L R L G K R - - - - E D D N F E D S F D E E N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I N S NQ Y E E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D Y D P N D D H E L D - - - - - - - 310 320 330 340 350 360 370 D T E H E MD K R A MS M L R MG K R GMS M L R MG K R E E E I E P E V D E K R A MGM L R MG - R A MS M L R MG K - - - K D A I E - - - - - - - K R P MS M L R MG K R P MS M L R MG - - - - - - - - - - - - K R P MS M L R MG K R P MS M L R MG R S MD E A Q P E - - - - - - - K R A V S Y L R MG R S G L N D - - - - - - - - - - - - - - - - K K A V NM L R MG K R V V S L L R MG - - - - - - - - - - - - - - - K R Q S E E - - - E K K N I NM L R L G - - - - - - - - - - - - K R H L NM L R L G K R Q L NM L R L G - - - - - - - - - - - - - - - K R P MS M L R L G K R P MS M L R L G - - - - - - - - - - - - K R P MS M L R L G K R P MS M L R L G - - - - - - - - - - - - - - - K R P MNM L R L G K R P MNM L R L G - - - - - - - - - - - - K R P MNM L R L G K R P V NM L R L G - - - - - - - - - - - - - - - K R P MS M L R L G K R P MS M L R L G - - - - - - - - - - - - K R P MS M L R L G K R P MS M L R L G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R A Y R L MR MG K R A V R L MR MG - - - - - - - - I -

460 - E Y R E Q K R A MGM L R P V V E A E K R P MNM L R - L A HDNK R A V SML R - - - G D N K R K L NM L R - M L R L G K R P MS M L R - T E G E E K R A L GM L R - - - - - - - R P MS M L R - - - - - - - - - - - - - -

Multiple sequence alignment of truncated Platynereis myomodulin pNP with lophotrochozoan myomodulin pNPs.

Platynereis_whitnin-1 Platynereis_whitnin-2 Alvinella_GO113425 Lanice_FR763492 Capitella_EY639995 Lumbricus_CF416326 Hirudo_FP646475 Hirudo_AAB40925 Sepia_FO198353 Idiosepius_DB918657 Lottia_FC624310 Tritonia_EV289015 Lymnaea_AF129397 Aplysia_NP_001191586

10 20 30 40 50 60 70 80 90 ME S K I I MMS L A V V L A A L C L - - - - - - - G A S - A MS L P S D E V - - - - - - K H NQ V S E S G L D E K E R A T W L D T R D L G D L E DQ F K E L V Y L A V K E L Q N E G R ME S K T I V MS L A V T L A A L C L - - - - - - - G A S - A MS L P S D D V - - - - - - K H NQ V S E S A L DQ K E R A T W L D T R D L E DQ - - - F K E L V Y L A I K E L E N E G R MDMC R L S A I L V I L Y G T L C A - - - - - - - V T N - A MS I P A S Q L - K D S G V E L D S S E N T A L D E G R R A S W L E T R D L E N D - - - F K D L V F L T L Q E L A Q E G R MD V S R L S A V L A V L F A A L C A - - - - - - - I T S - GMS L P T G S MK E S - - - E L T G S D E T A L D P E A R A S W L E T R D I D D S - - - F K D L V L L T L Q E L A N E G E E ME I R L T L V L A L L V A A L G V - - - - - - - V A N - A L S I P S D A L - - - - K D NQMD V A D K DG DQ S R R A T W L E T R D L E D D - - - F K E L V Y L T I E E L V N E G R - - - MN A K L C L A Y I V A S V L V - - - - - - - L G K - S F A L P P N - - - - - - - - V K A V E P S E A I DMD R R A T W L D T R N L E E N - - - F K E L V Y L S I Q E L V S E G K L Q K WE NQ R H V G H S F Q S Q H L R R R R R R R H D N L L L S H S V E E T - - - - - - N N E S S N L G V T D E E T R A T W L E T R N L E N N - - - F K E L V Y L S L Q E L V A E N R - M L A T H S N L N I F V V V V V V V - - - - - - - MT T F C S A I P S K K L - - - - - - N N E S S N L G V T D E E T R A T W L E T R N L E N N - - - F K E L V Y L S L Q E L V A E N R L L T K N I MD S R L L A F V S V C L - - - - - F L L T S P V F S A P A A D P - - - - - - K P H L E Q S K D L P I S K R P K Y MD T R E P Q D I - - - F K D L V F L T L QQ L V S DG K Y Q D K N I MD S R L L A F V S V C L - - - - - F L L T S P V F S A P A A D P - - - - - - K P H L E Q S K D L P I S K R P K Y MD T R D P Q D I - - - F K D L V Y L T L QQ L V S DG K - - - ME MR S S T I L S L L V V L L - - - - - - - L A A P T F C L P P D - - - - - - - - - - - - QG S E I D D L D K R P K Y MD T R E E L S V - - - L K DMV Y I V L Q E L A E DG K - - - MD H H Y S V L L I V L G S F I - - - - - - - WA N L V T C L P T R T A - - - - - - D D I L Q D S S G L V L D K R P K Y MD T R R D L D V - - - F K D L V L MS I Q E L V D E G R - - - ME L P T Y H I F A L F V A A V - - - - - - - A L S V V T G S P T R T - - - - - - - D E V L Q E A S G L A L D K R P K Y MD T R R DMD V - - - F K D L V L MS I Q E L V D E E R - - - ME L Q A C N I F A L F V V V V - - - - - - - T L S V A S S L P A S R T - - - - - - D D V L Q E A S G L A L N K R P K Y MD T R R D L D V - - - F K D L V L I S I Q E L V D E N R

Platynereis_whitnin-1 Platynereis_whitnin-2 Alvinella_GO113425 Lanice_FR763492 Capitella_EY639995 Lumbricus_CF416326 Hirudo_FP646475 Hirudo_AAB40925 Sepia_FO198353 Idiosepius_DB918657 Lottia_FC624310 Tritonia_EV289015 Lymnaea_AF129397 Aplysia_NP_001191586

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I -

Multiple sequence alignment of Platynereis whitnin with annelid and mollusk whitnin/SPTR pNPs.

Platynereis pNPs belonging to lophotrochozoan pNPs families:

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Platynereis_PlectoxinVI-like - - MR W - - - Crassostrea_FP002705 - - MT Y - - - Aplysia_GD218738 - - MS W - - - Haliotis_GT275645 MK K S WWK V S Lottia_FC753680 - - - - - - - - Platynereis_PlectoxinVI-like Crassostrea_FP002705 Aplysia_GD218738 Haliotis_GT275645 Lottia_FC753680

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Multiple sequence alignment of annelid and mollusk CCWamide pNPs.

Multiple sequence alignment of annelid and mollusk QSGamide pNPs.

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